Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G113800.4,Sobic.007G113800.1,Sobic.007G113800.2
Synonym
Functional annotation early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R999 , A0A1B6PH90
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G32090 : early-responsive to dehydration stress protein (ERD4)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g35050.2,LOC_Os01g35050.1 : early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036820
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
2 Sobic.006G079400 - -
3 Sobic.005G110472 - -
4 Sobic.010G202000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G144400 - -
6 Sobic.001G067850 - -
7 Sobic.002G243900 - -
8 Sobic.006G048500 - -
9 Sobic.003G179201 - -
10 Sobic.002G228700 patatin, putative, expressed -
11 Sobic.003G429650 - -
12 Sobic.002G145101 - -
13 Sobic.003G170100 - -
14 Sobic.002G380500 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@RNA recognition motif containing protein, expressed K12891: splicing factor, arginine/serine-rich 2
15 Sobic.003G332800 GTPase-activating protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G274200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
17 Sobic.003G390400 expressed protein -
18 Sobic.007G096600 - -
19 Sobic.004G258700 PHD-finger family protein, expressed -
20 Sobic.002G180666 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic007G113800--Sobic003G148000 Sobic006G079400 Sobic006G079400 Sobic007G113800--Sobic006G079400 Sobic005G110472 Sobic005G110472 Sobic007G113800--Sobic005G110472 Sobic010G202000 Sobic010G202000 Sobic007G113800--Sobic010G202000 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G113800--Sobic005G144400 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic007G113800--Sobic001G067850 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G113800--Sobic002G243900 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic007G113800--Sobic006G048500 Sobic003G179201 Sobic003G179201 Sobic007G113800--Sobic003G179201 Sobic003G148000--Sobic005G144400 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic003G148000--Sobic002G180666 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic003G148000--Sobic002G145101 Sobic003G148000--Sobic006G048500 Sobic003G148000--Sobic002G243900 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic003G148000--Sobic001G214300 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G148000--Sobic007G096600 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic003G148000--Sobic003G429650 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic003G148000--Sobic004G258700 Sobic006G079400--Sobic002G145101 Sobic006G079400--Sobic003G148000 Sobic006G079400--Sobic003G429650 Sobic006G079400--Sobic007G113800 Sobic006G079400--Sobic004G258700 Sobic006G079400--Sobic002G243900 Sobic006G079400--Sobic006G048500 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic006G079400--Sobic008G028700 Sobic006G079400--Sobic002G180666 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic005G110472--Sobic003G170100 Sobic005G110472--Sobic007G096600 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic005G110472--Sobic003G268300 Sobic003G390400 Sobic003G390400 Sobic005G110472--Sobic003G390400 Sobic005G110472--Sobic002G243900 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic005G110472--Sobic003G200200 Sobic005G110472--Sobic007G113800 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic005G110472--Sobic007G137900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic005G110472--Sobic003G176500 Sobic010G202000--Sobic003G170100 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic010G202000--Sobic002G144933 Sobic010G202000--Sobic003G268300 Sobic010G202000--Sobic007G113800 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic010G202000--Sobic008G173900 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic010G202000--Sobic001G274200 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic010G202000--Sobic007G037900 Sobic010G202000--Sobic007G096600 Sobic010G202000--Sobic005G110472 Sobic005G144400--Sobic006G048500 Sobic005G144400--Sobic003G148000 Sobic005G144400--Sobic002G243900 Sobic005G144400--Sobic007G096600 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic005G144400--Sobic004G007100 Sobic005G144400--Sobic001G214300 Sobic005G144400--Sobic003G176500 Sobic005G144400--Sobic003G429650 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic005G144400--Sobic007G178700 Sobic001G067850--Sobic002G243900 Sobic001G067850--Sobic007G178700 Sobic001G067850--Sobic001G274200 Sobic009G140500 Sobic009G140500 Sobic001G067850--Sobic009G140500 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic001G067850--Sobic001G420200 Sobic001G067850--Sobic005G144400 Sobic001G067850--Sobic007G096600 Sobic001G067850--Sobic007G037900 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic001G067850--Sobic006G088580 Sobic002G243900--Sobic007G096600 Sobic002G243900--Sobic004G007100 Sobic002G243900--Sobic005G144400 Sobic002G243900--Sobic003G148000 Sobic002G243900--Sobic006G048500 Sobic002G243900--Sobic007G178700 Sobic002G243900--Sobic003G268300 Sobic002G243900--Sobic002G145101 Sobic002G243900--Sobic003G176500 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic003G179201--Sobic003G429650 Sobic003G179201--Sobic006G048500 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic003G179201--Sobic006G216800 Sobic002G133400 Sobic002G133400 Sobic003G179201--Sobic002G133400 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic003G179201--Sobic003G332800 Sobic003G179201--Sobic003G148000 Sobic003G179201--Sobic010G202000 Sobic008G162900 Sobic008G162900 Sobic003G179201--Sobic008G162900 Sobic004G082400 Sobic004G082400 Sobic003G179201--Sobic004G082400
Octagon: transcription factors


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