Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G357200.1
Synonym Sb04g038370
Functional annotation zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed
UniProt C5XWR8
Pfam PF00642 PF15663
Panther DB PTHR15725 PTHR15725:SF4
NCBI CDD KOG4791; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02160 : CCCH-type zinc finger family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g58440.1 : zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032704
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G094650.1 , HORVU6Hr1G094650.2 , HORVU6Hr1G094650.3 , HORVU6Hr1G094650.4 , HORVU6Hr1G094650.5 , HORVU6Hr1G094650.7
Wheat TraesCS6A02G417600 , TraesCS6B02G471600 , TraesCS6D02G402800
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Gene co-expression network
sample Sobic004G357200 Sobic004G357200 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic004G357200--Sobic006G145000 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic004G357200--Sobic008G024600 Sobic006G021250 Sobic006G021250 Sobic004G357200--Sobic006G021250 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic004G357200--Sobic009G040700 Sobic001G543800 Sobic001G543800 Sobic004G357200--Sobic001G543800 Sobic007G096000 Sobic007G096000 Sobic004G357200--Sobic007G096000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic004G357200--Sobic003G113200 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic004G357200--Sobic006G128900 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic004G357200--Sobic003G280800 Sobic006G145000--Sobic009G040700 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic006G145000--Sobic005G077466 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic006G145000--Sobic001G094000 Sobic006G145000--Sobic004G357200 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic006G145000--Sobic006G246900 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic006G145000--Sobic007G011400 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic006G145000--Sobic006G009400 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic006G145000--Sobic007G205800 Sobic006G145000--Sobic006G128900 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic008G024600--Sobic006G209850 Sobic002G053000 Sobic002G053000 Sobic008G024600--Sobic002G053000 Sobic008G024600--Sobic006G128900 Sobic008G024600--Sobic009G040700 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic008G024600--Sobic010G129200 Sobic002G158700 Sobic002G158700 Sobic008G024600--Sobic002G158700 Sobic002G343800 Sobic002G343800 Sobic008G024600--Sobic002G343800 Sobic008G024600--Sobic003G280800 Sobic005G045300 Sobic005G045300 Sobic008G024600--Sobic005G045300 Sobic006G021250--Sobic006G209850 Sobic006G021250--Sobic003G280800 Sobic006G021250--Sobic008G024600 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic006G021250--Sobic002G173000 Sobic006G021250--Sobic003G113200 Sobic005G079025 Sobic005G079025 Sobic006G021250--Sobic005G079025 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic006G021250--Sobic005G032800 Sobic006G021250--Sobic006G128900 Sobic006G021250--Sobic005G077466 Sobic009G040700--Sobic001G094000 Sobic003G187400 Sobic003G187400 Sobic009G040700--Sobic003G187400 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic009G040700--Sobic005G149500 Sobic009G040700--Sobic007G011400 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic009G040700--Sobic002G157300 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic009G040700--Sobic001G477800 Sobic009G040700--Sobic006G145000 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic009G040700--Sobic004G196700 Sobic008G078100 Sobic008G078100 Sobic009G040700--Sobic008G078100 Sobic010G001600 Sobic010G001600 Sobic001G543800--Sobic010G001600 Sobic005G177800 Sobic005G177800 Sobic001G543800--Sobic005G177800 Sobic001G543800--Sobic006G128900 Sobic006G124900 Sobic006G124900 Sobic001G543800--Sobic006G124900 Sobic001G194900 Sobic001G194900 Sobic001G543800--Sobic001G194900 Sobic001G543800--Sobic004G196700 Sobic001G543800--Sobic008G024600 Sobic001G543800--Sobic009G040700 Sobic004G256600 Sobic004G256600 Sobic001G543800--Sobic004G256600 Sobic007G096000--Sobic003G280800 Sobic003G445400 Sobic003G445400 Sobic007G096000--Sobic003G445400 Sobic004G039700 Sobic004G039700 Sobic007G096000--Sobic004G039700 Sobic009G126400 Sobic009G126400 Sobic007G096000--Sobic009G126400 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic007G096000--Sobic003G084900 Sobic001G474600 Sobic001G474600 Sobic007G096000--Sobic001G474600 Sobic001G222500 Sobic001G222500 Sobic007G096000--Sobic001G222500 Sobic002G310200 Sobic002G310200 Sobic007G096000--Sobic002G310200 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic007G096000--Sobic009G000500 Sobic003G113200--Sobic006G128900 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic003G113200--Sobic001G111900 Sobic003G113200--Sobic006G021250 Sobic003G113200--Sobic003G280800 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic003G113200--Sobic005G039500 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic003G113200--Sobic007G178700 Sobic003G113200--Sobic006G209850 Sobic003G113200--Sobic008G024600 Sobic003G113200--Sobic005G032800 Sobic006G128900--Sobic006G209850 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic006G128900--Sobic001G511500 Sobic004G031700 Sobic004G031700 Sobic006G128900--Sobic004G031700 Sobic006G128900--Sobic009G000500 Sobic001G090400 Sobic001G090400 Sobic006G128900--Sobic001G090400 Sobic006G128900--Sobic003G445400 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic006G128900--Sobic003G268300 Sobic006G128900--Sobic001G477800 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic006G128900--Sobic002G157000 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic003G280800--Sobic002G309600 Sobic001G071400 Sobic001G071400 Sobic003G280800--Sobic001G071400 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic003G280800--Sobic002G134200 Sobic003G280800--Sobic006G209850 Sobic003G119000 Sobic003G119000 Sobic003G280800--Sobic003G119000 Sobic003G280800--Sobic001G474600 Sobic007G117400 Sobic007G117400 Sobic003G280800--Sobic007G117400 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic003G280800--Sobic006G216800 Sobic003G372700 Sobic003G372700 Sobic003G280800--Sobic003G372700
Octagon: transcription factors


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