Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G009400.2
Synonym
Functional annotation G-patch domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RBI2
Pfam PF01585
Panther DB PTHR17614 PTHR17614:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003676; nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G26610 : D111/G-patch domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g02500.2 : G-patch domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012215
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G000590.3 , HORVU2Hr1G000590.4
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G263800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@uncharacterized protein(PubMedID : 28640841)@UPF0183 protein, putative, expressed -
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14 Sobic.009G127900 - -
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17 Sobic.001G454401 - -
18 Sobic.002G051450 - -
19 Sobic.001G094000 expressed protein -
20 Sobic.002G077200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic010G263800--Sobic006G009400 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic010G263800--Sobic007G011400 Sobic002G077200 Sobic002G077200 Sobic010G263800--Sobic002G077200 Sobic010G263800--Sobic002G313300 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic010G263800--Sobic002G157300 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic010G263800--Sobic007G205800 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic010G263800--Sobic009G117400 Sobic001G347600 Sobic001G347600 Sobic010G263800--Sobic001G347600 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic010G263800--Sobic008G034600 Sobic005G055150--Sobic006G009400 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic005G055150--Sobic005G141801 Sobic005G055150--Sobic005G110427 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic005G055150--Sobic001G111900 Sobic005G055150--Sobic006G262200 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic005G055150--Sobic009G127900 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic005G055150--Sobic002G410200 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G055150--Sobic009G209800 Sobic005G055150--Sobic007G178700 Sobic002G313300--Sobic001G477800 Sobic002G313300--Sobic002G077200 Sobic002G313300--Sobic007G011400 Sobic002G313300--Sobic010G263800 Sobic002G313300--Sobic001G543900 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic002G313300--Sobic006G080300 Sobic002G313300--Sobic006G009400 Sobic007G185900 Sobic007G185900 Sobic002G313300--Sobic007G185900 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic002G313300--Sobic004G031700 Sobic001G543900--Sobic001G477800 Sobic001G543900--Sobic002G313300 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic001G543900--Sobic004G112500 Sobic002G001600 Sobic002G001600 Sobic001G543900--Sobic002G001600 Sobic001G543900--Sobic006G009400 Sobic002G166700 Sobic002G166700 Sobic001G543900--Sobic002G166700 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic001G543900--Sobic005G130200 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic001G543900--Sobic001G272000 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic001G543900--Sobic010G248200 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic001G477800--Sobic002G313300 Sobic001G477800--Sobic004G031700 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic001G477800--Sobic001G094000 Sobic001G544200 Sobic001G544200 Sobic001G477800--Sobic001G544200 Sobic001G477800--Sobic001G543900 Sobic001G477800--Sobic006G080300 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic001G477800--Sobic009G040700 Sobic001G477800--Sobic007G011400 Sobic001G477800--Sobic006G009400 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic007G073400--Sobic004G212800 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic007G073400--Sobic004G164600 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G073400--Sobic004G076732 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic007G073400--Sobic008G009500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic007G073400--Sobic009G113600 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic007G073400--Sobic008G031350 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic007G073400--Sobic008G042250 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic007G073400--Sobic005G110430 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G073400--Sobic004G143700 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic006G262200--Sobic005G110427 Sobic006G262200--Sobic006G009400 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G262200--Sobic002G051450 Sobic006G262200--Sobic001G111900 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic005G055150 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic006G262200--Sobic001G454401 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic005G141801
Octagon: transcription factors


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