Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G128800.1
Synonym
Functional annotation RNA-binding zinc finger protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QIQ7
Pfam PF00642
Panther DB PTHR24009 PTHR24009:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G12440 : CCCH-type zinc fingerfamily protein with RNA-binding domain
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g48410.2 : RNA-binding zinc finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049183 , Zm00025a002302
Brachypodium KQK21862 , KQK21863 , PNT77483
Barley -
Wheat TraesCS2D02G101800 , TraesCS2D02G101800 , TraesCS2D02G101800 , TraesCS2D02G101800 , TraesCS2D02G101800 , TraesCS2A02G102300 , TraesCS2A02G102300 , TraesCS2A02G102300 , TraesCS2A02G102300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic001G128800--Sobic008G042250 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic001G128800--Sobic001G287301 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic001G128800--Sobic009G209800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic001G128800--Sobic008G049701 SobicK024000 SobicK024000 Sobic001G128800--SobicK024000 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic001G128800--Sobic005G139800 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic001G128800--Sobic005G110430 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic001G128800--Sobic001G240400 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic001G128800--Sobic002G056100 Sobic008G042250--Sobic005G110430 Sobic008G042250--Sobic008G049701 Sobic008G042250--Sobic001G287301 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic008G042250--Sobic001G253100 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic008G042250--Sobic008G157950 Sobic008G042250--Sobic009G209800 SobicK009900 SobicK009900 Sobic008G042250--SobicK009900 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic008G042250--Sobic005G117801 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic008G042250--Sobic004G164600 Sobic001G287301--Sobic008G049701 Sobic001G287301--Sobic008G042250 Sobic001G287301--Sobic005G139800 Sobic001G287301--Sobic005G110430 Sobic001G287301--Sobic009G209800 Sobic001G287301--SobicK009900 Sobic001G287301--Sobic008G157950 Sobic001G287301--Sobic001G253100 Sobic001G287301--Sobic001G128800 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic009G209800--Sobic002G410200 Sobic008G049701--Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic008G042250 Sobic008G049701--Sobic009G209800 Sobic008G049701--Sobic005G110430 Sobic008G049701--Sobic005G139800 Sobic008G049701--Sobic001G253100 Sobic008G049701--Sobic005G117801 Sobic008G049701--SobicK009900 Sobic008G049701--Sobic001G240400 Sobic008G009500 Sobic008G009500 SobicK024000--Sobic008G009500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 SobicK024000--Sobic009G113600 Sobic002G062300 Sobic002G062300 SobicK024000--Sobic002G062300 Sobic007G059300 Sobic007G059300 SobicK024000--Sobic007G059300 SobicK024000--Sobic009G209800 Sobic003G031750 Sobic003G031750 SobicK024000--Sobic003G031750 SobicK024000--Sobic001G253100 Sobic008G079100 Sobic008G079100 SobicK024000--Sobic008G079100 Sobic002G221200 Sobic002G221200 SobicK024000--Sobic002G221200 Sobic005G139800--Sobic008G049701 Sobic005G139800--Sobic009G209800 Sobic005G139800--Sobic001G287301 Sobic005G139800--Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic001G240400 Sobic005G139800--Sobic005G117801 Sobic005G139800--Sobic002G056100 Sobic005G139800--Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic005G221425 Sobic005G110430--Sobic008G042250 Sobic005G110430--Sobic008G049701 Sobic005G110430--Sobic001G253100 Sobic005G110430--Sobic008G157950 Sobic005G110430--SobicK009900 Sobic005G110430--Sobic001G287301 Sobic005G110430--Sobic004G164600 Sobic005G110430--Sobic005G117801 Sobic005G110430--Sobic009G209800 Sobic001G240400--Sobic009G209800 Sobic001G240400--Sobic002G221200 Sobic001G240400--Sobic001G253100 Sobic001G240400--Sobic005G117801 Sobic001G240400--Sobic002G056100 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G049701 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic005G221425 Sobic002G056100--Sobic009G209800 Sobic002G056100--Sobic001G240400 Sobic002G056100--Sobic008G049701 Sobic002G056100--Sobic001G253100 Sobic002G056100--Sobic005G117801 Sobic002G056100--Sobic001G305400 Sobic002G056100--Sobic008G042250 Sobic002G056100--Sobic005G221425 Sobic002G056100--Sobic002G221200
Octagon: transcription factors


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