Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G243900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QD98
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.002G243900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G096600 - -
2 Sobic.004G007100 - -
3 Sobic.005G144400 - -
4 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
5 Sobic.006G048500 - -
6 Sobic.007G178700 - -
7 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G145101 - -
9 Sobic.003G176500 - -
10 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G214300 expressed protein -
12 Sobic.001G274200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
13 Sobic.003G200200 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
14 Sobic.001G420200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
15 Sobic.002G180666 - -
16 Sobic.001G067850 - -
17 Sobic.009G104201 - -
18 Sobic.003G332800 GTPase-activating protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G429650 - -
20 Sobic.005G110472 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic007G096600--Sobic002G243900 Sobic007G096600--Sobic003G268300 Sobic007G096600--Sobic003G176500 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic007G096600--Sobic001G274200 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic007G096600--Sobic003G200200 Sobic007G096600--Sobic005G144400 Sobic007G096600--Sobic003G148000 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic003G332800 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G096600--Sobic001G420200 Sobic004G007100--Sobic006G048500 Sobic004G007100--Sobic002G243900 Sobic004G007100--Sobic005G144400 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic006G048600 Sobic004G007100--Sobic007G178700 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic004G007100--Sobic009G104201 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic004G007100--Sobic003G087400 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic004G007100--Sobic002G006900 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic004G007100--Sobic002G180666 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic005G144400--Sobic007G178700 Sobic003G148000--Sobic005G144400 Sobic003G148000--Sobic002G180666 Sobic003G148000--Sobic002G145101 Sobic003G148000--Sobic006G048500 Sobic003G148000--Sobic002G243900 Sobic003G148000--Sobic001G214300 Sobic003G148000--Sobic007G096600 Sobic003G148000--Sobic003G429650 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic003G148000--Sobic004G258700 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic003G268300--Sobic008G173900 Sobic002G145101--Sobic003G148000 Sobic002G145101--Sobic006G048500 Sobic002G145101--Sobic002G180666 Sobic002G145101--Sobic002G243900 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic002G145101--Sobic008G028700 Sobic002G145101--Sobic004G007100 Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic002G145101--Sobic006G079400 Sobic006G032500 Sobic006G032500 Sobic002G145101--Sobic006G032500 Sobic002G145101--Sobic005G144400 Sobic003G176500--Sobic007G096600 Sobic003G176500--Sobic002G243900 Sobic003G176500--Sobic002G006900 Sobic003G176500--Sobic005G144400 Sobic003G176500--Sobic001G214300 Sobic003G176500--Sobic003G200200 Sobic003G176500--Sobic007G178700 Sobic003G176500--Sobic003G148000 Sobic003G176500--Sobic003G268300
Octagon: transcription factors


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