Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G099100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PGS6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G035900 expressed protein K13156: U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein
2 Sobic.003G254000 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G031400 OsFBL39 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
4 Sobic.010G277500 expressed protein -
5 Sobic.001G274200 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K11093: U1 small nuclear ribonucleoprotein 70kDa
6 Sobic.010G136600 - -
7 Sobic.002G064750 - -
8 Sobic.006G216800 AAA family ATPase, putative, expressed K13339: PEX6, peroxin-6
9 Sobic.006G209850 - -
10 Sobic.004G096600 - -
11 Sobic.001G124000 pinin/SDK/memA protein, putative, expressed K13114: pinin
12 Sobic.003G429650 - -
13 Sobic.002G144933 - -
14 Sobic.010G176550 - -
15 Sobic.010G279450 - K11446: KDM5, [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
16 Sobic.001G036050 - -
17 Sobic.004G208900 RNA-binding protein Luc7-like, putative, expressed -
18 Sobic.008G028700 SET domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G079025 - -
20 Sobic.004G209600 SWIM zinc finger family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G099100 Sobic007G099100 Sobic001G035900 Sobic001G035900 Sobic007G099100--Sobic001G035900 Sobic003G254000 Sobic003G254000 Sobic007G099100--Sobic003G254000 Sobic002G031400 Sobic002G031400 Sobic007G099100--Sobic002G031400 Sobic010G277500 Sobic010G277500 Sobic007G099100--Sobic010G277500 Sobic001G274200 Sobic001G274200 Sobic007G099100--Sobic001G274200 Sobic010G136600 Sobic010G136600 Sobic007G099100--Sobic010G136600 Sobic002G064750 Sobic002G064750 Sobic007G099100--Sobic002G064750 Sobic006G216800 Sobic006G216800 Sobic007G099100--Sobic006G216800 Sobic006G209850 Sobic006G209850 Sobic007G099100--Sobic006G209850 Sobic001G035900--Sobic003G254000 Sobic001G035900--Sobic002G031400 Sobic001G035900--Sobic002G064750 Sobic001G035900--Sobic007G099100 Sobic001G035900--Sobic001G274200 Sobic003G429650 Sobic003G429650 Sobic001G035900--Sobic003G429650 Sobic010G176550 Sobic010G176550 Sobic001G035900--Sobic010G176550 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic001G035900--Sobic007G161000 Sobic009G024000 Sobic009G024000 Sobic001G035900--Sobic009G024000 Sobic003G254000--Sobic001G035900 Sobic001G261573 Sobic001G261573 Sobic003G254000--Sobic001G261573 Sobic004G035000 Sobic004G035000 Sobic003G254000--Sobic004G035000 Sobic003G254000--Sobic002G031400 Sobic005G039500 Sobic005G039500 Sobic003G254000--Sobic005G039500 Sobic003G254000--Sobic002G064750 Sobic003G254000--Sobic001G274200 Sobic003G254000--Sobic007G099100 Sobic003G254000--Sobic003G429650 Sobic002G031400--Sobic010G277500 Sobic002G031400--Sobic007G161000 Sobic002G031400--Sobic001G035900 Sobic002G031400--Sobic003G254000 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic002G031400--Sobic008G011100 Sobic002G031400--Sobic010G176550 Sobic003G280800 Sobic003G280800 Sobic002G031400--Sobic003G280800 Sobic009G260500 Sobic009G260500 Sobic002G031400--Sobic009G260500 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic002G031400--Sobic004G258700 Sobic004G208900 Sobic004G208900 Sobic010G277500--Sobic004G208900 Sobic010G277500--Sobic006G209850 Sobic007G065400 Sobic007G065400 Sobic010G277500--Sobic007G065400 Sobic010G277500--Sobic009G260500 Sobic010G277500--Sobic003G280800 Sobic004G009600 Sobic004G009600 Sobic010G277500--Sobic004G009600 Sobic008G028700 Sobic008G028700 Sobic010G277500--Sobic008G028700 Sobic010G277500--Sobic004G258700 Sobic010G277500--Sobic006G216800 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic001G274200--Sobic001G420200 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic001G274200--Sobic007G096600 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic001G274200--Sobic003G268300 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic001G274200--Sobic008G173900 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G274200--Sobic002G144933 Sobic001G133466 Sobic001G133466 Sobic001G274200--Sobic001G133466 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic001G274200--Sobic007G037900 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic001G274200--Sobic002G243900 Sobic010G123901 Sobic010G123901 Sobic001G274200--Sobic010G123901 Sobic010G136600--Sobic007G096600 Sobic004G145500 Sobic004G145500 Sobic010G136600--Sobic004G145500 Sobic010G136600--Sobic002G144933 Sobic010G136600--Sobic008G173900 Sobic010G136600--Sobic008G028700 Sobic009G126400 Sobic009G126400 Sobic010G136600--Sobic009G126400 Sobic010G136600--Sobic010G277500 Sobic009G210500 Sobic009G210500 Sobic010G136600--Sobic009G210500 Sobic010G136600--Sobic004G009600 Sobic002G064750--Sobic001G035900 Sobic002G064750--Sobic003G254000 Sobic002G064750--Sobic003G429650 Sobic002G064750--Sobic007G099100 Sobic002G064750--Sobic001G274200 Sobic002G064750--Sobic002G031400 Sobic006G145200 Sobic006G145200 Sobic002G064750--Sobic006G145200 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic002G064750--Sobic006G182900 Sobic004G178500 Sobic004G178500 Sobic002G064750--Sobic004G178500 Sobic002G133400 Sobic002G133400 Sobic006G216800--Sobic002G133400 Sobic007G116200 Sobic007G116200 Sobic006G216800--Sobic007G116200 Sobic002G309600 Sobic002G309600 Sobic006G216800--Sobic002G309600 Sobic002G134200 Sobic002G134200 Sobic006G216800--Sobic002G134200 Sobic003G332800 Sobic003G332800 Sobic006G216800--Sobic003G332800 Sobic005G112300 Sobic005G112300 Sobic006G216800--Sobic005G112300 Sobic006G216800--Sobic003G280800 Sobic010G139000 Sobic010G139000 Sobic006G216800--Sobic010G139000 Sobic006G216800--Sobic010G277500 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic006G209850--Sobic006G128900 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic006G209850--Sobic001G511500 Sobic006G209850--Sobic003G280800 Sobic006G209850--Sobic010G277500 Sobic008G024600 Sobic008G024600 Sobic006G209850--Sobic008G024600 Sobic002G053000 Sobic002G053000 Sobic006G209850--Sobic002G053000 Sobic010G129200 Sobic010G129200 Sobic006G209850--Sobic010G129200 Sobic006G209850--Sobic004G145500 Sobic006G209850--Sobic002G243900
Octagon: transcription factors


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