Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G033700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YI49
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G096800 - -
2 Sobic.004G289600 - -
3 Sobic.010G139301 - -
4 Sobic.002G182150 - -
5 Sobic.005G079700 expressed protein -
6 Sobic.004G204400 OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G065400 - -
8 Sobic.004G132100 ATP binding protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G246900 - -
11 Sobic.003G366850 - -
12 Sobic.009G013100 rp3 protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
14 Sobic.002G182300 - -
15 Sobic.003G429500 - -
16 Sobic.007G144200 - -
17 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
18 Sobic.004G045566 - -
19 Sobic.005G043800 transporter family protein, putative, expressed -
20 Sobic.008G000800 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed K10398: KIF11, kinesin family member 11


Gene co-expression network
sample Sobic010G033700 Sobic010G033700 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic010G033700--Sobic005G096800 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic010G033700--Sobic004G289600 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic010G033700--Sobic010G139301 Sobic002G182150 Sobic002G182150 Sobic010G033700--Sobic002G182150 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic010G033700--Sobic005G079700 Sobic004G204400 Sobic004G204400 Sobic010G033700--Sobic004G204400 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic010G033700--Sobic008G065400 Sobic004G132100 Sobic004G132100 Sobic010G033700--Sobic004G132100 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic010G033700--Sobic003G374500 Sobic002G166600 Sobic002G166600 Sobic005G096800--Sobic002G166600 Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic005G096800--Sobic002G400900 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic005G096800--Sobic005G110427 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic005G096800--Sobic001G022100 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic005G096800--Sobic005G139800 Sobic007G144200 Sobic007G144200 Sobic005G096800--Sobic007G144200 Sobic001G055900 Sobic001G055900 Sobic005G096800--Sobic001G055900 Sobic005G096800--Sobic004G132100 Sobic001G271801 Sobic001G271801 Sobic005G096800--Sobic001G271801 Sobic008G065800 Sobic008G065800 Sobic004G289600--Sobic008G065800 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic004G289600--Sobic008G125600 Sobic004G289600--Sobic001G022100 Sobic003G020600 Sobic003G020600 Sobic004G289600--Sobic003G020600 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic004G289600--Sobic006G068400 Sobic004G289600--Sobic010G033700 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic004G289600--Sobic009G067501 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic004G289600--Sobic008G106600 Sobic008G189400 Sobic008G189400 Sobic004G289600--Sobic008G189400 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic010G139301--Sobic007G089600 Sobic010G139301--Sobic006G068400 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic010G139301--Sobic007G142050 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic010G139301--Sobic004G169501 Sobic003G323900 Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic003G323900 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic010G139301--Sobic002G073300 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic010G139301--Sobic002G182300 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic010G139301--Sobic005G099150 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic010G139301--Sobic008G068800 Sobic002G107532 Sobic002G107532 Sobic002G182150--Sobic002G107532 Sobic004G178901 Sobic004G178901 Sobic002G182150--Sobic004G178901 Sobic002G182150--Sobic010G033700 Sobic007G100100 Sobic007G100100 Sobic002G182150--Sobic007G100100 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic002G182150--Sobic002G124200 Sobic002G182150--Sobic002G182300 Sobic004G148750 Sobic004G148750 Sobic002G182150--Sobic004G148750 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic002G182150--Sobic005G001900 Sobic006G253400 Sobic006G253400 Sobic002G182150--Sobic006G253400 Sobic005G079700--Sobic008G065400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G079700--Sobic008G106400 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic006G249200 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic005G079700--Sobic002G431200 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic003G374500 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G159300 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic005G079700--Sobic009G121750 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic005G079700--Sobic008G044750 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic004G204400--Sobic004G121000 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic004G204400--Sobic003G266700 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic004G204400--Sobic002G224450 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic004G204400--Sobic003G366850 Sobic004G204400--Sobic008G065400 Sobic004G204400--Sobic003G374500 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic004G204400--Sobic003G436900 Sobic001G262900 Sobic001G262900 Sobic004G204400--Sobic001G262900 Sobic004G204400--Sobic002G400900 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic004G132100--Sobic005G096800 Sobic006G022500 Sobic006G022500 Sobic004G132100--Sobic006G022500 Sobic004G132100--Sobic004G204400 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic004G132100--Sobic004G005400 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic004G132100--Sobic005G127300 Sobic002G019600 Sobic002G019600 Sobic004G132100--Sobic002G019600 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic004G132100--Sobic004G045566 Sobic004G132100--Sobic002G182300 Sobic004G132100--Sobic010G033700 Sobic003G374500--Sobic008G065400 Sobic003G374500--Sobic001G278600 Sobic003G374500--Sobic003G366850 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic003G374500--Sobic007G037301 Sobic003G374500--Sobic005G079700 Sobic003G374500--Sobic001G140200 Sobic003G374500--Sobic001G262900 Sobic003G374500--Sobic003G266700 Sobic003G374500--Sobic002G431200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.