Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G145000.2
Synonym Sb06g022370
Functional annotation disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed
UniProt C5YBG3
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF600
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g43340.1 : disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G040700 "OsPPKL2(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659919)@serine/threonine protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
2 Sobic.005G077466 - -
3 Sobic.001G094000 expressed protein -
4 Sobic.004G357200 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
5 Sobic.006G246900 expressed protein -
6 Sobic.007G011400 armadillo/beta-catenin repeat family protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G205800 chaperone protein dnaJ 10, putative, expressed -
9 Sobic.006G128900 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
10 Sobic.004G256600 KH domain containing protein, putative, expressed K14945: protein quaking
11 Sobic.009G087800 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed K08742: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2
12 Sobic.001G464200 flap endonuclease, putative, expressed K10846: ERCC5, XPG, DNA excision repair protein ERCC-5
13 Sobic.001G454401 - -
14 Sobic.001G477800 expressed protein -
15 Sobic.001G111900 - -
16 Sobic.010G263800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@uncharacterized protein(PubMedID : 28640841)@UPF0183 protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G051450 - -
18 Sobic.008G024600 expressed protein -
19 Sobic.009G127900 - -
20 Sobic.005G015100 OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic006G145000--Sobic009G040700 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic006G145000--Sobic005G077466 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic006G145000--Sobic001G094000 Sobic004G357200 Sobic004G357200 Sobic006G145000--Sobic004G357200 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic006G145000--Sobic006G246900 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic006G145000--Sobic007G011400 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic006G145000--Sobic006G009400 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic006G145000--Sobic007G205800 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic006G145000--Sobic006G128900 Sobic009G040700--Sobic001G094000 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic009G040700--Sobic003G187400 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic009G040700--Sobic005G149500 Sobic009G040700--Sobic007G011400 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic009G040700--Sobic002G157300 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic009G040700--Sobic001G477800 Sobic009G040700--Sobic006G145000 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic009G040700--Sobic004G196700 Sobic008G078100 Sobic008G078100 Sobic009G040700--Sobic008G078100 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic005G077466--Sobic003G268300 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic005G077466--Sobic001G111900 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic005G077466--Sobic007G178700 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic005G077466--Sobic001G420200 Sobic005G077466--Sobic001G094000 Sobic005G077466--Sobic006G128900 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic005G077466--Sobic006G209850 Sobic005G077466--Sobic006G145000 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic005G077466--Sobic008G173900 Sobic001G094000--Sobic007G011400 Sobic001G094000--Sobic009G040700 Sobic001G094000--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic001G094000--Sobic002G157000 Sobic001G094000--Sobic003G268300 Sobic001G094000--Sobic002G157300 Sobic001G094000--Sobic003G187400 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic001G094000--Sobic004G031700 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic001G094000--Sobic006G080300 Sobic004G357200--Sobic006G145000 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic004G357200--Sobic008G024600 Sobic006G021250 Sobic006G021250 Sobic004G357200--Sobic006G021250 Sobic004G357200--Sobic009G040700 Sobic001G543800 Sobic001G543800 Sobic004G357200--Sobic001G543800 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic004G357200--Sobic007G096000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic004G357200--Sobic003G113200 Sobic004G357200--Sobic006G128900 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic004G357200--Sobic003G280800 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic006G246900--Sobic001G162300 Sobic006G246900--Sobic003G268300 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic006G246900--Sobic007G037900 Sobic006G246900--Sobic001G094000 Sobic006G246900--Sobic002G157000 Sobic009G134500 Sobic009G134500 Sobic006G246900--Sobic009G134500 Sobic008G063000 Sobic008G063000 Sobic006G246900--Sobic008G063000 Sobic006G246900--Sobic001G477800 Sobic006G246900--Sobic007G011400 Sobic007G011400--Sobic001G094000 Sobic007G011400--Sobic007G205800 Sobic007G011400--Sobic002G157300 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic007G011400--Sobic010G263800 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic007G011400--Sobic002G313300 Sobic007G011400--Sobic009G040700 Sobic007G011400--Sobic002G157000 Sobic007G011400--Sobic001G162300 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic007G011400--Sobic008G034600 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic007G205800--Sobic007G011400 Sobic009G087800 Sobic009G087800 Sobic007G205800--Sobic009G087800 Sobic007G205800--Sobic010G263800 Sobic007G205800--Sobic008G034600 Sobic004G271900 Sobic004G271900 Sobic007G205800--Sobic004G271900 Sobic009G022200 Sobic009G022200 Sobic007G205800--Sobic009G022200 Sobic003G093600 Sobic003G093600 Sobic007G205800--Sobic003G093600 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic007G205800--Sobic003G258400 Sobic002G077200 Sobic002G077200 Sobic007G205800--Sobic002G077200 Sobic006G128900--Sobic006G209850 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic006G128900--Sobic001G511500 Sobic006G128900--Sobic004G031700 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic006G128900--Sobic009G000500 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic006G128900--Sobic001G090400 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic006G128900--Sobic003G445400 Sobic006G128900--Sobic003G268300 Sobic006G128900--Sobic001G477800 Sobic006G128900--Sobic002G157000
Octagon: transcription factors


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