Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G096600.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R9I0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G243900 - -
2 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G176500 - -
4 Sobic.001G274200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
5 Sobic.003G200200 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
6 Sobic.005G144400 - -
7 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
8 Sobic.003G332800 GTPase-activating protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G420200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
10 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
11 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G110472 - -
13 Sobic.003G170100 - -
14 Sobic.001G133466 - -
15 Sobic.002G248400 ENT domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G167500 expressed protein -
17 Sobic.010G136600 - -
18 Sobic.006G048500 - -
19 Sobic.001G214300 expressed protein -
20 Sobic.007G178700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G096600--Sobic002G243900 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic007G096600--Sobic003G268300 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic007G096600--Sobic003G176500 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic007G096600--Sobic001G274200 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic007G096600--Sobic003G200200 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G096600--Sobic005G144400 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic007G096600--Sobic003G148000 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic003G332800 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G096600--Sobic001G420200 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic003G268300--Sobic008G173900 Sobic003G176500--Sobic007G096600 Sobic003G176500--Sobic002G243900 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G176500--Sobic002G006900 Sobic003G176500--Sobic005G144400 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic003G176500--Sobic001G214300 Sobic003G176500--Sobic003G200200 Sobic003G176500--Sobic007G178700 Sobic003G176500--Sobic003G148000 Sobic003G176500--Sobic003G268300 Sobic001G274200--Sobic001G420200 Sobic001G274200--Sobic007G096600 Sobic001G274200--Sobic003G268300 Sobic001G274200--Sobic008G173900 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G274200--Sobic002G144933 Sobic001G133466 Sobic001G133466 Sobic001G274200--Sobic001G133466 Sobic001G274200--Sobic007G037900 Sobic001G274200--Sobic002G243900 Sobic010G123901 Sobic010G123901 Sobic001G274200--Sobic010G123901 Sobic003G200200--Sobic002G157000 Sobic003G200200--Sobic002G006900 Sobic003G200200--Sobic003G268300 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic003G200200--Sobic001G251700 Sobic003G200200--Sobic007G096600 Sobic003G200200--Sobic002G248400 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic003G200200--Sobic001G155000 Sobic003G200200--Sobic008G173900 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic003G200200--Sobic003G170100 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic007G178700 Sobic003G148000--Sobic005G144400 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic003G148000--Sobic002G180666 Sobic003G148000--Sobic002G145101 Sobic003G148000--Sobic006G048500 Sobic003G148000--Sobic002G243900 Sobic003G148000--Sobic001G214300 Sobic003G148000--Sobic007G096600 Sobic003G148000--Sobic003G429650 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic003G148000--Sobic004G258700 Sobic003G332800--Sobic007G096600 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic003G332800--Sobic006G216800 Sobic003G332800--Sobic003G148000 Sobic003G332800--Sobic002G006900 Sobic007G167500 Sobic007G167500 Sobic003G332800--Sobic007G167500 Sobic009G209300 Sobic009G209300 Sobic003G332800--Sobic009G209300 Sobic003G332800--Sobic002G243900 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic003G332800--Sobic007G065400 Sobic003G332800--Sobic003G176500 Sobic001G420200--Sobic001G274200 Sobic001G420200--Sobic002G157000 Sobic001G420200--Sobic003G268300 Sobic001G420200--Sobic008G173900 Sobic001G420200--Sobic002G248400 Sobic001G420200--Sobic007G096600 Sobic001G420200--Sobic007G037900 Sobic001G420200--Sobic002G144933 Sobic001G420200--Sobic007G178700
Octagon: transcription factors


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