Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G284800.1
Synonym Sb01g027970
Functional annotation histone H3, putative, expressed
UniProt C5WQP5
Pfam PF00125
Panther DB PTHR11426
NCBI CDD KOG1745; Histones H3 and H4
KEGG Orthology K11253; histone H3
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding GO:0000786nucleosome


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G40030 : Histone superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g04030.1 : histone H3, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011166 , Zm00025a020776
Brachypodium KQJ82897
Barley HORVU2Hr1G079550.2 , HORVU2Hr1G079550.1 , HORVU2Hr1G079560.3 , HORVU2Hr1G079560.2 , HORVU2Hr1G079560.7 , HORVU2Hr1G079560.6 , HORVU2Hr1G079560.5 , HORVU2Hr1G079560.4
Wheat TraesCS2D02G316700 , TraesCS2B02G337200
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G284800 Sobic001G284800 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic001G284800--Sobic009G161600 Sobic002G187801 Sobic002G187801 Sobic001G284800--Sobic002G187801 Sobic001G133466 Sobic001G133466 Sobic001G284800--Sobic001G133466 Sobic003G088700 Sobic003G088700 Sobic001G284800--Sobic003G088700 Sobic004G135300 Sobic004G135300 Sobic001G284800--Sobic004G135300 Sobic009G233300 Sobic009G233300 Sobic001G284800--Sobic009G233300 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic001G284800--Sobic001G111900 Sobic001G504000 Sobic001G504000 Sobic001G284800--Sobic001G504000 Sobic006G273200 Sobic006G273200 Sobic001G284800--Sobic006G273200 Sobic009G161600--Sobic001G133466 Sobic009G161600--Sobic001G111900 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic009G161600--Sobic001G420200 Sobic009G161600--Sobic001G504000 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic009G161600--Sobic007G178700 Sobic005G159000 Sobic005G159000 Sobic009G161600--Sobic005G159000 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic009G161600--Sobic001G274200 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic009G161600--Sobic009G127900 Sobic001G287201 Sobic001G287201 Sobic009G161600--Sobic001G287201 Sobic008G165700 Sobic008G165700 Sobic002G187801--Sobic008G165700 Sobic001G253700 Sobic001G253700 Sobic002G187801--Sobic001G253700 Sobic002G187801--Sobic009G233300 Sobic002G187801--Sobic006G273200 Sobic002G187801--Sobic001G284800 Sobic004G003501 Sobic004G003501 Sobic002G187801--Sobic004G003501 Sobic003G000150 Sobic003G000150 Sobic002G187801--Sobic003G000150 Sobic002G092300 Sobic002G092300 Sobic002G187801--Sobic002G092300 Sobic002G365100 Sobic002G365100 Sobic002G187801--Sobic002G365100 Sobic001G133466--Sobic009G161600 Sobic001G133466--Sobic001G274200 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic001G133466--Sobic007G096600 Sobic001G133466--Sobic001G420200 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic001G133466--Sobic008G173900 Sobic001G133466--Sobic001G111900 Sobic010G123901 Sobic010G123901 Sobic001G133466--Sobic010G123901 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic001G133466--Sobic002G243900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic001G133466--Sobic003G176500 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic003G088700--Sobic010G056000 Sobic003G205801 Sobic003G205801 Sobic003G088700--Sobic003G205801 Sobic003G088700--Sobic001G111900 Sobic009G178800 Sobic009G178800 Sobic003G088700--Sobic009G178800 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic003G088700--Sobic003G084900 Sobic003G088700--Sobic009G127900 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic003G088700--Sobic008G125600 Sobic004G039700 Sobic004G039700 Sobic003G088700--Sobic004G039700 Sobic006G183800 Sobic006G183800 Sobic003G088700--Sobic006G183800 Sobic004G135300--Sobic003G084900 Sobic001G222250 Sobic001G222250 Sobic004G135300--Sobic001G222250 Sobic006G042200 Sobic006G042200 Sobic004G135300--Sobic006G042200 Sobic001G409600 Sobic001G409600 Sobic004G135300--Sobic001G409600 Sobic004G135300--Sobic006G273200 Sobic004G135300--Sobic003G088700 Sobic005G128400 Sobic005G128400 Sobic004G135300--Sobic005G128400 Sobic007G009400 Sobic007G009400 Sobic004G135300--Sobic007G009400 Sobic001G267900 Sobic001G267900 Sobic004G135300--Sobic001G267900 Sobic009G233300--Sobic006G273200 Sobic009G233300--Sobic008G165700 Sobic009G233300--Sobic002G187801 Sobic006G119800 Sobic006G119800 Sobic009G233300--Sobic006G119800 Sobic001G387600 Sobic001G387600 Sobic009G233300--Sobic001G387600 Sobic001G372500 Sobic001G372500 Sobic009G233300--Sobic001G372500 Sobic009G233300--Sobic001G284800 Sobic003G309900 Sobic003G309900 Sobic009G233300--Sobic003G309900 Sobic003G176600 Sobic003G176600 Sobic009G233300--Sobic003G176600 Sobic001G111900--Sobic010G056000 Sobic001G111900--Sobic009G161600 Sobic001G111900--Sobic009G127900 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic001G111900--Sobic001G454401 Sobic001G111900--Sobic007G178700 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic001G111900--Sobic005G077466 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic001G111900--Sobic006G262200 Sobic001G111900--Sobic003G084900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G111900--Sobic006G009400 Sobic001G504000--Sobic009G161600 Sobic001G504000--Sobic009G127900 Sobic009G140500 Sobic009G140500 Sobic001G504000--Sobic009G140500 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic001G504000--Sobic004G290800 Sobic001G504000--Sobic001G420200 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic001G504000--Sobic007G037900 Sobic001G504000--Sobic001G274200 Sobic004G205800 Sobic004G205800 Sobic001G504000--Sobic004G205800 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic001G504000--Sobic006G082600 Sobic001G497300 Sobic001G497300 Sobic006G273200--Sobic001G497300 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic006G273200--Sobic009G065100 Sobic004G205600 Sobic004G205600 Sobic006G273200--Sobic004G205600 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic006G273200--Sobic007G096000 Sobic006G273200--Sobic009G233300 Sobic008G062000 Sobic008G062000 Sobic006G273200--Sobic008G062000 Sobic006G237400 Sobic006G237400 Sobic006G273200--Sobic006G237400 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic006G273200--Sobic007G205800 Sobic006G273200--Sobic003G176600
Octagon: transcription factors


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