Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G110472.5,Sobic.005G110472.3,Sobic.005G110472.2,Sobic.005G110472.1,Sobic.005G110472.4,Sobic.005G110472.8,Sobic.005G110472.11,Sobic.005G110472.7,Sobic.005G110472.6,Sobic.005G110472.10,Sobic.005G110472.9
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109NDR2 , A0A1Z5RHX9 , A0A1Z5RI05 , A0A1Z5RJ49 , A0A1Z5RI74
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G170100 - -
2 Sobic.007G096600 - -
3 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G390400 expressed protein -
5 Sobic.002G243900 - -
6 Sobic.003G200200 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
7 Sobic.007G113800 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
8 Sobic.007G137900 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K01510: ENTPD1_3_8, apyrase
9 Sobic.003G176500 - -
10 Sobic.003G332800 GTPase-activating protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G251700 OsPP2Ac-4 - Phosphatase 2A isoform 4 belonging to family 2, expressed K04382: serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit
12 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G157000 enhancer of polycomb, putative, expressed K11322: enhancer of polycomb-like protein
14 Sobic.001G162300 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
15 Sobic.002G380500 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@RNA recognition motif containing protein, expressed K12891: splicing factor, arginine/serine-rich 2
16 Sobic.001G067850 - -
17 Sobic.007G178700 - -
18 Sobic.005G144400 - -
19 Sobic.003G174475 - -
20 Sobic.001G152320 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G110472 Sobic005G110472 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic005G110472--Sobic003G170100 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic005G110472--Sobic007G096600 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic005G110472--Sobic003G268300 Sobic003G390400 Sobic003G390400 Sobic005G110472--Sobic003G390400 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic005G110472--Sobic002G243900 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic005G110472--Sobic003G200200 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic005G110472--Sobic007G113800 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic005G110472--Sobic007G137900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic005G110472--Sobic003G176500 Sobic003G170100--Sobic005G110472 Sobic003G170100--Sobic003G268300 Sobic003G170100--Sobic003G200200 Sobic003G170100--Sobic007G096600 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic003G170100--Sobic002G144933 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G170100--Sobic002G157000 Sobic001G152320 Sobic001G152320 Sobic003G170100--Sobic001G152320 Sobic003G170100--Sobic007G137900 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic003G170100--Sobic001G162300 Sobic007G096600--Sobic002G243900 Sobic007G096600--Sobic003G268300 Sobic007G096600--Sobic003G176500 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic007G096600--Sobic001G274200 Sobic007G096600--Sobic003G200200 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G096600--Sobic005G144400 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic007G096600--Sobic003G148000 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic003G332800 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G096600--Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic003G268300--Sobic008G173900 Sobic003G390400--Sobic005G110472 Sobic003G390400--Sobic003G170100 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic003G390400--Sobic010G129200 Sobic003G390400--Sobic007G137900 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic003G390400--Sobic001G251700 Sobic003G390400--Sobic002G157000 Sobic008G192500 Sobic008G192500 Sobic003G390400--Sobic008G192500 Sobic003G390400--Sobic002G144933 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic003G390400--Sobic001G407200 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic003G200200--Sobic002G157000 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G200200--Sobic002G006900 Sobic003G200200--Sobic003G268300 Sobic003G200200--Sobic001G251700 Sobic003G200200--Sobic007G096600 Sobic003G200200--Sobic002G248400 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic003G200200--Sobic001G155000 Sobic003G200200--Sobic008G173900 Sobic003G200200--Sobic003G170100 Sobic007G113800--Sobic003G148000 Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic007G113800--Sobic006G079400 Sobic007G113800--Sobic005G110472 Sobic010G202000 Sobic010G202000 Sobic007G113800--Sobic010G202000 Sobic007G113800--Sobic005G144400 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic007G113800--Sobic001G067850 Sobic007G113800--Sobic002G243900 Sobic007G113800--Sobic006G048500 Sobic003G179201 Sobic003G179201 Sobic007G113800--Sobic003G179201 Sobic007G137900--Sobic001G251700 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic007G137900--Sobic002G157300 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic007G137900--Sobic004G196700 Sobic007G137900--Sobic003G200200 Sobic007G137900--Sobic003G170100 Sobic004G349900 Sobic004G349900 Sobic007G137900--Sobic004G349900 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic007G137900--Sobic005G149500 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic007G137900--Sobic007G011400 Sobic007G137900--Sobic002G157000 Sobic003G176500--Sobic007G096600 Sobic003G176500--Sobic002G243900 Sobic003G176500--Sobic002G006900 Sobic003G176500--Sobic005G144400 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic003G176500--Sobic001G214300 Sobic003G176500--Sobic003G200200 Sobic003G176500--Sobic007G178700 Sobic003G176500--Sobic003G148000 Sobic003G176500--Sobic003G268300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.