Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G454401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SAP4
Pfam -
Panther DB PTHR34418
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G55540 : Nuclear pore complex protein
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049199
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2A02G100500 , TraesCS2D02G100000 , TraesCS2D02G100000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G111900 - -
2 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G262200 - -
4 Sobic.009G127900 - -
5 Sobic.005G110427 - -
6 Sobic.005G055150 - -
7 Sobic.006G145000 disease resistance RPP13-like protein 1, putative, expressed -
8 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
9 Sobic.005G141801 - -
10 Sobic.010G056000 GAGA-binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
12 Sobic.001G094000 expressed protein -
13 Sobic.001G464200 flap endonuclease, putative, expressed K10846: ERCC5, XPG, DNA excision repair protein ERCC-5
14 Sobic.007G178700 - -
15 Sobic.010G263800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@uncharacterized protein(PubMedID : 28640841)@UPF0183 protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G290800 GRAS family transcription factor(PubMedID : 23915383)@scarecrow, putative, expressed -
17 Sobic.001G543900 H(+)-ATPase 7(PubMedID : 26320239)@E1-E2 ATPase domain containing protein, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
18 Sobic.009G040700 "OsPPKL2(Ortholog in rice:Zhan et al., 2012)"(PubMedID : 31659919)@serine/threonine protein phosphatase, putative, expressed K01090: protein phosphatase
19 Sobic.005G077466 - -
20 Sobic.002G056100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic001G454401--Sobic001G111900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G454401--Sobic006G009400 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic001G454401--Sobic006G262200 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic001G454401--Sobic009G127900 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic001G454401--Sobic005G110427 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic001G454401--Sobic005G055150 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic001G454401--Sobic006G145000 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic001G454401--Sobic002G144966 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic001G454401--Sobic005G141801 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic001G111900--Sobic010G056000 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic001G111900--Sobic009G161600 Sobic001G111900--Sobic009G127900 Sobic001G111900--Sobic001G454401 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic001G111900--Sobic007G178700 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic001G111900--Sobic005G077466 Sobic001G111900--Sobic006G262200 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic001G111900--Sobic003G084900 Sobic001G111900--Sobic006G009400 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic006G262200--Sobic005G110427 Sobic006G262200--Sobic006G009400 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G262200--Sobic002G051450 Sobic006G262200--Sobic001G111900 Sobic006G262200--Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic005G055150 Sobic006G262200--Sobic001G454401 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic005G141801 Sobic009G127900--Sobic007G178700 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic009G127900--Sobic003G268300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic009G127900--Sobic001G446900 Sobic006G066650 Sobic006G066650 Sobic009G127900--Sobic006G066650 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic009G127900--Sobic004G290800 Sobic010G026400 Sobic010G026400 Sobic009G127900--Sobic010G026400 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic009G127900--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic009G127900--Sobic008G173900 Sobic009G127900--Sobic001G111900 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic005G055150--Sobic006G009400 Sobic005G055150--Sobic005G141801 Sobic005G055150--Sobic005G110427 Sobic005G055150--Sobic001G111900 Sobic005G055150--Sobic006G262200 Sobic005G055150--Sobic009G127900 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic005G055150--Sobic002G410200 Sobic005G055150--Sobic009G209800 Sobic005G055150--Sobic007G178700 Sobic009G040700 Sobic009G040700 Sobic006G145000--Sobic009G040700 Sobic006G145000--Sobic005G077466 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic006G145000--Sobic001G094000 Sobic004G357200 Sobic004G357200 Sobic006G145000--Sobic004G357200 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic006G145000--Sobic006G246900 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic006G145000--Sobic007G011400 Sobic006G145000--Sobic006G009400 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic006G145000--Sobic007G205800 Sobic006G128900 Sobic006G128900 Sobic006G145000--Sobic006G128900 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic002G144966--Sobic001G464200 Sobic002G144966--Sobic006G262200 Sobic002G144966--Sobic005G077466 Sobic002G144966--Sobic001G111900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic002G144966--Sobic003G087400 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic002G144966--Sobic009G065100 Sobic006G076300 Sobic006G076300 Sobic002G144966--Sobic006G076300 Sobic004G039700 Sobic004G039700 Sobic002G144966--Sobic004G039700 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic002G144966--Sobic001G511500 Sobic005G141801--Sobic005G055150 Sobic005G141801--Sobic006G009400 Sobic010G074500 Sobic010G074500 Sobic005G141801--Sobic010G074500 Sobic005G141801--Sobic001G111900 Sobic005G141801--Sobic010G263800 Sobic005G141801--Sobic006G262200 Sobic005G141801--Sobic005G110427 Sobic005G141801--Sobic002G051450 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic005G141801--Sobic009G117400
Octagon: transcription factors


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