Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G262200.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RGB1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.006G262200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110427 - -
2 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G051450 - -
4 Sobic.001G111900 - -
5 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
6 Sobic.005G055150 - -
7 Sobic.001G454401 - -
8 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
9 Sobic.005G141801 - -
10 Sobic.003G031750 - -
11 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G077400 - -
13 Sobic.001G267233 - -
14 Sobic.009G045700 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
15 Sobic.007G178700 - -
16 Sobic.008G036500 - -
17 Sobic.010G263800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@uncharacterized protein(PubMedID : 28640841)@UPF0183 protein, putative, expressed -
18 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
20 Sobic.008G026100 xa1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic006G262200--Sobic005G110427 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic006G262200--Sobic006G009400 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G262200--Sobic002G051450 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic006G262200--Sobic001G111900 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic002G144966 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G262200--Sobic005G055150 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic006G262200--Sobic001G454401 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic004G005400 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic006G262200--Sobic005G141801 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic002G051450--Sobic006G009400 Sobic002G051450--Sobic006G262200 Sobic005G015100 Sobic005G015100 Sobic002G051450--Sobic005G015100 Sobic002G051450--Sobic010G263800 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic002G051450--Sobic008G034600 Sobic004G256600 Sobic004G256600 Sobic002G051450--Sobic004G256600 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic002G051450--Sobic009G045700 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic002G051450--Sobic009G004700 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic002G051450--Sobic005G077400 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic001G111900--Sobic010G056000 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic001G111900--Sobic009G161600 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic001G111900--Sobic009G127900 Sobic001G111900--Sobic001G454401 Sobic001G111900--Sobic007G178700 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic001G111900--Sobic005G077466 Sobic001G111900--Sobic006G262200 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic001G111900--Sobic003G084900 Sobic001G111900--Sobic006G009400 Sobic001G464200 Sobic001G464200 Sobic002G144966--Sobic001G464200 Sobic002G144966--Sobic006G262200 Sobic002G144966--Sobic005G077466 Sobic002G144966--Sobic001G111900 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic002G144966--Sobic003G087400 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic002G144966--Sobic009G065100 Sobic006G076300 Sobic006G076300 Sobic002G144966--Sobic006G076300 Sobic004G039700 Sobic004G039700 Sobic002G144966--Sobic004G039700 Sobic001G511500 Sobic001G511500 Sobic002G144966--Sobic001G511500 Sobic005G055150--Sobic006G009400 Sobic005G055150--Sobic005G141801 Sobic005G055150--Sobic005G110427 Sobic005G055150--Sobic001G111900 Sobic005G055150--Sobic006G262200 Sobic005G055150--Sobic009G127900 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic005G055150--Sobic002G410200 Sobic005G055150--Sobic009G209800 Sobic005G055150--Sobic007G178700 Sobic001G454401--Sobic001G111900 Sobic001G454401--Sobic006G009400 Sobic001G454401--Sobic006G262200 Sobic001G454401--Sobic009G127900 Sobic001G454401--Sobic005G110427 Sobic001G454401--Sobic005G055150 Sobic006G145000 Sobic006G145000 Sobic001G454401--Sobic006G145000 Sobic001G454401--Sobic002G144966 Sobic001G454401--Sobic005G141801 Sobic004G005400--Sobic005G110427 Sobic004G005400--Sobic006G262200 Sobic004G005400--Sobic006G009400 Sobic004G005400--Sobic010G263800 Sobic004G005400--Sobic005G221425 Sobic004G005400--Sobic009G209800 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic004G005400--Sobic003G346000 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic004G005400--Sobic003G031750 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic004G005400--Sobic008G079100 Sobic005G141801--Sobic005G055150 Sobic005G141801--Sobic006G009400 Sobic010G074500 Sobic010G074500 Sobic005G141801--Sobic010G074500 Sobic005G141801--Sobic001G111900 Sobic005G141801--Sobic010G263800 Sobic005G141801--Sobic006G262200 Sobic005G141801--Sobic005G110427 Sobic005G141801--Sobic002G051450 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic005G141801--Sobic009G117400
Octagon: transcription factors


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