Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G111900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QIF4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G056000 GAGA-binding protein, putative, expressed -
2 Sobic.009G161600 - -
3 Sobic.009G127900 - -
4 Sobic.001G454401 - -
5 Sobic.007G178700 - -
6 Sobic.005G077466 - -
7 Sobic.006G262200 - -
8 Sobic.003G084900 expressed protein -
9 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G055150 - -
11 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G133466 - -
13 Sobic.004G290800 GRAS family transcription factor(PubMedID : 23915383)@scarecrow, putative, expressed -
14 Sobic.003G087400 - -
15 Sobic.001G420200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
16 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
17 Sobic.005G141801 - -
18 Sobic.010G026400 BUD13, putative, expressed K13106: BUD13, pre-mRNA-splicing factor CWC26
19 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
20 Sobic.001G446900 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic001G111900--Sobic010G056000 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic001G111900--Sobic009G161600 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic001G111900--Sobic009G127900 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic001G111900--Sobic001G454401 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic001G111900--Sobic007G178700 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic001G111900--Sobic005G077466 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic001G111900--Sobic006G262200 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic001G111900--Sobic003G084900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G111900--Sobic006G009400 Sobic010G056000--Sobic001G111900 Sobic010G056000--Sobic003G084900 Sobic010G028800 Sobic010G028800 Sobic010G056000--Sobic010G028800 Sobic010G056000--Sobic009G127900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic010G056000--Sobic003G087400 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic010G056000--Sobic003G187400 Sobic010G056000--Sobic005G077466 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic010G056000--Sobic001G094000 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic010G056000--Sobic002G157300 Sobic001G133466 Sobic001G133466 Sobic009G161600--Sobic001G133466 Sobic009G161600--Sobic001G111900 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic009G161600--Sobic001G420200 Sobic001G504000 Sobic001G504000 Sobic009G161600--Sobic001G504000 Sobic009G161600--Sobic007G178700 Sobic005G159000 Sobic005G159000 Sobic009G161600--Sobic005G159000 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic009G161600--Sobic001G274200 Sobic009G161600--Sobic009G127900 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic009G161600--Sobic001G287201 Sobic009G127900--Sobic007G178700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic009G127900--Sobic003G268300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic009G127900--Sobic001G446900 Sobic006G066650 Sobic006G066650 Sobic009G127900--Sobic006G066650 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic009G127900--Sobic004G290800 Sobic010G026400 Sobic010G026400 Sobic009G127900--Sobic010G026400 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic009G127900--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic009G127900--Sobic008G173900 Sobic009G127900--Sobic001G111900 Sobic001G454401--Sobic001G111900 Sobic001G454401--Sobic006G009400 Sobic001G454401--Sobic006G262200 Sobic001G454401--Sobic009G127900 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic001G454401--Sobic005G110427 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic001G454401--Sobic005G055150 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic001G454401--Sobic006G145000 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic001G454401--Sobic002G144966 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic001G454401--Sobic005G141801 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic005G077466--Sobic003G268300 Sobic005G077466--Sobic001G111900 Sobic005G077466--Sobic007G178700 Sobic005G077466--Sobic001G420200 Sobic005G077466--Sobic001G094000 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic005G077466--Sobic006G128900 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic005G077466--Sobic006G209850 Sobic005G077466--Sobic006G145000 Sobic005G077466--Sobic008G173900 Sobic006G262200--Sobic005G110427 Sobic006G262200--Sobic006G009400 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G262200--Sobic002G051450 Sobic006G262200--Sobic001G111900 Sobic006G262200--Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic005G055150 Sobic006G262200--Sobic001G454401 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic005G141801 Sobic003G084900--Sobic010G056000 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic003G084900--Sobic007G096000 Sobic003G084900--Sobic010G028800 Sobic003G084900--Sobic008G173900 Sobic008G054500 Sobic008G054500 Sobic003G084900--Sobic008G054500 Sobic006G165000 Sobic006G165000 Sobic003G084900--Sobic006G165000 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic003G084900--Sobic002G144933 Sobic003G084900--Sobic001G111900 Sobic003G084900--Sobic003G268300 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic006G262200
Octagon: transcription factors


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