Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110427.2,Sobic.005G110427.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJ22 , A0A1Z5RI54
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G262200 - -
2 Sobic.001G267233 - -
3 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
4 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.008G049701 - -
6 Sobic.002G056100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
7 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G221425 - -
10 Sobic.005G117801 - -
11 Sobic.001G287301 - -
12 Sobic.005G055150 - -
13 Sobic.008G042250 - -
14 Sobic.001G128800 RNA-binding zinc finger protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
16 Sobic.003G031750 - -
17 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G036500 - -
19 Sobic.010G263800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@uncharacterized protein(PubMedID : 28640841)@UPF0183 protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G110430 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic006G262200--Sobic005G110427 Sobic006G262200--Sobic006G009400 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G262200--Sobic002G051450 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic006G262200--Sobic001G111900 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic002G144966 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G262200--Sobic005G055150 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic006G262200--Sobic001G454401 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic004G005400 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic006G262200--Sobic005G141801 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic001G267233--Sobic005G117801 Sobic001G267233--Sobic005G110427 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic001G267233--Sobic005G110430 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic001G267233--Sobic001G253100 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G267233--Sobic008G091900 Sobic001G267233--Sobic002G056100 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic001G267233--Sobic008G042250 Sobic001G267233--Sobic008G049701 Sobic001G267233--Sobic001G240400 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic009G209800--Sobic002G410200 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic001G287301 Sobic008G049701--Sobic008G042250 Sobic008G049701--Sobic009G209800 Sobic008G049701--Sobic005G110430 Sobic008G049701--Sobic005G139800 Sobic008G049701--Sobic001G253100 Sobic008G049701--Sobic005G117801 SobicK009900 SobicK009900 Sobic008G049701--SobicK009900 Sobic008G049701--Sobic001G240400 Sobic002G056100--Sobic009G209800 Sobic002G056100--Sobic001G240400 Sobic002G056100--Sobic008G049701 Sobic002G056100--Sobic001G253100 Sobic002G056100--Sobic005G117801 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic002G056100--Sobic001G305400 Sobic002G056100--Sobic008G042250 Sobic002G056100--Sobic005G221425 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic002G056100--Sobic002G221200 Sobic001G240400--Sobic009G209800 Sobic001G240400--Sobic002G221200 Sobic001G240400--Sobic001G253100 Sobic001G240400--Sobic005G117801 Sobic001G240400--Sobic002G056100 Sobic001G240400--Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G049701 Sobic001G240400--Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic005G221425 Sobic005G139800--Sobic008G049701 Sobic005G139800--Sobic009G209800 Sobic005G139800--Sobic001G287301 Sobic005G139800--Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic001G240400 Sobic005G139800--Sobic005G117801 Sobic005G139800--Sobic002G056100 Sobic005G139800--Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic005G221425 Sobic005G221425--Sobic009G209800 Sobic005G221425--Sobic001G240400 Sobic005G221425--Sobic001G253100 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic005G221425--Sobic008G009500 Sobic005G221425--Sobic008G049701 Sobic005G221425--Sobic002G056100 SobicK024000 SobicK024000 Sobic005G221425--SobicK024000 Sobic005G221425--Sobic005G139800 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic005G221425--Sobic004G076732
Octagon: transcription factors


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