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Transcriptome id Sobic.005G079025.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RH85
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NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G021250 - -
2 Sobic.006G209850 - -
3 Sobic.003G280800 RNA recognition motif family protein, expressed K13094: RNA-binding protein 5/10
4 Sobic.002G336800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G111900 - -
6 Sobic.002G031400 OsFBL39 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
7 Sobic.001G274200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
8 Sobic.009G138800 crooked neck, putative, expressed K12869: CRN, CRNKL1, CLF1, crooked neck
9 Sobic.008G011100 OsNucAP2 - Putative Nucleoporin Autopeptidase homologue, expressed -
10 Sobic.005G077466 - -
11 Sobic.003G252200 DDT, putative, expressed -
12 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G454401 - -
14 Sobic.002G396000 XPA-binding protein 2, putative, expressed K12867: SYF1, pre-mRNA-splicing factor SYF1
15 Sobic.009G005100 - -
16 Sobic.007G099100 - -
17 Sobic.007G161000 RecF/RecN/SMC N terminal domain containing protein, expressed K06636: structural maintenance of chromosome 1
18 Sobic.001G420200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
19 Sobic.003G254000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G035000 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase mraW, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G079025 Sobic005G079025 Sobic006G021250 Sobic006G021250 Sobic005G079025--Sobic006G021250 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic005G079025--Sobic006G209850 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic005G079025--Sobic003G280800 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic005G079025--Sobic002G336800 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic005G079025--Sobic001G111900 Sobic002G031400 Sobic002G031400 Sobic005G079025--Sobic002G031400 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic005G079025--Sobic001G274200 Sobic009G138800 Sobic009G138800 Sobic005G079025--Sobic009G138800 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic005G079025--Sobic008G011100 Sobic006G021250--Sobic006G209850 Sobic006G021250--Sobic003G280800 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic006G021250--Sobic008G024600 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic006G021250--Sobic002G173000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic006G021250--Sobic003G113200 Sobic006G021250--Sobic005G079025 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic006G021250--Sobic005G032800 Sobic006G128900 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Octagon: transcription factors


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