Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G055150.2,Sobic.005G055150.3,Sobic.005G055150.1,Sobic.005G055150.4
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RH78 , A0A1Z5RGT8 , A0A1Z5RHF0
Pfam -
Panther DB PTHR23091 PTHR23091:SF255
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G03650 : Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g35680.1 : acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G141801 - -
3 Sobic.005G110427 - -
4 Sobic.001G111900 - -
5 Sobic.006G262200 - -
6 Sobic.009G127900 - -
7 Sobic.002G410200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
8 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.007G178700 - -
10 Sobic.001G543900 H(+)-ATPase 7(PubMedID : 26320239)@E1-E2 ATPase domain containing protein, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
11 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G117801 - -
13 Sobic.002G051450 - -
14 Sobic.010G074500 -(PubMedID : 26320239)@phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, putative, expressed K01598: PPCDC, phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
15 Sobic.K009900 autophagy-related protein 8D, putative, expressed K08341: GABARAP, ATG8, GABA(A) receptor-associated protein
16 Sobic.004G076732 - K14800: pre-rRNA-processing protein TSR2
17 Sobic.005G221425 - -
18 Sobic.003G244800 - -
19 Sobic.001G454401 - -
20 Sobic.008G049701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic005G055150--Sobic006G009400 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic005G055150--Sobic005G141801 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic005G055150--Sobic005G110427 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic005G055150--Sobic001G111900 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic005G055150--Sobic006G262200 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic005G055150--Sobic009G127900 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic005G055150--Sobic002G410200 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G055150--Sobic009G209800 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic005G055150--Sobic007G178700 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic005G141801--Sobic005G055150 Sobic005G141801--Sobic006G009400 Sobic010G074500 Sobic010G074500 Sobic005G141801--Sobic010G074500 Sobic005G141801--Sobic001G111900 Sobic005G141801--Sobic010G263800 Sobic005G141801--Sobic006G262200 Sobic005G141801--Sobic005G110427 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic005G141801--Sobic002G051450 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic005G141801--Sobic009G117400 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic001G111900--Sobic010G056000 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic001G111900--Sobic009G161600 Sobic001G111900--Sobic009G127900 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic001G111900--Sobic001G454401 Sobic001G111900--Sobic007G178700 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic001G111900--Sobic005G077466 Sobic001G111900--Sobic006G262200 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic001G111900--Sobic003G084900 Sobic001G111900--Sobic006G009400 Sobic006G262200--Sobic005G110427 Sobic006G262200--Sobic006G009400 Sobic006G262200--Sobic002G051450 Sobic006G262200--Sobic001G111900 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic005G055150 Sobic006G262200--Sobic001G454401 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic005G141801 Sobic009G127900--Sobic007G178700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic009G127900--Sobic003G268300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic009G127900--Sobic001G446900 Sobic006G066650 Sobic006G066650 Sobic009G127900--Sobic006G066650 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic009G127900--Sobic004G290800 Sobic010G026400 Sobic010G026400 Sobic009G127900--Sobic010G026400 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic009G127900--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic009G127900--Sobic008G173900 Sobic009G127900--Sobic001G111900 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic002G410200--Sobic004G076732 Sobic002G410200--Sobic009G209800 SobicK009900 SobicK009900 Sobic002G410200--SobicK009900 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic002G410200--Sobic001G253100 Sobic003G244800 Sobic003G244800 Sobic002G410200--Sobic003G244800 Sobic002G410200--Sobic005G139800 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic002G410200--Sobic008G042250 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic002G410200--Sobic008G009500 Sobic002G410200--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic008G049701 Sobic009G209800--Sobic001G253100 Sobic009G209800--Sobic005G139800 Sobic009G209800--Sobic001G240400 Sobic009G209800--Sobic008G042250 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic005G117801 Sobic009G209800--Sobic002G056100 Sobic009G209800--Sobic005G221425 Sobic009G209800--Sobic002G410200 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G178700--Sobic001G420200
Octagon: transcription factors


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