Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G003501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RK97
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G52552 : conserved peptide upstream open reading frame 14
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G003401 - -
2 Sobic.001G127000 alkaline phytoceramidase, putative, expressed K04711: ACER3, dihydroceramidase
3 Sobic.004G067700 BRCA1-associated protein, putative, expressed K10632: BRCA1-associated protein
4 Sobic.002G187801 - K03134: transcription initiation factor TFIID subunit 10
5 Sobic.010G005700 expressed protein -
6 Sobic.001G114000 expressed protein -
7 Sobic.006G194500 expressed protein -
8 Sobic.009G041700 Fibronectin type III domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G284800 histone H3, putative, expressed K11253: histone H3
10 Sobic.003G412700 serine palmitoyltransferase 2, putative, expressed K00654: serine palmitoyltransferase
11 Sobic.008G173400 initiation factor 2 subunit family domain containing protein, expressed K03680: translation initiation factor eIF-2B subunit delta
12 Sobic.002G388200 LTV1, putative, expressed K14798: protein LTV1
13 Sobic.003G001000 - -
14 Sobic.002G310200 expressed protein -
15 Sobic.008G129100 expressed protein -
16 Sobic.007G156200 glycoprotein 3-alpha-L-fucosyltransferase A, putative, expressed K00753: glycoprotein 3-alpha-L-fucosyltransferase
17 Sobic.004G142900 - -
18 Sobic.002G370900 OsPOP16 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed K06889: uncharacterized protein
19 Sobic.002G347000 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14963: WDR5, SWD3, COMPASS component SWD3
20 Sobic.007G028001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G003501 Sobic004G003501 Sobic004G003401 Sobic004G003401 Sobic004G003501--Sobic004G003401 Sobic001G127000 Sobic001G127000 Sobic004G003501--Sobic001G127000 Sobic004G067700 Sobic004G067700 Sobic004G003501--Sobic004G067700 Sobic002G187801 Sobic002G187801 Sobic004G003501--Sobic002G187801 Sobic010G005700 Sobic010G005700 Sobic004G003501--Sobic010G005700 Sobic001G114000 Sobic001G114000 Sobic004G003501--Sobic001G114000 Sobic006G194500 Sobic006G194500 Sobic004G003501--Sobic006G194500 Sobic009G041700 Sobic009G041700 Sobic004G003501--Sobic009G041700 Sobic001G284800 Sobic001G284800 Sobic004G003501--Sobic001G284800 Sobic009G228700 Sobic009G228700 Sobic004G003401--Sobic009G228700 Sobic002G303600 Sobic002G303600 Sobic004G003401--Sobic002G303600 Sobic001G091300 Sobic001G091300 Sobic004G003401--Sobic001G091300 Sobic010G243400 Sobic010G243400 Sobic004G003401--Sobic010G243400 Sobic006G180000 Sobic006G180000 Sobic004G003401--Sobic006G180000 Sobic003G312200 Sobic003G312200 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Octagon: transcription factors


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