Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G170100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q3R3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110472 - -
2 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G200200 SIT4 phosphatase-associated protein domain containing protein, expressed K15501: PPP6R3, serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3
4 Sobic.007G096600 - -
5 Sobic.002G144933 - -
6 Sobic.002G157000 enhancer of polycomb, putative, expressed K11322: enhancer of polycomb-like protein
7 Sobic.001G152320 - -
8 Sobic.007G137900 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K01510: ENTPD1_3_8, apyrase
9 Sobic.001G162300 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
10 Sobic.010G202000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -
12 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
13 Sobic.001G257300 OsFBL52 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
14 Sobic.001G094000 expressed protein -
15 Sobic.002G248400 ENT domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G380500 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@RNA recognition motif containing protein, expressed K12891: splicing factor, arginine/serine-rich 2
17 Sobic.002G145101 - -
18 Sobic.009G104300 - -
19 Sobic.003G390400 expressed protein -
20 Sobic.010G136600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic005G110472 Sobic005G110472 Sobic003G170100--Sobic005G110472 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic003G170100--Sobic003G268300 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic003G170100--Sobic003G200200 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G170100--Sobic007G096600 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic003G170100--Sobic002G144933 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic003G170100--Sobic002G157000 Sobic001G152320 Sobic001G152320 Sobic003G170100--Sobic001G152320 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic003G170100--Sobic007G137900 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic003G170100--Sobic001G162300 Sobic005G110472--Sobic003G170100 Sobic005G110472--Sobic007G096600 Sobic005G110472--Sobic003G268300 Sobic003G390400 Sobic003G390400 Sobic005G110472--Sobic003G390400 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic005G110472--Sobic002G243900 Sobic005G110472--Sobic003G200200 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic005G110472--Sobic007G113800 Sobic005G110472--Sobic007G137900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic005G110472--Sobic003G176500 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic003G268300--Sobic008G173900 Sobic003G200200--Sobic002G157000 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G200200--Sobic002G006900 Sobic003G200200--Sobic003G268300 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic003G200200--Sobic001G251700 Sobic003G200200--Sobic007G096600 Sobic003G200200--Sobic002G248400 Sobic001G155000 Sobic001G155000 Sobic003G200200--Sobic001G155000 Sobic003G200200--Sobic008G173900 Sobic003G200200--Sobic003G170100 Sobic007G096600--Sobic002G243900 Sobic007G096600--Sobic003G268300 Sobic007G096600--Sobic003G176500 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic007G096600--Sobic001G274200 Sobic007G096600--Sobic003G200200 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G096600--Sobic005G144400 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic007G096600--Sobic003G148000 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic001G420200 Sobic002G144933--Sobic008G173900 Sobic002G144933--Sobic002G157000 Sobic002G144933--Sobic001G420200 Sobic002G144933--Sobic003G268300 Sobic002G144933--Sobic001G274200 Sobic002G144933--Sobic007G037900 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic002G144933--Sobic004G145500 Sobic002G144933--Sobic003G170100 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic002G144933--Sobic009G065100 Sobic002G157000--Sobic002G248400 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic002G157000--Sobic002G320500 Sobic002G157000--Sobic003G200200 Sobic002G157000--Sobic001G420200 Sobic002G157000--Sobic008G173900 Sobic002G157000--Sobic003G268300 Sobic002G157000--Sobic001G162300 Sobic003G108700 Sobic003G108700 Sobic002G157000--Sobic003G108700 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic002G157000--Sobic001G094000 Sobic001G152320--Sobic003G170100 Sobic001G152320--Sobic007G137900 Sobic009G102500 Sobic009G102500 Sobic001G152320--Sobic009G102500 Sobic001G152320--Sobic007G096600 Sobic001G152320--Sobic005G110472 Sobic001G152320--Sobic003G200200 Sobic001G152320--Sobic001G251700 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic001G152320--Sobic003G084900 Sobic003G205801 Sobic003G205801 Sobic001G152320--Sobic003G205801 Sobic007G137900--Sobic001G251700 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic007G137900--Sobic002G157300 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic007G137900--Sobic004G196700 Sobic007G137900--Sobic003G200200 Sobic007G137900--Sobic003G170100 Sobic004G349900 Sobic004G349900 Sobic007G137900--Sobic004G349900 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic007G137900--Sobic005G149500 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic007G137900--Sobic007G011400 Sobic007G137900--Sobic002G157000 Sobic001G162300--Sobic002G157000 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic001G162300--Sobic006G246900 Sobic001G162300--Sobic003G268300 Sobic001G162300--Sobic007G178700 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic001G162300--Sobic006G082600 Sobic001G162300--Sobic007G011400 Sobic001G162300--Sobic001G094000 Sobic001G162300--Sobic003G170100 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic001G162300--Sobic001G477800
Octagon: transcription factors


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