Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G051450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W2B0
Pfam -
Panther DB PTHR33165 PTHR33165:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g08040.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT63238
Barley -
Wheat TraesCS2B02G503800 , TraesCS2A02G479200 , TraesCS2D02G487800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G262200 - -
3 Sobic.005G015100 OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.010G263800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@uncharacterized protein(PubMedID : 28640841)@UPF0183 protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G034600 protein kinase PKN/PRK1, effector, putative, expressed -
6 Sobic.004G256600 KH domain containing protein, putative, expressed K14945: protein quaking
7 Sobic.009G045700 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
8 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
9 Sobic.005G077400 - -
10 Sobic.005G055150 - -
11 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
12 Sobic.005G141801 - -
13 Sobic.009G113600 - -
14 Sobic.006G145000 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
15 Sobic.002G062300 expressed protein -
16 Sobic.007G059300 - -
17 Sobic.005G110427 - -
18 Sobic.001G111900 - -
19 Sobic.008G117200 RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1, putative, expressed K10144: RCHY1, RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1
20 Sobic.008G036500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic002G051450--Sobic006G009400 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic002G051450--Sobic006G262200 Sobic005G015100 Sobic005G015100 Sobic002G051450--Sobic005G015100 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic002G051450--Sobic010G263800 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic002G051450--Sobic008G034600 Sobic004G256600 Sobic004G256600 Sobic002G051450--Sobic004G256600 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic002G051450--Sobic009G045700 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic002G051450--Sobic009G004700 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic002G051450--Sobic005G077400 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic006G262200--Sobic005G110427 Sobic006G262200--Sobic006G009400 Sobic006G262200--Sobic002G051450 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic006G262200--Sobic001G111900 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic005G055150 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic006G262200--Sobic001G454401 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic004G005400 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic006G262200--Sobic005G141801 Sobic005G015100--Sobic002G051450 Sobic005G015100--Sobic008G034600 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic005G015100--Sobic002G158700 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic005G015100--Sobic001G464200 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic005G015100--Sobic006G128900 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic005G015100--Sobic006G145000 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic005G015100--Sobic002G421700 Sobic004G271900 Sobic004G271900 Sobic005G015100--Sobic004G271900 Sobic005G015100--Sobic004G256600 Sobic010G263800--Sobic006G009400 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic010G263800--Sobic007G011400 Sobic002G077200 Sobic002G077200 Sobic010G263800--Sobic002G077200 Sobic010G263800--Sobic002G313300 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic010G263800--Sobic002G157300 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic010G263800--Sobic007G205800 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic010G263800--Sobic009G117400 Sobic001G347600 Sobic001G347600 Sobic010G263800--Sobic001G347600 Sobic010G263800--Sobic008G034600 Sobic008G034600--Sobic007G205800 Sobic008G034600--Sobic007G011400 Sobic008G034600--Sobic010G263800 Sobic008G034600--Sobic004G271900 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic008G034600--Sobic008G117200 Sobic008G034600--Sobic002G421700 Sobic009G022200 Sobic009G022200 Sobic008G034600--Sobic009G022200 Sobic007G224900 Sobic007G224900 Sobic008G034600--Sobic007G224900 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic008G034600--Sobic003G346000 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic004G256600--Sobic003G258400 Sobic004G256600--Sobic004G271900 Sobic004G256600--Sobic010G263800 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic004G256600--Sobic009G040700 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic004G256600--Sobic005G187200 Sobic004G256600--Sobic006G009400 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic004G256600--Sobic009G231300 Sobic004G256600--Sobic009G117400 Sobic004G256600--Sobic002G077200 Sobic009G045700--Sobic002G051450 Sobic009G045700--Sobic006G009400 Sobic009G045700--Sobic006G262200 Sobic009G045700--Sobic009G004700 Sobic009G045700--Sobic010G263800 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic009G045700--Sobic010G144100 Sobic009G045700--Sobic008G034600 Sobic009G045700--Sobic002G144966 Sobic008G153600 Sobic008G153600 Sobic009G045700--Sobic008G153600 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic009G004700--Sobic009G113600 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic009G004700--Sobic003G089650 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic009G004700--Sobic002G062300 Sobic005G110523 Sobic005G110523 Sobic009G004700--Sobic005G110523 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic009G004700--Sobic007G059300 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic009G004700--Sobic009G026400 Sobic009G004700--Sobic006G009400 Sobic005G212500 Sobic005G212500 Sobic009G004700--Sobic005G212500 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic009G004700--Sobic003G031750 Sobic005G077400--Sobic002G051450 Sobic005G077400--Sobic006G262200 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic005G077400--Sobic009G104300 Sobic006G039900 Sobic006G039900 Sobic005G077400--Sobic006G039900 Sobic005G077400--Sobic005G055150 Sobic003G020100 Sobic003G020100 Sobic005G077400--Sobic003G020100 Sobic006G046000 Sobic006G046000 Sobic005G077400--Sobic006G046000 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G077400--Sobic001G267233 Sobic005G077400--Sobic009G045700
Octagon: transcription factors


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