Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G182300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QC35
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G169501 - -
2 Sobic.010G139301 - -
3 Sobic.002G073300 - -
4 Sobic.005G099150 - -
5 Sobic.004G045566 - -
6 Sobic.002G124200 expressed protein -
7 Sobic.002G181450 - -
8 Sobic.007G142050 - -
9 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
10 Sobic.004G197900 - -
11 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
12 Sobic.007G089600 OsGrx_S15.1 - glutaredoxin subgroup II, expressed -
13 Sobic.003G031750 - -
14 Sobic.005G077400 - -
15 Sobic.001G261537 - -
16 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
17 Sobic.001G267233 - -
18 Sobic.008G091900 - -
19 Sobic.003G315332 - K15421: secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor
20 Sobic.002G019600 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G182300--Sobic004G169501 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic002G182300--Sobic010G139301 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic002G182300--Sobic002G073300 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic002G182300--Sobic005G099150 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic002G182300--Sobic004G045566 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic002G182300--Sobic002G124200 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic002G182300--Sobic002G181450 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic002G182300--Sobic007G142050 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic002G182300--Sobic006G068400 Sobic003G315332 Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic003G315332 Sobic004G169501--Sobic007G142050 Sobic008G068800 Sobic008G068800 Sobic004G169501--Sobic008G068800 Sobic007G116400 Sobic007G116400 Sobic004G169501--Sobic007G116400 Sobic008G117200 Sobic008G117200 Sobic004G169501--Sobic008G117200 Sobic003G204000 Sobic003G204000 Sobic004G169501--Sobic003G204000 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic004G169501--Sobic001G267233 Sobic004G169501--Sobic002G181450 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic004G169501--Sobic007G089600 Sobic010G139301--Sobic007G089600 Sobic010G139301--Sobic006G068400 Sobic010G139301--Sobic007G142050 Sobic010G139301--Sobic004G169501 Sobic003G323900 Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic003G323900 Sobic010G139301--Sobic002G073300 Sobic010G139301--Sobic002G182300 Sobic010G139301--Sobic005G099150 Sobic010G139301--Sobic008G068800 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic002G073300--Sobic005G128000 Sobic002G073300--Sobic010G139301 Sobic002G073300--Sobic004G169501 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic002G073300--Sobic001G454301 Sobic002G073300--Sobic002G182300 Sobic004G289500 Sobic004G289500 Sobic002G073300--Sobic004G289500 Sobic002G073300--Sobic002G181450 Sobic002G073300--Sobic007G142050 Sobic002G073300--Sobic004G045566 Sobic005G099150--Sobic004G045566 Sobic005G099150--Sobic006G068400 Sobic005G099150--Sobic010G139301 Sobic005G099150--Sobic005G128000 Sobic005G099150--Sobic002G182300 Sobic005G099150--Sobic002G073300 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic005G099150--Sobic008G091671 Sobic005G099150--Sobic007G089600 Sobic005G099150--Sobic007G142050 Sobic004G045566--Sobic005G099150 Sobic004G045566--Sobic005G128000 Sobic004G045566--Sobic006G068400 Sobic004G045566--Sobic002G073300 Sobic004G045566--Sobic002G182300 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic004G045566--Sobic006G072900 Sobic002G018100 Sobic002G018100 Sobic004G045566--Sobic002G018100 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic004G045566--Sobic005G096800 Sobic004G045566--Sobic008G091671 Sobic002G124200--Sobic007G142050 Sobic005G001900 Sobic005G001900 Sobic002G124200--Sobic005G001900 Sobic003G089650 Sobic003G089650 Sobic002G124200--Sobic003G089650 Sobic002G124200--Sobic004G169501 Sobic002G124200--Sobic003G315332 Sobic002G124200--Sobic002G181450 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic002G124200--Sobic010G263800 Sobic007G094801 Sobic007G094801 Sobic002G124200--Sobic007G094801 Sobic002G124200--Sobic002G182300 Sobic002G181450--Sobic004G169501 Sobic002G181450--Sobic007G142050 Sobic002G181450--Sobic005G001900 Sobic002G181450--Sobic003G315332 Sobic002G181450--Sobic007G089600 Sobic002G181450--Sobic003G204000 Sobic002G181450--Sobic002G073300 Sobic002G181450--Sobic002G124200 Sobic002G076400 Sobic002G076400 Sobic002G181450--Sobic002G076400 Sobic007G142050--Sobic007G089600 Sobic007G142050--Sobic008G068800 Sobic007G142050--Sobic003G315332 Sobic007G142050--Sobic004G169501 Sobic007G142050--Sobic002G124200 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic007G073400 Sobic007G142050--Sobic005G001900 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic007G142050--Sobic004G076732 Sobic009G059600 Sobic009G059600 Sobic007G142050--Sobic009G059600 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic006G068400--Sobic002G056100 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic006G068400--Sobic005G139800 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic006G068400--Sobic009G209800 Sobic006G068400--Sobic010G139301 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic006G068400--Sobic008G049701 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic006G068400--Sobic001G305400 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic006G068400--Sobic001G240400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic006G068400--Sobic005G221425 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic006G068400--Sobic008G079100
Octagon: transcription factors


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