Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G178700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5YH34
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.007G178700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G127900 - -
2 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G243900 - -
4 Sobic.003G087400 - -
5 Sobic.004G007100 - -
6 Sobic.001G162300 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
7 Sobic.001G446900 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
8 Sobic.005G144400 - -
9 Sobic.001G420200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
10 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
11 Sobic.006G082600 OsFBX133 - F-box domain containing protein, expressed K10295: F-box protein 9
12 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
13 Sobic.003G176500 - -
14 Sobic.007G096600 - -
15 Sobic.001G111900 - -
16 Sobic.001G067850 - -
17 Sobic.005G077466 - -
18 Sobic.004G290800 GRAS family transcription factor(PubMedID : 23915383)@scarecrow, putative, expressed -
19 Sobic.004G196700 expressed protein -
20 Sobic.002G157000 enhancer of polycomb, putative, expressed K11322: enhancer of polycomb-like protein


Gene co-expression network
sample Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic009G127900--Sobic007G178700 Sobic009G127900--Sobic003G268300 Sobic009G127900--Sobic001G446900 Sobic006G066650 Sobic006G066650 Sobic009G127900--Sobic006G066650 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic009G127900--Sobic004G290800 Sobic010G026400 Sobic010G026400 Sobic009G127900--Sobic010G026400 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic009G127900--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic009G127900--Sobic008G173900 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic009G127900--Sobic001G111900 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic008G173900 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic003G087400--Sobic007G178700 Sobic003G087400--Sobic004G007100 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic003G087400--Sobic009G104201 Sobic003G087400--Sobic006G048500 Sobic003G087400--Sobic009G127900 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G087400--Sobic002G006900 Sobic003G087400--Sobic003G176500 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic003G087400--Sobic010G056000 Sobic001G205200 Sobic001G205200 Sobic003G087400--Sobic001G205200 Sobic004G007100--Sobic006G048500 Sobic004G007100--Sobic002G243900 Sobic004G007100--Sobic005G144400 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic007G178700 Sobic004G007100--Sobic009G104201 Sobic004G007100--Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic002G006900 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic004G007100--Sobic002G180666 Sobic001G162300--Sobic002G157000 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic001G162300--Sobic006G246900 Sobic001G162300--Sobic003G268300 Sobic001G162300--Sobic007G178700 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic001G162300--Sobic006G082600 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic001G162300--Sobic007G011400 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic001G162300--Sobic001G094000 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic001G162300--Sobic003G170100 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic001G162300--Sobic001G477800 Sobic001G446900--Sobic007G178700 Sobic001G446900--Sobic009G127900 Sobic001G446900--Sobic006G082600 Sobic001G446900--Sobic004G290800 Sobic001G446900--Sobic003G268300 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic001G446900--Sobic007G137900 Sobic001G446900--Sobic010G026400 Sobic001G446900--Sobic009G104201 Sobic001G446900--Sobic001G111900 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic007G178700 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic001G420200--Sobic001G274200 Sobic001G420200--Sobic002G157000 Sobic001G420200--Sobic003G268300 Sobic001G420200--Sobic008G173900 Sobic001G420200--Sobic002G248400 Sobic001G420200--Sobic007G096600 Sobic001G420200--Sobic007G037900 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G420200--Sobic002G144933 Sobic001G420200--Sobic007G178700
Octagon: transcription factors


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