Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G191400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PMU5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G330400 pentatricopeptide, putative, expressed -
2 Sobic.001G303675 - -
3 Sobic.004G211400 Putative splicing factor(PubMedID : 24356560)@splicing factor, arginine/serine-rich 7, putative, expressed K12896: splicing factor, arginine/serine-rich 7
4 Sobic.003G163100 expressed protein K08819: cyclin-dependent kinase 12/13
5 Sobic.002G209600 CBS domain containing protein, expressed -
6 Sobic.008G136200 spotted leaf 11, putative, expressed -
7 Sobic.002G151600 R-interacting factor 1, putative, expressed -
8 Sobic.009G045700 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
9 Sobic.007G052900 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
10 Sobic.005G077933 - -
11 Sobic.006G210100 zinc finger domain, LSD1 subclass family protein, expressed -
12 Sobic.006G263700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G034600 protein kinase PKN/PRK1, effector, putative, expressed -
14 Sobic.005G077400 - -
15 Sobic.009G251300 endonuclease, putative, expressed -
16 Sobic.003G020100 - -
17 Sobic.008G068400 - -
18 Sobic.002G144933 - -
19 Sobic.004G290800 GRAS family transcription factor(PubMedID : 23915383)@scarecrow, putative, expressed -
20 Sobic.002G051450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G191400 Sobic006G191400 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic006G191400--Sobic002G330400 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic006G191400--Sobic001G303675 Sobic004G211400 Sobic004G211400 Sobic006G191400--Sobic004G211400 Sobic003G163100 Sobic003G163100 Sobic006G191400--Sobic003G163100 Sobic002G209600 Sobic002G209600 Sobic006G191400--Sobic002G209600 Sobic008G136200 Sobic008G136200 Sobic006G191400--Sobic008G136200 Sobic002G151600 Sobic002G151600 Sobic006G191400--Sobic002G151600 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic006G191400--Sobic009G045700 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic006G191400--Sobic007G052900 Sobic006G263700 Sobic006G263700 Sobic002G330400--Sobic006G263700 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic002G330400--Sobic004G016500 Sobic002G330400--Sobic006G191400 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic002G330400--Sobic001G046600 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic002G330400--Sobic001G543900 Sobic009G251300 Sobic009G251300 Sobic002G330400--Sobic009G251300 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic002G330400--Sobic005G187200 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic002G330400--Sobic001G479500 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic002G330400--Sobic006G009400 Sobic001G306900 Sobic001G306900 Sobic001G303675--Sobic001G306900 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic001G303675--Sobic001G094000 Sobic002G144933 Sobic002G144933 Sobic001G303675--Sobic002G144933 Sobic009G100050 Sobic009G100050 Sobic001G303675--Sobic009G100050 Sobic005G015900 Sobic005G015900 Sobic001G303675--Sobic005G015900 Sobic002G320500 Sobic002G320500 Sobic001G303675--Sobic002G320500 Sobic004G096500 Sobic004G096500 Sobic001G303675--Sobic004G096500 Sobic001G303675--Sobic002G151600 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic001G303675--Sobic003G170100 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic004G211400--Sobic008G034600 Sobic009G022200 Sobic009G022200 Sobic004G211400--Sobic009G022200 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic004G211400--Sobic007G205800 Sobic002G157200 Sobic002G157200 Sobic004G211400--Sobic002G157200 Sobic007G224900 Sobic007G224900 Sobic004G211400--Sobic007G224900 Sobic004G211400--Sobic006G191400 Sobic003G258400 Sobic003G258400 Sobic004G211400--Sobic003G258400 Sobic004G211400--Sobic008G136200 Sobic001G428400 Sobic001G428400 Sobic004G211400--Sobic001G428400 Sobic006G210100 Sobic006G210100 Sobic003G163100--Sobic006G210100 Sobic001G360900 Sobic001G360900 Sobic003G163100--Sobic001G360900 Sobic001G253200 Sobic001G253200 Sobic003G163100--Sobic001G253200 Sobic003G163100--Sobic001G303675 Sobic003G163100--Sobic009G251300 Sobic003G163100--Sobic006G191400 Sobic003G163100--Sobic002G151600 Sobic003G185250 Sobic003G185250 Sobic003G163100--Sobic003G185250 Sobic003G163100--Sobic009G045700 Sobic004G246800 Sobic004G246800 Sobic002G209600--Sobic004G246800 Sobic002G209600--Sobic007G052900 Sobic002G209600--Sobic006G191400 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic002G209600--Sobic001G269300 Sobic002G209600--Sobic009G251300 Sobic005G063700 Sobic005G063700 Sobic002G209600--Sobic005G063700 Sobic008G131700 Sobic008G131700 Sobic002G209600--Sobic008G131700 Sobic007G076700 Sobic007G076700 Sobic002G209600--Sobic007G076700 Sobic002G209600--Sobic002G330400 Sobic008G136200--Sobic002G144933 Sobic008G136200--Sobic007G205800 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic008G136200--Sobic007G011400 Sobic009G215800 Sobic009G215800 Sobic008G136200--Sobic009G215800 Sobic009G065100 Sobic009G065100 Sobic008G136200--Sobic009G065100 Sobic008G136200--Sobic001G094000 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic008G136200--Sobic002G157000 Sobic003G197800 Sobic003G197800 Sobic008G136200--Sobic003G197800 Sobic009G087800 Sobic009G087800 Sobic008G136200--Sobic009G087800 Sobic002G151600--Sobic002G157000 Sobic002G151600--Sobic003G197800 Sobic002G151600--Sobic002G320500 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic002G151600--Sobic002G313300 Sobic009G000500 Sobic009G000500 Sobic002G151600--Sobic009G000500 Sobic002G151600--Sobic001G094000 Sobic002G151600--Sobic009G065100 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic002G151600--Sobic002G248400 Sobic002G151600--Sobic001G303675 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic009G045700--Sobic002G051450 Sobic009G045700--Sobic006G009400 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic009G045700--Sobic006G262200 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic009G045700--Sobic009G004700 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic009G045700--Sobic010G263800 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic009G045700--Sobic010G144100 Sobic009G045700--Sobic008G034600 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic009G045700--Sobic002G144966 Sobic008G153600 Sobic008G153600 Sobic009G045700--Sobic008G153600 Sobic010G056200 Sobic010G056200 Sobic007G052900--Sobic010G056200 Sobic004G113800 Sobic004G113800 Sobic007G052900--Sobic004G113800 Sobic007G052900--Sobic002G209600 Sobic010G005600 Sobic010G005600 Sobic007G052900--Sobic010G005600 Sobic004G083700 Sobic004G083700 Sobic007G052900--Sobic004G083700 Sobic007G054000 Sobic007G054000 Sobic007G052900--Sobic007G054000 Sobic010G280100 Sobic010G280100 Sobic007G052900--Sobic010G280100 Sobic006G180432 Sobic006G180432 Sobic007G052900--Sobic006G180432 Sobic007G052900--Sobic009G065100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.