Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G073300.4,Sobic.002G073300.1,Sobic.002G073300.2,Sobic.002G073300.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q9R9 , A0A1B6Q9R4 , A0A1B6Q9P4 , A0A1B6Q9Q0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.002G073300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
2 Sobic.010G139301 - -
3 Sobic.004G169501 - -
4 Sobic.001G454301 - -
5 Sobic.002G182300 - -
6 Sobic.004G289500 - -
7 Sobic.002G181450 - -
8 Sobic.007G142050 - -
9 Sobic.004G045566 - -
10 Sobic.006G022500 OsFBD9 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G099150 - -
12 Sobic.005G077400 - -
13 Sobic.004G088400 GTPase-activating protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G140800 RNA pseudouridine synthase, putative, expressed -
15 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
16 Sobic.006G072900 hydrolase, putative, expressed -
17 Sobic.002G061400 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.008G117200 RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1, putative, expressed K10144: RCHY1, RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1
19 Sobic.009G059600 KIP1, putative, expressed -
20 Sobic.007G116400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic002G073300--Sobic005G128000 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic002G073300--Sobic010G139301 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G073300--Sobic004G169501 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic002G073300--Sobic001G454301 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic002G073300--Sobic002G182300 Sobic004G289500 Sobic004G289500 Sobic002G073300--Sobic004G289500 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic002G073300--Sobic002G181450 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic002G073300--Sobic007G142050 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic002G073300--Sobic004G045566 Sobic005G128000--Sobic002G073300 Sobic005G128000--Sobic004G045566 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic005G128000--Sobic001G261537 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic005G128000--Sobic005G099150 Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic005G128000--Sobic006G067100 Sobic005G128000--Sobic002G182300 Sobic010G237650 Sobic010G237650 Sobic005G128000--Sobic010G237650 Sobic005G128000--Sobic010G139301 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic005G128000--Sobic008G106600 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic010G139301--Sobic007G089600 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic010G139301--Sobic006G068400 Sobic010G139301--Sobic007G142050 Sobic010G139301--Sobic004G169501 Sobic003G323900 Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic002G073300 Sobic010G139301--Sobic002G182300 Sobic010G139301--Sobic005G099150 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic010G139301--Sobic008G068800 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic007G142050 Sobic004G169501--Sobic008G068800 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic004G169501--Sobic007G116400 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic004G169501--Sobic008G117200 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic004G169501--Sobic003G204000 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic004G169501--Sobic001G267233 Sobic004G169501--Sobic002G181450 Sobic004G169501--Sobic007G089600 Sobic001G454301--Sobic007G116400 Sobic002G421700 Sobic002G421700 Sobic001G454301--Sobic002G421700 Sobic001G454301--Sobic008G117200 Sobic001G094000 Sobic001G094000 Sobic001G454301--Sobic001G094000 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic001G454301--Sobic009G104300 Sobic009G239351 Sobic009G239351 Sobic001G454301--Sobic009G239351 Sobic001G303675 Sobic001G303675 Sobic001G454301--Sobic001G303675 Sobic002G140800 Sobic002G140800 Sobic001G454301--Sobic002G140800 Sobic006G217200 Sobic006G217200 Sobic001G454301--Sobic006G217200 Sobic002G182300--Sobic004G169501 Sobic002G182300--Sobic010G139301 Sobic002G182300--Sobic002G073300 Sobic002G182300--Sobic005G099150 Sobic002G182300--Sobic004G045566 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic002G182300--Sobic002G124200 Sobic002G182300--Sobic002G181450 Sobic002G182300--Sobic007G142050 Sobic002G182300--Sobic006G068400 Sobic006G269600 Sobic006G269600 Sobic004G289500--Sobic006G269600 Sobic004G289500--Sobic002G073300 Sobic004G289500--Sobic002G140800 Sobic004G289500--Sobic010G139301 Sobic004G286900 Sobic004G286900 Sobic004G289500--Sobic004G286900 Sobic006G063300 Sobic006G063300 Sobic004G289500--Sobic006G063300 Sobic004G193800 Sobic004G193800 Sobic004G289500--Sobic004G193800 Sobic002G050500 Sobic002G050500 Sobic004G289500--Sobic002G050500 Sobic008G086200 Sobic008G086200 Sobic004G289500--Sobic008G086200 Sobic002G181450--Sobic004G169501 Sobic002G181450--Sobic007G142050 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic002G181450--Sobic005G001900 Sobic002G181450--Sobic003G315332 Sobic002G181450--Sobic007G089600 Sobic002G181450--Sobic003G204000 Sobic002G181450--Sobic002G073300 Sobic002G181450--Sobic002G124200 Sobic002G076400 Sobic002G076400 Sobic002G181450--Sobic002G076400 Sobic007G142050--Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic008G068800 Sobic007G142050--Sobic003G315332 Sobic007G142050--Sobic004G169501 Sobic007G142050--Sobic002G124200 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic005G001900 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic004G076732 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic007G142050--Sobic009G059600 Sobic004G045566--Sobic005G099150 Sobic004G045566--Sobic005G128000 Sobic004G045566--Sobic006G068400 Sobic004G045566--Sobic002G073300 Sobic004G045566--Sobic002G182300 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic004G045566--Sobic006G072900 Sobic002G018100 Sobic002G018100 Sobic004G045566--Sobic002G018100 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic004G045566--Sobic005G096800 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic004G045566--Sobic008G091671
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.