Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G161600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P8T2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.009G161600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G133466 - -
2 Sobic.001G111900 - -
3 Sobic.001G420200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
4 Sobic.001G504000 Citrate transporter protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G178700 - -
6 Sobic.005G159000 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed -
7 Sobic.001G274200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
8 Sobic.009G127900 - -
9 Sobic.001G287201 - -
10 Sobic.001G284800 histone H3, putative, expressed K11253: histone H3
11 Sobic.010G056000 GAGA-binding protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G087400 - -
13 Sobic.010G123901 - -
14 Sobic.008G026900 rp1, putative, expressed -
15 Sobic.003G176600 expressed protein -
16 Sobic.006G048500 - -
17 Sobic.004G007100 - -
18 Sobic.007G096600 - -
19 Sobic.005G090401 - -
20 Sobic.004G290800 GRAS family transcription factor(PubMedID : 23915383)@scarecrow, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic001G133466 Sobic001G133466 Sobic009G161600--Sobic001G133466 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic009G161600--Sobic001G111900 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic009G161600--Sobic001G420200 Sobic001G504000 Sobic001G504000 Sobic009G161600--Sobic001G504000 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic009G161600--Sobic007G178700 Sobic005G159000 Sobic005G159000 Sobic009G161600--Sobic005G159000 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic009G161600--Sobic001G274200 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic009G161600--Sobic009G127900 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic009G161600--Sobic001G287201 Sobic001G133466--Sobic009G161600 Sobic001G133466--Sobic001G274200 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic001G133466--Sobic007G096600 Sobic001G133466--Sobic001G420200 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic001G133466--Sobic008G173900 Sobic001G133466--Sobic001G111900 Sobic010G123901 Sobic010G123901 Sobic001G133466--Sobic010G123901 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic001G133466--Sobic002G243900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic001G133466--Sobic003G176500 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic001G111900--Sobic010G056000 Sobic001G111900--Sobic009G161600 Sobic001G111900--Sobic009G127900 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic001G111900--Sobic001G454401 Sobic001G111900--Sobic007G178700 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic001G111900--Sobic005G077466 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic001G111900--Sobic006G262200 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic001G111900--Sobic003G084900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G111900--Sobic006G009400 Sobic001G420200--Sobic001G274200 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G420200--Sobic002G157000 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic001G420200--Sobic003G268300 Sobic001G420200--Sobic008G173900 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic001G420200--Sobic002G248400 Sobic001G420200--Sobic007G096600 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic001G420200--Sobic007G037900 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G420200--Sobic002G144933 Sobic001G420200--Sobic007G178700 Sobic001G504000--Sobic009G161600 Sobic001G504000--Sobic009G127900 Sobic009G140500 Sobic009G140500 Sobic001G504000--Sobic009G140500 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic001G504000--Sobic004G290800 Sobic001G504000--Sobic001G420200 Sobic001G504000--Sobic007G037900 Sobic001G504000--Sobic001G274200 Sobic004G205800 Sobic004G205800 Sobic001G504000--Sobic004G205800 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic001G504000--Sobic006G082600 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic005G159000--Sobic003G280800 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic005G159000--Sobic002G309600 Sobic005G159000--Sobic001G133466 Sobic005G159000--Sobic001G287201 Sobic005G159000--Sobic001G420200 Sobic001G533700 Sobic001G533700 Sobic005G159000--Sobic001G533700 Sobic005G159000--Sobic001G274200 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic005G159000--Sobic002G134200 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic005G159000--Sobic006G048500 Sobic001G274200--Sobic001G420200 Sobic001G274200--Sobic007G096600 Sobic001G274200--Sobic003G268300 Sobic001G274200--Sobic008G173900 Sobic001G274200--Sobic002G144933 Sobic001G274200--Sobic001G133466 Sobic001G274200--Sobic007G037900 Sobic001G274200--Sobic002G243900 Sobic001G274200--Sobic010G123901 Sobic009G127900--Sobic007G178700 Sobic009G127900--Sobic003G268300 Sobic009G127900--Sobic001G446900 Sobic006G066650 Sobic006G066650 Sobic009G127900--Sobic006G066650 Sobic009G127900--Sobic004G290800 Sobic010G026400 Sobic010G026400 Sobic009G127900--Sobic010G026400 Sobic009G127900--Sobic007G037900 Sobic009G127900--Sobic008G173900 Sobic009G127900--Sobic001G111900 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic001G287201--Sobic003G429650 Sobic001G287201--Sobic003G280800 Sobic001G287201--Sobic002G243900 Sobic001G287201--Sobic006G048500 Sobic001G287201--Sobic004G007100 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic001G287201--Sobic006G182900 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic001G287201--Sobic002G006900 Sobic001G287201--Sobic007G096600 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic001G287201--Sobic009G104201
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.