Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G079400.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PKW9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G145101 - -
2 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
3 Sobic.003G429650 - -
4 Sobic.007G113800 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
5 Sobic.004G258700 PHD-finger family protein, expressed -
6 Sobic.002G243900 - -
7 Sobic.006G048500 - -
8 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G180666 - -
10 Sobic.001G456900 expressed protein -
11 Sobic.005G144400 - -
12 Sobic.006G182900 expressed protein -
13 Sobic.009G209300 starch synthase, putative, expressed -
14 Sobic.010G277500 expressed protein -
15 Sobic.006G216800 AAA family ATPase, putative, expressed K13339: PEX6, peroxin-6
16 Sobic.003G332800 GTPase-activating protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G035900 expressed protein K13156: U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein
18 Sobic.003G179201 - -
19 Sobic.006G032500 - -
20 Sobic.004G096600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic006G079400--Sobic002G145101 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic006G079400--Sobic003G148000 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic006G079400--Sobic003G429650 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic006G079400--Sobic007G113800 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic006G079400--Sobic004G258700 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic006G079400--Sobic002G243900 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic006G079400--Sobic006G048500 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic006G079400--Sobic008G028700 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic006G079400--Sobic002G180666 Sobic002G145101--Sobic003G148000 Sobic002G145101--Sobic006G048500 Sobic002G145101--Sobic002G180666 Sobic002G145101--Sobic002G243900 Sobic002G145101--Sobic008G028700 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G145101--Sobic004G007100 Sobic002G145101--Sobic006G079400 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic002G145101--Sobic006G032500 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic002G145101--Sobic005G144400 Sobic003G148000--Sobic005G144400 Sobic003G148000--Sobic002G180666 Sobic003G148000--Sobic002G145101 Sobic003G148000--Sobic006G048500 Sobic003G148000--Sobic002G243900 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic003G148000--Sobic001G214300 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G148000--Sobic007G096600 Sobic003G148000--Sobic003G429650 Sobic003G148000--Sobic004G258700 Sobic003G429650--Sobic006G048500 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic003G429650--Sobic006G182900 Sobic003G429650--Sobic003G148000 Sobic003G429650--Sobic005G144400 Sobic003G179201 Sobic003G179201 Sobic003G429650--Sobic003G179201 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic003G429650--Sobic001G287201 Sobic003G429650--Sobic002G243900 Sobic003G429650--Sobic001G214300 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G429650--Sobic002G006900 Sobic007G113800--Sobic003G148000 Sobic007G113800--Sobic006G079400 Sobic005G110472 Sobic005G110472 Sobic007G113800--Sobic005G110472 Sobic010G202000 Sobic010G202000 Sobic007G113800--Sobic010G202000 Sobic007G113800--Sobic005G144400 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic007G113800--Sobic001G067850 Sobic007G113800--Sobic002G243900 Sobic007G113800--Sobic006G048500 Sobic007G113800--Sobic003G179201 Sobic008G113100 Sobic008G113100 Sobic004G258700--Sobic008G113100 Sobic004G258700--Sobic008G028700 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic004G258700--Sobic001G456900 Sobic004G258700--Sobic003G148000 Sobic003G101500 Sobic003G101500 Sobic004G258700--Sobic003G101500 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic004G258700--Sobic010G277500 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic004G258700--Sobic007G065400 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic004G258700--Sobic007G161000 Sobic009G040600 Sobic009G040600 Sobic004G258700--Sobic009G040600 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic008G028700--Sobic010G279450 Sobic008G028700--Sobic009G040600 Sobic004G009600 Sobic004G009600 Sobic008G028700--Sobic004G009600 Sobic008G028700--Sobic004G258700 Sobic008G028700--Sobic007G065400 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic008G028700--Sobic010G139000 Sobic008G028700--Sobic002G006900 Sobic008G028700--Sobic002G145101 Sobic008G028700--Sobic008G113100 Sobic002G180666--Sobic003G148000 Sobic002G180666--Sobic006G032500 Sobic002G180666--Sobic002G145101 Sobic002G180666--Sobic006G048500 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic002G180666--Sobic002G343901 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic002G180666--Sobic003G372700 Sobic002G180666--Sobic004G007100 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic002G180666--Sobic007G161300 Sobic002G180666--Sobic001G456900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.