Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G092300.1
Synonym Sb04g007540
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XY20
Pfam -
Panther DB PTHR33120 PTHR33120:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g12480.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G117801 - -
3 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
4 Sobic.008G091900 - -
5 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G062300 expressed protein -
9 Sobic.005G212600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
10 Sobic.007G168800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
11 Sobic.008G036500 - -
12 Sobic.010G144000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
13 Sobic.002G056100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
14 Sobic.005G221425 - -
15 Sobic.003G031750 - -
16 Sobic.007G115000 - -
17 Sobic.002G410200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.007G059300 - -
19 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
20 Sobic.005G142200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic004G092300--Sobic002G221200 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic004G092300--Sobic005G117801 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic004G092300--Sobic001G305400 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic004G092300--Sobic008G091900 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic004G092300--Sobic001G253100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic004G092300--Sobic001G240400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic004G092300--Sobic009G209800 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic004G092300--Sobic002G062300 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic004G092300--Sobic005G212600 Sobic002G221200--Sobic001G305400 Sobic002G221200--Sobic008G091900 Sobic002G221200--Sobic001G240400 Sobic002G221200--Sobic005G117801 Sobic002G221200--Sobic001G253100 Sobic002G221200--Sobic009G209800 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic002G221200--Sobic008G036500 Sobic002G221200--Sobic002G062300 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic002G221200--Sobic003G031750 Sobic005G117801--Sobic001G253100 Sobic005G117801--Sobic008G091900 Sobic005G117801--Sobic009G209800 Sobic005G117801--Sobic001G240400 Sobic005G117801--Sobic002G221200 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G117801--Sobic008G049701 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic005G117801--Sobic005G110430 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic005G117801--Sobic008G042250 SobicK009900 SobicK009900 Sobic005G117801--SobicK009900 Sobic001G305400--Sobic002G221200 Sobic001G305400--Sobic008G091900 Sobic001G305400--Sobic001G240400 Sobic001G305400--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic001G305400--Sobic002G056100 Sobic001G305400--Sobic009G209800 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic001G305400--Sobic005G142200 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic001G305400--Sobic002G060500 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic001G305400--Sobic001G261480 Sobic008G091900--Sobic005G117801 Sobic008G091900--Sobic002G221200 Sobic008G091900--Sobic001G253100 Sobic008G091900--Sobic001G305400 Sobic008G091900--Sobic003G031750 Sobic008G091900--Sobic001G240400 Sobic008G091900--Sobic002G062300 Sobic008G091900--Sobic005G110430 Sobic008G091900--Sobic005G212600 Sobic001G253100--Sobic005G117801 Sobic001G253100--Sobic009G209800 Sobic001G253100--Sobic005G110430 Sobic001G253100--Sobic008G042250 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic004G076732 Sobic001G253100--Sobic001G240400 Sobic001G253100--Sobic008G091900 Sobic001G253100--Sobic008G049701 Sobic001G253100--SobicK009900 Sobic001G240400--Sobic009G209800 Sobic001G240400--Sobic002G221200 Sobic001G240400--Sobic001G253100 Sobic001G240400--Sobic005G117801 Sobic001G240400--Sobic002G056100 Sobic001G240400--Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G049701 Sobic001G240400--Sobic001G305400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic001G240400--Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic009G209800--Sobic002G410200 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic002G062300--Sobic009G113600 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic002G062300--Sobic007G059300 SobicK024000 SobicK024000 Sobic002G062300--SobicK024000 Sobic002G062300--Sobic005G212600 Sobic002G062300--Sobic003G031750 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic002G062300--Sobic008G009500 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic002G062300--Sobic008G108900 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic002G062300--Sobic009G196700 Sobic002G062300--Sobic001G253100 Sobic005G212600--Sobic002G062300 Sobic005G212600--Sobic001G253100 Sobic005G212600--Sobic009G113600 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic005G212600--Sobic006G132200 Sobic005G212600--Sobic008G108900 Sobic005G212600--Sobic008G091900 Sobic005G212600--Sobic002G221200 Sobic005G212600--Sobic008G009500 Sobic005G212600--SobicK024000
Octagon: transcription factors


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