Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G145101.1,Sobic.002G145101.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W421 , A0A1W0W3Z1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
2 Sobic.006G048500 - -
3 Sobic.002G180666 - -
4 Sobic.002G243900 - -
5 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G007100 - -
7 Sobic.006G079400 - -
8 Sobic.006G032500 - -
9 Sobic.005G144400 - -
10 Sobic.001G347300 splicing factor, arginine/serine-rich 16, putative, expressed K13168: splicing factor, arginine/serine-rich 16
11 Sobic.007G096600 - -
12 Sobic.003G170100 - -
13 Sobic.002G191800 - -
14 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G332800 GTPase-activating protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G429650 - -
17 Sobic.001G456900 expressed protein -
18 Sobic.007G065400 expressed protein K14400: pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11
19 Sobic.008G084700 - -
20 Sobic.004G258700 PHD-finger family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic002G145101--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G145101--Sobic006G048500 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic002G145101--Sobic002G180666 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic002G145101--Sobic002G243900 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic002G145101--Sobic008G028700 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G145101--Sobic004G007100 Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic002G145101--Sobic006G079400 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic002G145101--Sobic006G032500 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic002G145101--Sobic005G144400 Sobic003G148000--Sobic005G144400 Sobic003G148000--Sobic002G180666 Sobic003G148000--Sobic002G145101 Sobic003G148000--Sobic006G048500 Sobic003G148000--Sobic002G243900 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic003G148000--Sobic001G214300 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G148000--Sobic007G096600 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic003G148000--Sobic003G429650 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic003G148000--Sobic004G258700 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic002G180666--Sobic003G148000 Sobic002G180666--Sobic006G032500 Sobic002G180666--Sobic002G145101 Sobic002G180666--Sobic006G048500 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic002G180666--Sobic002G343901 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic002G180666--Sobic003G372700 Sobic002G180666--Sobic004G007100 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic002G180666--Sobic007G161300 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic002G180666--Sobic001G456900 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic008G028700--Sobic010G279450 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic008G028700--Sobic009G040600 Sobic004G009600 Sobic004G009600 Sobic008G028700--Sobic004G009600 Sobic008G028700--Sobic004G258700 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic008G028700--Sobic007G065400 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic008G028700--Sobic010G139000 Sobic008G028700--Sobic002G006900 Sobic008G028700--Sobic002G145101 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic008G028700--Sobic008G113100 Sobic004G007100--Sobic006G048500 Sobic004G007100--Sobic002G243900 Sobic004G007100--Sobic005G144400 Sobic004G007100--Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic007G178700 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic004G007100--Sobic009G104201 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic002G006900 Sobic004G007100--Sobic002G180666 Sobic006G079400--Sobic002G145101 Sobic006G079400--Sobic003G148000 Sobic006G079400--Sobic003G429650 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic006G079400--Sobic007G113800 Sobic006G079400--Sobic004G258700 Sobic006G079400--Sobic002G243900 Sobic006G079400--Sobic006G048500 Sobic006G079400--Sobic008G028700 Sobic006G079400--Sobic002G180666 Sobic006G032500--Sobic002G180666 Sobic006G032500--Sobic003G372700 Sobic006G032500--Sobic003G148000 Sobic003G059750 Sobic003G059750 Sobic006G032500--Sobic003G059750 Sobic006G032500--Sobic002G145101 Sobic006G032500--Sobic007G161300 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic006G032500--Sobic005G112300 Sobic006G032500--Sobic010G139000 Sobic008G084700 Sobic008G084700 Sobic006G032500--Sobic008G084700 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic007G178700
Octagon: transcription factors


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