Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G001900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PPF5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.005G001900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G142050 - -
2 Sobic.003G201750 - -
3 Sobic.006G088580 - -
4 Sobic.002G181450 - -
5 Sobic.002G124200 expressed protein -
6 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
7 Sobic.009G104300 - -
8 Sobic.003G315332 - K15421: secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor
9 Sobic.004G112500 - -
10 Sobic.004G233300 - -
11 Sobic.001G271801 - -
12 Sobic.001G543900 H(+)-ATPase 7(PubMedID : 26320239)@E1-E2 ATPase domain containing protein, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
13 Sobic.004G169501 - -
14 Sobic.003G204000 expressed protein -
15 Sobic.001G271900 - -
16 Sobic.002G166600 cyclin, putative, expressed -
17 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -
18 Sobic.006G137400 - -
19 Sobic.010G124001 - -
20 Sobic.003G006833 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic005G001900--Sobic007G142050 Sobic003G201750 Sobic003G201750 Sobic005G001900--Sobic003G201750 Sobic006G088580 Sobic006G088580 Sobic005G001900--Sobic006G088580 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic005G001900--Sobic002G181450 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic005G001900--Sobic002G124200 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic005G001900--Sobic007G089600 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic005G001900--Sobic009G104300 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic005G001900--Sobic003G315332 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic005G001900--Sobic004G112500 Sobic007G142050--Sobic007G089600 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic007G142050--Sobic008G068800 Sobic007G142050--Sobic003G315332 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic007G142050--Sobic004G169501 Sobic007G142050--Sobic002G124200 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic005G001900 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic004G076732 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic007G142050--Sobic009G059600 Sobic003G201750--Sobic005G001900 Sobic003G201750--Sobic006G088580 Sobic001G269300 Sobic001G269300 Sobic003G201750--Sobic001G269300 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic003G201750--Sobic002G330400 Sobic006G048775 Sobic006G048775 Sobic003G201750--Sobic006G048775 Sobic006G137400 Sobic006G137400 Sobic003G201750--Sobic006G137400 Sobic003G006833 Sobic003G006833 Sobic003G201750--Sobic003G006833 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic003G201750--Sobic007G037900 Sobic007G037100 Sobic007G037100 Sobic003G201750--Sobic007G037100 Sobic010G124001 Sobic010G124001 Sobic006G088580--Sobic010G124001 Sobic001G067850 Sobic001G067850 Sobic006G088580--Sobic001G067850 Sobic006G088580--Sobic005G001900 Sobic006G088580--Sobic007G037900 Sobic006G088580--Sobic004G112500 Sobic008G167300 Sobic008G167300 Sobic006G088580--Sobic008G167300 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic006G088580--Sobic006G246900 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic006G088580--Sobic006G009400 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic006G088580--Sobic005G055150 Sobic002G181450--Sobic004G169501 Sobic002G181450--Sobic007G142050 Sobic002G181450--Sobic005G001900 Sobic002G181450--Sobic003G315332 Sobic002G181450--Sobic007G089600 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic002G181450--Sobic003G204000 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic002G181450--Sobic002G073300 Sobic002G181450--Sobic002G124200 Sobic002G076400 Sobic002G076400 Sobic002G181450--Sobic002G076400 Sobic002G124200--Sobic007G142050 Sobic002G124200--Sobic005G001900 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic002G124200--Sobic003G089650 Sobic002G124200--Sobic004G169501 Sobic002G124200--Sobic003G315332 Sobic002G124200--Sobic002G181450 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic002G124200--Sobic010G263800 Sobic007G094801 Sobic007G094801 Sobic002G124200--Sobic007G094801 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic002G124200--Sobic002G182300 Sobic007G089600--Sobic007G142050 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic007G089600--Sobic010G139301 Sobic007G089600--Sobic004G169501 Sobic007G089600--Sobic008G068800 Sobic007G089600--Sobic003G315332 Sobic007G089600--Sobic009G104300 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic007G089600--Sobic001G272000 SobicK009900 SobicK009900 Sobic007G089600--SobicK009900 Sobic007G089600--Sobic005G001900 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic009G104300--Sobic007G116400 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic009G104300--Sobic006G080300 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic009G104300--Sobic003G170100 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic009G104300--Sobic001G094000 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic009G104300--Sobic001G543900 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic009G104300--Sobic001G454301 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic009G104300--Sobic007G137900 Sobic009G104300--Sobic001G272000 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic009G104300--Sobic001G477800 Sobic003G315332--Sobic004G169501 Sobic003G315332--Sobic007G142050 Sobic003G315332--Sobic002G076400 Sobic003G315332--Sobic008G068800 Sobic006G129700 Sobic006G129700 Sobic003G315332--Sobic006G129700 Sobic003G315332--Sobic001G543900 Sobic003G315332--Sobic010G263800 Sobic003G315332--Sobic003G204000 Sobic003G315332--Sobic007G089600 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic004G112500--Sobic001G024200 Sobic004G212800 Sobic004G212800 Sobic004G112500--Sobic004G212800 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic004G112500--Sobic007G211000 Sobic004G112500--Sobic001G543900 Sobic004G164600 Sobic004G164600 Sobic004G112500--Sobic004G164600 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic004G112500--Sobic010G248200 Sobic004G112500--Sobic010G124001 Sobic008G157950 Sobic008G157950 Sobic004G112500--Sobic008G157950 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic004G112500--Sobic008G042250
Octagon: transcription factors


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