Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G166600.1,Sobic.002G166600.2
Synonym Sb02g021060
Functional annotation cyclin, putative, expressed
UniProt C5X948
Pfam -
Panther DB PTHR15615 PTHR15615:SF25
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G05327 : Cyclin family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g25950.1 : cyclin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G166600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G166700 cyclin, putative, expressed -
2 Sobic.001G543900 H(+)-ATPase 7(PubMedID : 26320239)@E1-E2 ATPase domain containing protein, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
3 Sobic.002G001600 MBTB12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.009G104300 - -
5 Sobic.008G116500 plus-3 domain containing protein, expressed K15178: RNA polymerase-associated protein RTF1
6 Sobic.001G272000 - -
7 Sobic.001G271801 - -
8 Sobic.005G110427 - -
9 Sobic.007G137900 nucleoside-triphosphatase, putative, expressed K01510: ENTPD1_3_8, apyrase
10 Sobic.001G257300 OsFBL52 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
11 Sobic.003G220200 protein kinase family protein, putative, expressed K17541: SCY1-like protein 2
12 Sobic.001G271900 - -
13 Sobic.001G152320 - -
14 Sobic.006G080300 SET domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G287301 - -
16 Sobic.001G206100 expressed protein -
17 Sobic.001G162300 KH domain containing protein, putative, expressed K13162: poly(rC)-binding protein 2
18 Sobic.007G185900 IBR domain containing protein, putative, expressed K11968: ariadne-1
19 Sobic.005G096800 - -
20 Sobic.008G106000 eukaryotic translation initiation factor 5B, putative, expressed K03243: translation initiation factor 5B


Gene co-expression network
sample Sobic002G166600 Sobic002G166600 Sobic002G166700 Sobic002G166700 Sobic002G166600--Sobic002G166700 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic002G166600--Sobic001G543900 Sobic002G001600 Sobic002G001600 Sobic002G166600--Sobic002G001600 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic002G166600--Sobic009G104300 Sobic008G116500 Sobic008G116500 Sobic002G166600--Sobic008G116500 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic002G166600--Sobic001G272000 Sobic001G271801 Sobic001G271801 Sobic002G166600--Sobic001G271801 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic002G166600--Sobic005G110427 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic002G166600--Sobic007G137900 Sobic002G166700--Sobic002G166600 Sobic002G166700--Sobic001G543900 Sobic002G166700--Sobic002G001600 Sobic002G166700--Sobic001G272000 Sobic007G211000 Sobic007G211000 Sobic002G166700--Sobic007G211000 Sobic002G166700--Sobic008G116500 Sobic010G124001 Sobic010G124001 Sobic002G166700--Sobic010G124001 Sobic001G271900 Sobic001G271900 Sobic002G166700--Sobic001G271900 Sobic007G037100 Sobic007G037100 Sobic002G166700--Sobic007G037100 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic001G543900--Sobic001G477800 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic001G543900--Sobic002G313300 Sobic004G112500 Sobic004G112500 Sobic001G543900--Sobic004G112500 Sobic001G543900--Sobic002G001600 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic001G543900--Sobic006G009400 Sobic001G543900--Sobic002G166700 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic001G543900--Sobic005G130200 Sobic001G543900--Sobic001G272000 Sobic010G248200 Sobic010G248200 Sobic001G543900--Sobic010G248200 Sobic002G001600--Sobic008G116500 Sobic002G001600--Sobic001G543900 Sobic002G001600--Sobic002G313300 Sobic008G101800 Sobic008G101800 Sobic002G001600--Sobic008G101800 Sobic007G185900 Sobic007G185900 Sobic002G001600--Sobic007G185900 Sobic002G001600--Sobic002G166700 Sobic008G106000 Sobic008G106000 Sobic002G001600--Sobic008G106000 Sobic002G001600--Sobic007G037100 Sobic002G001600--Sobic002G166600 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic009G104300--Sobic007G116400 Sobic006G080300 Sobic006G080300 Sobic009G104300--Sobic006G080300 Sobic003G170100 Sobic003G170100 Sobic009G104300--Sobic003G170100 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic009G104300--Sobic001G094000 Sobic009G104300--Sobic001G543900 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic009G104300--Sobic001G454301 Sobic009G104300--Sobic007G137900 Sobic009G104300--Sobic001G272000 Sobic009G104300--Sobic001G477800 Sobic008G116500--Sobic002G001600 Sobic008G116500--Sobic001G543900 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic008G116500--Sobic007G011400 Sobic001G439500 Sobic001G439500 Sobic008G116500--Sobic001G439500 Sobic008G116500--Sobic006G080300 Sobic008G116500--Sobic007G037100 Sobic008G116500--Sobic002G313300 Sobic008G116500--Sobic001G477800 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic008G116500--Sobic004G196700 Sobic001G272000--Sobic001G271900 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G272000--SobicK009900 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic001G272000--Sobic001G287301 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic001G272000--Sobic001G024200 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic001G272000--Sobic008G049701 Sobic001G272000--Sobic001G543900 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic001G272000--Sobic008G042250 Sobic001G272000--Sobic007G211000 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic001G272000--Sobic005G110430 Sobic001G271801--Sobic001G287301 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic001G271801--Sobic005G139800 Sobic001G271801--Sobic008G049701 Sobic001G271801--Sobic001G272000 Sobic001G271801--Sobic008G042250 Sobic001G271801--SobicK009900 Sobic007G008800 Sobic007G008800 Sobic001G271801--Sobic007G008800 Sobic001G271801--Sobic001G271900 Sobic002G283300 Sobic002G283300 Sobic001G271801--Sobic002G283300 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic007G137900--Sobic001G251700 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic007G137900--Sobic002G157300 Sobic007G137900--Sobic004G196700 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic007G137900--Sobic003G200200 Sobic007G137900--Sobic003G170100 Sobic004G349900 Sobic004G349900 Sobic007G137900--Sobic004G349900 Sobic005G149500 Sobic005G149500 Sobic007G137900--Sobic005G149500 Sobic007G137900--Sobic007G011400 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic007G137900--Sobic002G157000
Octagon: transcription factors


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