Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G182900.1
Synonym Sb06g025720
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PMN7
Pfam PF05664
Panther DB PTHR31280 PTHR31280:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G11670 : Protein of unknown function (DUF810)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g47930.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010177
Brachypodium PNT61683 , PNT61682
Barley -
Wheat TraesCS2A02G401500 , TraesCS2B02G419500 , TraesCS2B02G419500 , TraesCS2D02G398800 , TraesCS2D02G398800
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G429650 - -
2 Sobic.006G048500 - -
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10 Sobic.001G287201 - -
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17 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G314000 expressed protein -
19 Sobic.004G341900 lecithine cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.004G007100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic006G182900--Sobic003G429650 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic006G182900--Sobic006G048500 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic006G182900--Sobic007G161000 Sobic001G365900 Sobic001G365900 Sobic006G182900--Sobic001G365900 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic006G182900--Sobic007G116200 Sobic004G096600 Sobic004G096600 Sobic006G182900--Sobic004G096600 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic006G182900--Sobic002G134200 Sobic001G214300 Sobic001G214300 Sobic006G182900--Sobic001G214300 Sobic009G209300 Sobic009G209300 Sobic006G182900--Sobic009G209300 Sobic003G429650--Sobic006G048500 Sobic003G429650--Sobic006G182900 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic003G429650--Sobic003G148000 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic003G429650--Sobic005G144400 Sobic003G179201 Sobic003G179201 Sobic003G429650--Sobic003G179201 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic003G429650--Sobic001G287201 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic003G429650--Sobic002G243900 Sobic003G429650--Sobic001G214300 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G429650--Sobic002G006900 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic004G007100 Sobic006G048500--Sobic005G144400 Sobic002G145101 Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic002G145101 Sobic006G048500--Sobic003G148000 Sobic006G048500--Sobic003G429650 Sobic006G048500--Sobic002G243900 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic006G048600 Sobic006G048500--Sobic002G006900 Sobic006G048500--Sobic006G182900 Sobic004G039200 Sobic004G039200 Sobic007G161000--Sobic004G039200 Sobic007G117400 Sobic007G117400 Sobic007G161000--Sobic007G117400 Sobic009G024000 Sobic009G024000 Sobic007G161000--Sobic009G024000 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic007G161000--Sobic010G139000 Sobic007G161000--Sobic006G182900 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic007G161000--Sobic002G309600 Sobic004G314000 Sobic004G314000 Sobic007G161000--Sobic004G314000 Sobic007G161000--Sobic002G134200 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic007G161000--Sobic008G028700 Sobic010G206900 Sobic010G206900 Sobic001G365900--Sobic010G206900 Sobic001G534700 Sobic001G534700 Sobic001G365900--Sobic001G534700 Sobic001G289600 Sobic001G289600 Sobic001G365900--Sobic001G289600 Sobic008G130100 Sobic008G130100 Sobic001G365900--Sobic008G130100 Sobic002G411600 Sobic002G411600 Sobic001G365900--Sobic002G411600 Sobic002G008900 Sobic002G008900 Sobic001G365900--Sobic002G008900 Sobic009G191000 Sobic009G191000 Sobic001G365900--Sobic009G191000 Sobic004G034900 Sobic004G034900 Sobic001G365900--Sobic004G034900 Sobic001G540400 Sobic001G540400 Sobic001G365900--Sobic001G540400 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic007G116200--Sobic006G216800 Sobic010G010700 Sobic010G010700 Sobic007G116200--Sobic010G010700 Sobic007G116200--Sobic002G134200 Sobic007G116200--Sobic006G182900 Sobic004G359800 Sobic004G359800 Sobic007G116200--Sobic004G359800 Sobic007G116200--Sobic010G139000 Sobic010G256700 Sobic010G256700 Sobic007G116200--Sobic010G256700 Sobic004G209600 Sobic004G209600 Sobic007G116200--Sobic004G209600 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic007G116200--Sobic003G280800 Sobic001G036050 Sobic001G036050 Sobic004G096600--Sobic001G036050 Sobic004G096600--Sobic006G182900 Sobic004G096600--Sobic010G139000 Sobic001G456900 Sobic001G456900 Sobic004G096600--Sobic001G456900 Sobic010G279450 Sobic010G279450 Sobic004G096600--Sobic010G279450 Sobic004G096600--Sobic004G209600 Sobic004G096600--Sobic007G116200 Sobic004G096600--Sobic003G429650 Sobic004G096600--Sobic006G216800 Sobic001G071400 Sobic001G071400 Sobic002G134200--Sobic001G071400 Sobic002G134200--Sobic002G309600 Sobic002G134200--Sobic003G280800 Sobic002G134200--Sobic006G216800 Sobic002G133400 Sobic002G133400 Sobic002G134200--Sobic002G133400 Sobic008G047800 Sobic008G047800 Sobic002G134200--Sobic008G047800 Sobic005G008800 Sobic005G008800 Sobic002G134200--Sobic005G008800 Sobic002G134200--Sobic009G191000 Sobic002G134200--Sobic002G008900 Sobic004G341900 Sobic004G341900 Sobic001G214300--Sobic004G341900 Sobic001G214300--Sobic003G148000 Sobic001G214300--Sobic002G006900 Sobic001G214300--Sobic005G144400 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic001G214300--Sobic003G176500 Sobic003G029700 Sobic003G029700 Sobic001G214300--Sobic003G029700 Sobic001G214300--Sobic002G243900 Sobic001G214300--Sobic006G048500 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic001G214300--Sobic007G096600 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic009G209300--Sobic003G332800 Sobic009G209300--Sobic006G216800 Sobic009G209300--Sobic003G429650 Sobic009G209300--Sobic006G182900 Sobic009G209300--Sobic006G048500 Sobic009G209300--Sobic007G116200 Sobic002G006600 Sobic002G006600 Sobic009G209300--Sobic002G006600 Sobic009G209300--Sobic003G148000 Sobic009G209300--Sobic001G036050
Octagon: transcription factors


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