Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G179201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VXX4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G429650 - -
2 Sobic.006G048500 - -
3 Sobic.006G216800 AAA family ATPase, putative, expressed K13339: PEX6, peroxin-6
4 Sobic.002G133400 CTR1-like protein kinase, putative, expressed K14510: serine/threonine-protein kinase CTR1
5 Sobic.003G332800 GTPase-activating protein, putative, expressed -
6 Sobic.003G148000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
7 Sobic.010G202000 glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.008G162900 peroxisome assembly protein, putative, expressed K06664: PEX2, peroxin-2
9 Sobic.004G082400 josephin, putative, expressed -
10 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
11 Sobic.009G140500 no apical meristem protein, putative, expressed -
12 Sobic.007G113800 early-responsive to dehydration protein-related, putative, expressed -
13 Sobic.007G167500 expressed protein -
14 Sobic.001G274200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
15 Sobic.005G144400 - -
16 Sobic.007G096600 - -
17 Sobic.001G067850 - -
18 Sobic.002G145101 - -
19 Sobic.010G277500 expressed protein -
20 Sobic.002G144933 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G179201 Sobic003G179201 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic003G179201--Sobic003G429650 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic003G179201--Sobic006G048500 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic003G179201--Sobic006G216800 Sobic002G133400 Sobic002G133400 Sobic003G179201--Sobic002G133400 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic003G179201--Sobic003G332800 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic003G179201--Sobic003G148000 Sobic010G202000 Sobic010G202000 Sobic003G179201--Sobic010G202000 Sobic008G162900 Sobic008G162900 Sobic003G179201--Sobic008G162900 Sobic004G082400 Sobic004G082400 Sobic003G179201--Sobic004G082400 Sobic003G429650--Sobic006G048500 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic003G429650--Sobic006G182900 Sobic003G429650--Sobic003G148000 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic003G429650--Sobic005G144400 Sobic003G429650--Sobic003G179201 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic003G429650--Sobic001G287201 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic003G429650--Sobic002G243900 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic003G429650--Sobic001G214300 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G429650--Sobic002G006900 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic006G216800--Sobic002G133400 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic006G216800--Sobic007G116200 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic006G216800--Sobic002G309600 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic006G216800--Sobic002G134200 Sobic006G216800--Sobic003G332800 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic006G216800--Sobic005G112300 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic006G216800--Sobic003G280800 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic006G216800--Sobic010G139000 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic006G216800--Sobic010G277500 Sobic002G133400--Sobic006G216800 Sobic002G133400--Sobic002G134200 Sobic002G133400--Sobic002G006900 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic002G133400--Sobic008G047800 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic002G133400--Sobic007G065400 Sobic002G133400--Sobic002G309600 Sobic002G133400--Sobic010G139000 Sobic001G036050 Sobic001G036050 Sobic002G133400--Sobic001G036050 Sobic002G133400--Sobic006G048500 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G332800--Sobic007G096600 Sobic003G332800--Sobic006G216800 Sobic003G332800--Sobic003G148000 Sobic003G332800--Sobic002G006900 Sobic007G167500 Sobic007G167500 Sobic003G332800--Sobic007G167500 Sobic009G209300 Sobic009G209300 Sobic003G332800--Sobic009G209300 Sobic003G332800--Sobic002G243900 Sobic003G332800--Sobic007G065400 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic003G332800--Sobic003G176500 Sobic003G148000--Sobic005G144400 Sobic002G180666 Sobic002G180666 Sobic003G148000--Sobic002G180666 Sobic003G148000--Sobic002G145101 Sobic003G148000--Sobic006G048500 Sobic003G148000--Sobic002G243900 Sobic003G148000--Sobic001G214300 Sobic003G148000--Sobic007G096600 Sobic003G148000--Sobic003G429650 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic003G148000--Sobic004G258700 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic010G202000--Sobic003G170100 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic010G202000--Sobic002G144933 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic010G202000--Sobic003G268300 Sobic007G113800 Sobic007G113800 Sobic010G202000--Sobic007G113800 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic010G202000--Sobic008G173900 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic010G202000--Sobic001G274200 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic010G202000--Sobic007G037900 Sobic010G202000--Sobic007G096600 Sobic005G110472 Sobic005G110472 Sobic010G202000--Sobic005G110472 Sobic003G184699 Sobic003G184699 Sobic008G162900--Sobic003G184699 Sobic009G126400 Sobic009G126400 Sobic008G162900--Sobic009G126400 Sobic008G162900--Sobic008G047800 Sobic001G407200 Sobic001G407200 Sobic008G162900--Sobic001G407200 Sobic005G013200 Sobic005G013200 Sobic008G162900--Sobic005G013200 Sobic003G052200 Sobic003G052200 Sobic008G162900--Sobic003G052200 Sobic008G162900--Sobic006G216800 Sobic001G222500 Sobic001G222500 Sobic008G162900--Sobic001G222500 Sobic002G343901 Sobic002G343901 Sobic008G162900--Sobic002G343901 Sobic004G082400--Sobic003G179201 Sobic004G082400--Sobic007G096600 Sobic004G082400--Sobic002G145101 Sobic009G102500 Sobic009G102500 Sobic004G082400--Sobic009G102500 Sobic004G082400--Sobic006G048500 Sobic004G082400--Sobic008G162900 Sobic004G082400--Sobic003G429650 Sobic004G082400--Sobic007G113800 Sobic001G152320 Sobic001G152320 Sobic004G082400--Sobic001G152320
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.