Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G148000.3
Synonym Sb03g012810
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt C5XIT4
Pfam PF13920
Panther DB PTHR12313 PTHR12313:SF16
NCBI CDD KOG4172; Predicted E3 ubiquitin ligase
KEGG Orthology K10666; E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G58030 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g06510.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036085 , Zm00025a024328
Brachypodium KQJ95279 , KQJ95280
Barley HORVU7Hr1G066380.2 , HORVU7Hr1G066380.3 , HORVU7Hr1G066380.1 , HORVU7Hr1G066380.4
Wheat TraesCS7A02G296500 , TraesCS7B02G189000 , TraesCS7D02G293200
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.007G065400 expressed protein K14400: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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