Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G005700.1
Synonym Sb10g000740
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z270
Pfam PF12274
Panther DB PTHR34710 PTHR34710:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g13490.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.010G005700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G067700 BRCA1-associated protein, putative, expressed K10632: BRCA1-associated protein
2 Sobic.003G407100 CBS domain-containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G205200 OsFBX170 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G287800 GTPase-activating protein, putative, expressed K12493: ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 2/3
5 Sobic.004G003401 - -
6 Sobic.004G345700 TBC domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G003501 - -
8 Sobic.002G365100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.006G128800 expressed protein -
10 Sobic.003G261300 arginine/serine-rich coiled-coil protein 1, putative, expressed -
11 Sobic.002G370900 OsPOP16 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed K06889: uncharacterized protein
12 Sobic.003G008500 VHS and GAT domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G094300 protein kinase domain containing protein, expressed K04424: ZAK, sterile alpha motif and leucine zipper containing kinase AZK
14 Sobic.006G082900 expressed protein -
15 Sobic.003G187200 phox domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G143200 expressed protein -
17 Sobic.001G176200 FHA domain containing protein, putative, expressed K13216: PPP1R8, nuclear inhibitor of protein phosphatase 1
18 Sobic.003G398400 expressed protein -
19 Sobic.001G127500 ABC1 family domain containing protein, putative, expressed K08869: ADCK, aarF domain-containing kinase
20 Sobic.004G007300 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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