Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G021250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RCS0
Pfam -
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF538
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g16330.1 : xa1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G209850 - -
2 Sobic.003G280800 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
3 Sobic.008G024600 expressed protein -
4 Sobic.002G173000 disease resistance protein RGA2, putative, expressed -
5 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G079025 - -
7 Sobic.005G032800 splicing factor, putative, expressed K13109: IK, RED, IK cytokine
8 Sobic.006G128900 cyclin-dependent kinase G-2, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
9 Sobic.005G077466 - -
10 Sobic.004G357200 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
11 Sobic.001G071400 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11293: HIRA, protein HIRA/HIR1
12 Sobic.007G178700 - -
13 Sobic.009G138800 crooked neck, putative, expressed K12869: CRN, CRNKL1, CLF1, crooked neck
14 Sobic.001G111900 - -
15 Sobic.001G511500 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K12837: splicing factor U2AF 65 kDa subunit
16 Sobic.006G145000 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
17 Sobic.002G006900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
18 Sobic.007G096000 expressed protein -
19 Sobic.008G173900 "OsPPKL3(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659913)@serine/threonine-protein phosphatase BSL2, putative, expressed -
20 Sobic.001G287201 - -


Gene co-expression network
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