Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G209600.4,Sobic.002G209600.3,Sobic.002G209600.1
Synonym Sb02g025370
Functional annotation CBS domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0W555 , C5XDJ6
Pfam PF13041 PF01535 PF13812 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF346
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G10690 : pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein / CBS domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g26190.1 : CBS domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040530 , Zm00025a047092 , Zm00025a013943
Brachypodium KQJ90305 , KQJ90339 , KQJ90340 , KQJ90341
Barley HORVU5Hr1G063380.4 , HORVU5Hr1G063380.19 , HORVU5Hr1G063380.18 , HORVU5Hr1G063380.17 , HORVU5Hr1G063380.16 , HORVU5Hr1G063380.15 , HORVU5Hr1G063380.14 , HORVU5Hr1G063380.13 , HORVU5Hr1G063380.12 , HORVU5Hr1G063380.11 , HORVU5Hr1G063380.10 , HORVU5Hr1G063380.30 , HORVU5Hr1G063380.7 , HORVU5Hr1G063380.6 , HORVU5Hr1G063380.5 , HORVU5Hr1G063380.3 , HORVU5Hr1G063380.2 , HORVU5Hr1G063380.1 , HORVU5Hr1G063380.9 , HORVU5Hr1G063380.8 , HORVU5Hr1G063380.26 , HORVU5Hr1G063380.27 , HORVU5Hr1G063380.24 , HORVU5Hr1G063380.25 , HORVU5Hr1G063380.22 , HORVU5Hr1G063380.23 , HORVU5Hr1G063380.20 , HORVU5Hr1G063380.21 , HORVU5Hr1G063380.28 , HORVU5Hr1G063380.29
Wheat TraesCS5B02G216600 , TraesCS5A02G217600 , TraesCS5D02G225619
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G209600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G246800 pentatricopeptide, putative, expressed -
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18 Sobic.004G151900 - -
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Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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