Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G124200.2
Synonym Sb02g010715
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W3K1
Pfam -
Panther DB PTHR31639 PTHR31639:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G13570 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g06600.1 : OsFBX187 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G124200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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13 Sobic.010G144100 - -
14 Sobic.002G039600 - -
15 Sobic.K024000 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
16 Sobic.003G435600 CBS domain-containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.003G201750 - -
18 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
19 Sobic.002G330400 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.003G031750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic002G124200--Sobic007G142050 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic002G124200--Sobic005G001900 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic002G124200--Sobic003G089650 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G124200--Sobic004G169501 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic002G124200--Sobic003G315332 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic002G124200--Sobic002G181450 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic002G124200--Sobic010G263800 Sobic007G094801 Sobic007G094801 Sobic002G124200--Sobic007G094801 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic002G124200--Sobic002G182300 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic007G089600 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic007G142050--Sobic008G068800 Sobic007G142050--Sobic003G315332 Sobic007G142050--Sobic004G169501 Sobic007G142050--Sobic002G124200 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic005G001900 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic004G076732 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic007G142050--Sobic009G059600 Sobic005G001900--Sobic007G142050 Sobic003G201750 Sobic003G201750 Sobic005G001900--Sobic003G201750 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic005G001900--Sobic006G088580 Sobic005G001900--Sobic002G181450 Sobic005G001900--Sobic002G124200 Sobic005G001900--Sobic007G089600 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic005G001900--Sobic009G104300 Sobic005G001900--Sobic003G315332 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic005G001900--Sobic004G112500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic003G089650--Sobic009G113600 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic003G089650--Sobic002G062300 SobicK024000 SobicK024000 Sobic003G089650--SobicK024000 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic003G089650--Sobic002G056100 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic003G089650--Sobic008G009500 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic003G089650--Sobic005G221425 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic003G089650--Sobic001G253100 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic003G089650--Sobic008G042250 Sobic003G089650--Sobic007G073400 Sobic004G169501--Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic007G142050 Sobic004G169501--Sobic008G068800 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic004G169501--Sobic007G116400 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic004G169501--Sobic008G117200 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic004G169501--Sobic003G204000 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic004G169501--Sobic001G267233 Sobic004G169501--Sobic002G181450 Sobic004G169501--Sobic007G089600 Sobic003G315332--Sobic004G169501 Sobic003G315332--Sobic007G142050 Sobic002G076400 Sobic002G076400 Sobic003G315332--Sobic002G076400 Sobic003G315332--Sobic008G068800 Sobic006G129700 Sobic006G129700 Sobic003G315332--Sobic006G129700 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic003G315332--Sobic001G543900 Sobic003G315332--Sobic010G263800 Sobic003G315332--Sobic003G204000 Sobic003G315332--Sobic007G089600 Sobic002G181450--Sobic004G169501 Sobic002G181450--Sobic007G142050 Sobic002G181450--Sobic005G001900 Sobic002G181450--Sobic003G315332 Sobic002G181450--Sobic007G089600 Sobic002G181450--Sobic003G204000 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic002G181450--Sobic002G073300 Sobic002G181450--Sobic002G124200 Sobic002G181450--Sobic002G076400 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic010G263800--Sobic006G009400 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic010G263800--Sobic007G011400 Sobic002G077200 Sobic002G077200 Sobic010G263800--Sobic002G077200 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic010G263800--Sobic002G313300 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic010G263800--Sobic002G157300 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic010G263800--Sobic007G205800 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic010G263800--Sobic009G117400 Sobic001G347600 Sobic001G347600 Sobic010G263800--Sobic001G347600 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic010G263800--Sobic008G034600 Sobic010G074500 Sobic010G074500 Sobic007G094801--Sobic010G074500 Sobic007G094801--Sobic010G263800 Sobic007G094801--Sobic007G011400 Sobic007G094801--Sobic008G034600 Sobic007G094801--Sobic006G129700 Sobic007G094801--Sobic003G315332 Sobic007G094801--Sobic007G205800 Sobic007G191100 Sobic007G191100 Sobic007G094801--Sobic007G191100 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic007G094801--Sobic004G143700 Sobic002G182300--Sobic004G169501 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic002G182300--Sobic010G139301 Sobic002G182300--Sobic002G073300 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic002G182300--Sobic005G099150 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic002G182300--Sobic004G045566 Sobic002G182300--Sobic002G124200 Sobic002G182300--Sobic002G181450 Sobic002G182300--Sobic007G142050 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic002G182300--Sobic006G068400
Octagon: transcription factors


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