Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G123901.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VSL2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G274200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
2 Sobic.009G140500 no apical meristem protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G133466 - -
4 Sobic.001G420200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
5 Sobic.001G067850 - -
6 Sobic.010G124001 - -
7 Sobic.007G096600 - -
8 Sobic.007G037900 oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold containing protein, expressed -
9 Sobic.002G203200 - -
10 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
11 Sobic.009G161600 - -
12 Sobic.004G290800 GRAS family transcription factor(PubMedID : 23915383)@scarecrow, putative, expressed -
13 Sobic.002G144933 - -
14 Sobic.005G144400 - -
15 Sobic.007G178700 - -
16 Sobic.003G179201 - -
17 Sobic.003G268300 surp module family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G064750 - -
19 Sobic.005G028400 "Ca ATPase, IIB type"(PubMedID : 22196357)@Autoihibited Ca2+ - ATPase 11(PubMedID : 26320239)@calcium-transporting ATPase, plasma membrane-type, putative, expressed K01537: P-type Ca2+ transporter type 2C
20 Sobic.001G162300 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2


Gene co-expression network
sample Sobic010G123901 Sobic010G123901 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic010G123901--Sobic001G274200 Sobic009G140500 Sobic009G140500 Sobic010G123901--Sobic009G140500 Sobic001G133466 Sobic001G133466 Sobic010G123901--Sobic001G133466 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic010G123901--Sobic001G420200 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic010G123901--Sobic001G067850 Sobic010G124001 Sobic010G124001 Sobic010G123901--Sobic010G124001 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic010G123901--Sobic007G096600 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic010G123901--Sobic007G037900 Sobic002G203200 Sobic002G203200 Sobic010G123901--Sobic002G203200 Sobic001G274200--Sobic001G420200 Sobic001G274200--Sobic007G096600 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic001G274200--Sobic003G268300 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic001G274200--Sobic008G173900 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G274200--Sobic002G144933 Sobic001G274200--Sobic001G133466 Sobic001G274200--Sobic007G037900 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic001G274200--Sobic002G243900 Sobic001G274200--Sobic010G123901 Sobic009G140500--Sobic001G274200 Sobic009G140500--Sobic001G067850 Sobic009G140500--Sobic010G123901 Sobic009G140500--Sobic007G037900 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic009G140500--Sobic004G290800 Sobic009G140500--Sobic001G420200 Sobic003G179201 Sobic003G179201 Sobic009G140500--Sobic003G179201 Sobic009G140500--Sobic002G203200 Sobic009G140500--Sobic007G096600 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic001G133466--Sobic009G161600 Sobic001G133466--Sobic001G274200 Sobic001G133466--Sobic007G096600 Sobic001G133466--Sobic001G420200 Sobic001G133466--Sobic008G173900 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic001G133466--Sobic001G111900 Sobic001G133466--Sobic010G123901 Sobic001G133466--Sobic002G243900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic001G133466--Sobic003G176500 Sobic001G420200--Sobic001G274200 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G420200--Sobic002G157000 Sobic001G420200--Sobic003G268300 Sobic001G420200--Sobic008G173900 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic001G420200--Sobic002G248400 Sobic001G420200--Sobic007G096600 Sobic001G420200--Sobic007G037900 Sobic001G420200--Sobic002G144933 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic001G420200--Sobic007G178700 Sobic001G067850--Sobic002G243900 Sobic001G067850--Sobic007G178700 Sobic001G067850--Sobic001G274200 Sobic001G067850--Sobic009G140500 Sobic001G067850--Sobic001G420200 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic001G067850--Sobic005G144400 Sobic001G067850--Sobic007G096600 Sobic001G067850--Sobic007G037900 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic001G067850--Sobic006G088580 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic010G124001--Sobic007G211000 Sobic010G124001--Sobic002G203200 Sobic010G124001--Sobic006G088580 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic010G124001--Sobic004G112500 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic010G124001--Sobic006G082600 Sobic001G271900 Sobic001G271900 Sobic010G124001--Sobic001G271900 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic010G124001--Sobic001G543900 Sobic010G124001--Sobic007G037900 Sobic007G037100 Sobic007G037100 Sobic010G124001--Sobic007G037100 Sobic007G096600--Sobic002G243900 Sobic007G096600--Sobic003G268300 Sobic007G096600--Sobic003G176500 Sobic007G096600--Sobic001G274200 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic007G096600--Sobic003G200200 Sobic007G096600--Sobic005G144400 Sobic003G148000 Sobic003G148000 Sobic007G096600--Sobic003G148000 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic003G332800 Sobic007G096600--Sobic001G420200 Sobic007G037900--Sobic003G268300 Sobic007G037900--Sobic001G420200 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic007G037900--Sobic006G246900 Sobic007G037900--Sobic002G144933 Sobic007G037900--Sobic001G274200 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic007G037900--Sobic009G127900 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G037900--Sobic001G162300 Sobic007G037900--Sobic004G290800 Sobic007G037900--Sobic002G157000 Sobic002G203200--Sobic010G124001 Sobic002G203200--Sobic007G037900 Sobic002G203200--Sobic001G067850 Sobic002G203200--Sobic006G082600 Sobic002G203200--Sobic009G140500 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic002G203200--Sobic005G130200 Sobic002G165300 Sobic002G165300 Sobic002G203200--Sobic002G165300 Sobic002G203200--Sobic007G211000 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic002G203200--Sobic004G196700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.