Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G045700.3,Sobic.009G045700.2,Sobic.009G045700.4,Sobic.009G045700.1
Synonym Sb09g003910
Functional annotation E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R0V4 , A0A1Z5R0V6 , C5Z051
Pfam PF03145
Panther DB PTHR10315 PTHR10315:SF35
NCBI CDD -
KEGG Orthology K04506; E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
Gene Ontology GO:0007275; multicellular organism development GO:0006511ubiquitin-dependent protein catabolic process GO:0005634nucleus


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G37870 : Protein with RING/U-box and TRAF-like domains
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g06070.1 : E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.009G045700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G113600 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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