Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G139301.3,Sobic.010G139301.2,Sobic.010G139301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VSX0 , A0A1W0VSZ3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
2 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
3 Sobic.007G142050 - -
4 Sobic.004G169501 - -
5 Sobic.003G323900 - -
6 Sobic.002G073300 - -
7 Sobic.002G182300 - -
8 Sobic.005G099150 - -
9 Sobic.008G068800 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G140800 RNA pseudouridine synthase, putative, expressed -
11 Sobic.002G056100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.001G454301 - -
13 Sobic.005G077400 - -
14 Sobic.007G116400 - -
15 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G246900 - -
17 Sobic.005G117801 - -
18 Sobic.004G088400 GTPase-activating protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
20 Sobic.003G315332 - K15421: secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor


Gene co-expression network
sample Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic010G139301--Sobic007G089600 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic010G139301--Sobic006G068400 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic010G139301--Sobic007G142050 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic010G139301--Sobic004G169501 Sobic003G323900 Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic003G323900 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic010G139301--Sobic002G073300 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic010G139301--Sobic002G182300 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic010G139301--Sobic005G099150 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic010G139301--Sobic008G068800 Sobic007G089600--Sobic007G142050 Sobic007G089600--Sobic010G139301 Sobic007G089600--Sobic004G169501 Sobic007G089600--Sobic008G068800 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic007G089600--Sobic003G315332 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic007G089600--Sobic009G104300 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic007G089600--Sobic001G272000 SobicK009900 SobicK009900 Sobic007G089600--SobicK009900 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic007G089600--Sobic005G001900 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic006G068400--Sobic002G056100 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic006G068400--Sobic005G139800 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic006G068400--Sobic009G209800 Sobic006G068400--Sobic010G139301 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic006G068400--Sobic008G049701 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic006G068400--Sobic001G305400 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic006G068400--Sobic001G240400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic006G068400--Sobic005G221425 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic006G068400--Sobic008G079100 Sobic007G142050--Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic008G068800 Sobic007G142050--Sobic003G315332 Sobic007G142050--Sobic004G169501 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic007G142050--Sobic002G124200 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic005G001900 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic004G076732 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic007G142050--Sobic009G059600 Sobic004G169501--Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic007G142050 Sobic004G169501--Sobic008G068800 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic004G169501--Sobic007G116400 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic004G169501--Sobic008G117200 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic004G169501--Sobic003G204000 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic004G169501--Sobic001G267233 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic004G169501--Sobic002G181450 Sobic004G169501--Sobic007G089600 Sobic003G323900--Sobic010G139301 Sobic003G323900--Sobic002G056100 Sobic003G323900--Sobic009G209800 Sobic003G323900--Sobic008G049701 Sobic003G323900--Sobic005G139800 Sobic003G323900--Sobic001G240400 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic003G323900--Sobic008G042250 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic003G323900--Sobic005G117801 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic003G323900--Sobic001G287301 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic002G073300--Sobic005G128000 Sobic002G073300--Sobic010G139301 Sobic002G073300--Sobic004G169501 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic002G073300--Sobic001G454301 Sobic002G073300--Sobic002G182300 Sobic004G289500 Sobic004G289500 Sobic002G073300--Sobic004G289500 Sobic002G073300--Sobic002G181450 Sobic002G073300--Sobic007G142050 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic002G073300--Sobic004G045566 Sobic002G182300--Sobic004G169501 Sobic002G182300--Sobic010G139301 Sobic002G182300--Sobic002G073300 Sobic002G182300--Sobic005G099150 Sobic002G182300--Sobic004G045566 Sobic002G182300--Sobic002G124200 Sobic002G182300--Sobic002G181450 Sobic002G182300--Sobic007G142050 Sobic002G182300--Sobic006G068400 Sobic005G099150--Sobic004G045566 Sobic005G099150--Sobic006G068400 Sobic005G099150--Sobic010G139301 Sobic005G099150--Sobic005G128000 Sobic005G099150--Sobic002G182300 Sobic005G099150--Sobic002G073300 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic005G099150--Sobic008G091671 Sobic005G099150--Sobic007G089600 Sobic005G099150--Sobic007G142050 Sobic008G068800--Sobic007G116400 Sobic008G068800--Sobic007G142050 Sobic008G068800--Sobic003G204000 Sobic008G068800--Sobic004G169501 Sobic008G068800--Sobic009G059600 Sobic008G068800--Sobic003G315332 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic008G068800--Sobic004G286900 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic008G068800--Sobic003G424100 Sobic001G024200 Sobic001G024200 Sobic008G068800--Sobic001G024200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.