Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G096800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PRA7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G166600 cyclin, putative, expressed -
2 Sobic.002G400900 expressed protein -
3 Sobic.005G110427 - -
4 Sobic.001G022100 expressed protein -
5 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.007G144200 - -
7 Sobic.001G055900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K16277: E3 ubiquitin-protein ligase DRIP
8 Sobic.004G132100 ATP binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G271801 - -
10 Sobic.010G033700 - -
11 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
12 Sobic.002G166700 cyclin, putative, expressed -
13 Sobic.002G224450 - -
14 Sobic.004G045566 - -
15 Sobic.001G267233 - -
16 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
17 Sobic.008G025900 expressed protein -
18 Sobic.009G104300 - -
19 Sobic.008G049701 - -
20 Sobic.004G132150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic002G166600 Sobic002G166600 Sobic005G096800--Sobic002G166600 Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic005G096800--Sobic002G400900 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic005G096800--Sobic005G110427 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic005G096800--Sobic001G022100 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic005G096800--Sobic005G139800 Sobic007G144200 Sobic007G144200 Sobic005G096800--Sobic007G144200 Sobic001G055900 Sobic001G055900 Sobic005G096800--Sobic001G055900 Sobic004G132100 Sobic004G132100 Sobic005G096800--Sobic004G132100 Sobic001G271801 Sobic001G271801 Sobic005G096800--Sobic001G271801 Sobic002G166700 Sobic002G166700 Sobic002G166600--Sobic002G166700 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic002G166600--Sobic001G543900 Sobic002G001600 Sobic002G001600 Sobic002G166600--Sobic002G001600 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic002G166600--Sobic009G104300 Sobic008G116500 Sobic008G116500 Sobic002G166600--Sobic008G116500 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic002G166600--Sobic001G272000 Sobic002G166600--Sobic001G271801 Sobic002G166600--Sobic005G110427 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic002G166600--Sobic007G137900 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic002G400900--Sobic001G287101 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic002G400900--Sobic002G224450 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic002G400900--Sobic004G005400 Sobic002G400900--Sobic005G096800 Sobic002G400900--Sobic005G110427 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic002G400900--Sobic003G366850 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic002G400900--Sobic008G025900 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic002G400900--Sobic004G121000 Sobic002G400900--Sobic001G022100 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic001G022100--Sobic008G025900 Sobic009G137800 Sobic009G137800 Sobic001G022100--Sobic009G137800 Sobic001G022100--Sobic005G096800 Sobic001G022100--Sobic002G400900 Sobic001G022100--Sobic005G139800 Sobic001G022100--Sobic005G221425 Sobic001G022100--Sobic002G224450 Sobic001G022100--Sobic002G166600 Sobic003G185200 Sobic003G185200 Sobic001G022100--Sobic003G185200 Sobic005G139800--Sobic008G049701 Sobic005G139800--Sobic009G209800 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic005G139800--Sobic001G287301 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic001G240400 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic005G139800--Sobic005G117801 Sobic005G139800--Sobic002G056100 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic005G221425 Sobic007G144200--Sobic005G096800 Sobic007G144200--Sobic001G055900 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic007G144200--Sobic010G101700 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic007G144200--Sobic010G056000 Sobic004G132150 Sobic004G132150 Sobic007G144200--Sobic004G132150 Sobic003G088700 Sobic003G088700 Sobic007G144200--Sobic003G088700 Sobic003G323900 Sobic003G323900 Sobic007G144200--Sobic003G323900 Sobic010G246900 Sobic010G246900 Sobic007G144200--Sobic010G246900 Sobic009G157500 Sobic009G157500 Sobic007G144200--Sobic009G157500 Sobic001G055900--Sobic009G157500 Sobic003G351150 Sobic003G351150 Sobic001G055900--Sobic003G351150 Sobic001G055900--Sobic005G096800 Sobic001G055900--Sobic010G101700 Sobic001G055900--Sobic002G224450 Sobic003G119800 Sobic003G119800 Sobic001G055900--Sobic003G119800 Sobic001G055900--Sobic008G025900 Sobic001G055900--Sobic007G144200 Sobic003G026300 Sobic003G026300 Sobic001G055900--Sobic003G026300 Sobic004G132100--Sobic005G096800 Sobic006G022500 Sobic006G022500 Sobic004G132100--Sobic006G022500 Sobic004G204400 Sobic004G204400 Sobic004G132100--Sobic004G204400 Sobic004G132100--Sobic004G005400 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic004G132100--Sobic005G127300 Sobic002G019600 Sobic002G019600 Sobic004G132100--Sobic002G019600 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic004G132100--Sobic004G045566 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic004G132100--Sobic002G182300 Sobic010G033700 Sobic010G033700 Sobic004G132100--Sobic010G033700 Sobic001G271801--Sobic001G287301 Sobic001G271801--Sobic005G139800 Sobic001G271801--Sobic008G049701 Sobic001G271801--Sobic001G272000 Sobic001G271801--Sobic008G042250 SobicK009900 SobicK009900 Sobic001G271801--SobicK009900 Sobic007G008800 Sobic007G008800 Sobic001G271801--Sobic007G008800 Sobic001G271900 Sobic001G271900 Sobic001G271801--Sobic001G271900 Sobic002G283300 Sobic002G283300 Sobic001G271801--Sobic002G283300
Octagon: transcription factors


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