Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G077933.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RH73
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005336
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G251300 endonuclease, putative, expressed -
2 Sobic.006G191400 - -
3 Sobic.010G144100 - -
4 Sobic.002G124200 expressed protein -
5 Sobic.009G045700 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
6 Sobic.008G068400 - -
7 Sobic.008G021700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed -
8 Sobic.002G209600 CBS domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G141801 - -
10 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
11 Sobic.002G330400 pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.003G201750 - -
13 Sobic.003G089650 - -
14 Sobic.005G077466 - -
15 Sobic.005G055150 - -
16 Sobic.007G094801 - -
17 Sobic.006G263700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G136200 spotted leaf 11, putative, expressed -
19 Sobic.003G163100 expressed protein K08819: cyclin-dependent kinase 12/13
20 Sobic.007G052900 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G077933 Sobic005G077933 Sobic009G251300 Sobic009G251300 Sobic005G077933--Sobic009G251300 Sobic006G191400 Sobic006G191400 Sobic005G077933--Sobic006G191400 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic005G077933--Sobic010G144100 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic005G077933--Sobic002G124200 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic005G077933--Sobic009G045700 Sobic008G068400 Sobic008G068400 Sobic005G077933--Sobic008G068400 Sobic008G021700 Sobic008G021700 Sobic005G077933--Sobic008G021700 Sobic002G209600 Sobic002G209600 Sobic005G077933--Sobic002G209600 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic005G077933--Sobic005G141801 Sobic004G151900 Sobic004G151900 Sobic009G251300--Sobic004G151900 Sobic009G251300--Sobic008G021700 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic009G251300--Sobic002G330400 Sobic003G163100 Sobic003G163100 Sobic009G251300--Sobic003G163100 Sobic009G251300--Sobic002G209600 Sobic004G016500 Sobic004G016500 Sobic009G251300--Sobic004G016500 Sobic001G046600 Sobic001G046600 Sobic009G251300--Sobic001G046600 Sobic009G251300--Sobic005G077933 Sobic009G251300--Sobic006G191400 Sobic006G191400--Sobic002G330400 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic006G191400--Sobic001G303675 Sobic004G211400 Sobic004G211400 Sobic006G191400--Sobic004G211400 Sobic006G191400--Sobic003G163100 Sobic006G191400--Sobic002G209600 Sobic008G136200 Sobic008G136200 Sobic006G191400--Sobic008G136200 Sobic002G151600 Sobic002G151600 Sobic006G191400--Sobic002G151600 Sobic006G191400--Sobic009G045700 Sobic007G052900 Sobic007G052900 Sobic006G191400--Sobic007G052900 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic010G144100--Sobic002G056100 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic010G144100--Sobic003G031750 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic010G144100--Sobic001G240400 Sobic010G144100--Sobic009G045700 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic010G144100--Sobic001G305400 Sobic010G144100--Sobic005G141801 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic010G144100--Sobic008G091900 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic010G144100--Sobic002G221200 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic010G144100--Sobic008G036500 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic002G124200--Sobic007G142050 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic002G124200--Sobic005G001900 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic002G124200--Sobic003G089650 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G124200--Sobic004G169501 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic002G124200--Sobic003G315332 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic002G124200--Sobic002G181450 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic002G124200--Sobic010G263800 Sobic007G094801 Sobic007G094801 Sobic002G124200--Sobic007G094801 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic002G124200--Sobic002G182300 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic009G045700--Sobic002G051450 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic009G045700--Sobic006G009400 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic009G045700--Sobic006G262200 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic009G045700--Sobic009G004700 Sobic009G045700--Sobic010G263800 Sobic009G045700--Sobic010G144100 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic009G045700--Sobic008G034600 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic009G045700--Sobic002G144966 Sobic008G153600 Sobic008G153600 Sobic009G045700--Sobic008G153600 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic008G068400--Sobic009G197200 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic008G068400--Sobic006G132200 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic008G068400--Sobic007G115000 Sobic005G212500 Sobic005G212500 Sobic008G068400--Sobic005G212500 Sobic008G068400--Sobic009G004700 Sobic008G068400--Sobic010G144100 Sobic008G068400--Sobic003G031750 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic008G068400--Sobic002G062300 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic008G068400--Sobic003G424100 Sobic008G021700--Sobic004G151900 Sobic008G021700--Sobic009G251300 Sobic005G022800 Sobic005G022800 Sobic008G021700--Sobic005G022800 Sobic004G246800 Sobic004G246800 Sobic008G021700--Sobic004G246800 Sobic001G076200 Sobic001G076200 Sobic008G021700--Sobic001G076200 Sobic008G021700--Sobic002G209600 Sobic001G142400 Sobic001G142400 Sobic008G021700--Sobic001G142400 Sobic008G021700--Sobic005G077933 Sobic001G061600 Sobic001G061600 Sobic008G021700--Sobic001G061600 Sobic002G209600--Sobic004G246800 Sobic002G209600--Sobic007G052900 Sobic002G209600--Sobic006G191400 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic002G209600--Sobic001G269300 Sobic002G209600--Sobic009G251300 Sobic005G063700 Sobic005G063700 Sobic002G209600--Sobic005G063700 Sobic008G131700 Sobic008G131700 Sobic002G209600--Sobic008G131700 Sobic007G076700 Sobic007G076700 Sobic002G209600--Sobic007G076700 Sobic002G209600--Sobic002G330400 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic005G141801--Sobic005G055150 Sobic005G141801--Sobic006G009400 Sobic010G074500 Sobic010G074500 Sobic005G141801--Sobic010G074500 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic005G141801--Sobic001G111900 Sobic005G141801--Sobic010G263800 Sobic005G141801--Sobic006G262200 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic005G141801--Sobic005G110427 Sobic005G141801--Sobic002G051450 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic005G141801--Sobic009G117400
Octagon: transcription factors


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