Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G045566.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RKX7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G17170 : RAB GTPase homolog B1C
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g39440.2 : ras-related protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G099150 - -
2 Sobic.005G128000 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
3 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
4 Sobic.002G073300 - -
5 Sobic.002G182300 - -
6 Sobic.006G072900 hydrolase, putative, expressed -
7 Sobic.002G018100 - -
8 Sobic.005G096800 - -
9 Sobic.008G091671 - -
10 Sobic.005G077400 - -
11 Sobic.010G139301 - -
12 Sobic.006G022500 OsFBD9 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G261537 - -
14 Sobic.004G169501 - -
15 Sobic.003G020600 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
16 Sobic.003G190300 - -
17 Sobic.003G006833 - -
18 Sobic.008G106600 - -
19 Sobic.004G132100 ATP binding protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G181450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic005G099150 Sobic005G099150 Sobic004G045566--Sobic005G099150 Sobic005G128000 Sobic005G128000 Sobic004G045566--Sobic005G128000 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic004G045566--Sobic006G068400 Sobic002G073300 Sobic002G073300 Sobic004G045566--Sobic002G073300 Sobic002G182300 Sobic002G182300 Sobic004G045566--Sobic002G182300 Sobic006G072900 Sobic006G072900 Sobic004G045566--Sobic006G072900 Sobic002G018100 Sobic002G018100 Sobic004G045566--Sobic002G018100 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic004G045566--Sobic005G096800 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic004G045566--Sobic008G091671 Sobic005G099150--Sobic004G045566 Sobic005G099150--Sobic006G068400 Sobic010G139301 Sobic010G139301 Sobic005G099150--Sobic010G139301 Sobic005G099150--Sobic005G128000 Sobic005G099150--Sobic002G182300 Sobic005G099150--Sobic002G073300 Sobic005G099150--Sobic008G091671 Sobic007G089600 Sobic007G089600 Sobic005G099150--Sobic007G089600 Sobic007G142050 Sobic007G142050 Sobic005G099150--Sobic007G142050 Sobic005G128000--Sobic002G073300 Sobic005G128000--Sobic004G045566 Sobic001G261537 Sobic001G261537 Sobic005G128000--Sobic001G261537 Sobic005G128000--Sobic005G099150 Sobic006G067100 Sobic006G067100 Sobic005G128000--Sobic006G067100 Sobic005G128000--Sobic002G182300 Sobic010G237650 Sobic010G237650 Sobic005G128000--Sobic010G237650 Sobic005G128000--Sobic010G139301 Sobic008G106600 Sobic008G106600 Sobic005G128000--Sobic008G106600 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic006G068400--Sobic002G056100 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic006G068400--Sobic005G139800 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic006G068400--Sobic009G209800 Sobic006G068400--Sobic010G139301 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic006G068400--Sobic008G049701 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic006G068400--Sobic001G305400 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic006G068400--Sobic001G240400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic006G068400--Sobic005G221425 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic006G068400--Sobic008G079100 Sobic002G073300--Sobic005G128000 Sobic002G073300--Sobic010G139301 Sobic004G169501 Sobic004G169501 Sobic002G073300--Sobic004G169501 Sobic001G454301 Sobic001G454301 Sobic002G073300--Sobic001G454301 Sobic002G073300--Sobic002G182300 Sobic004G289500 Sobic004G289500 Sobic002G073300--Sobic004G289500 Sobic002G181450 Sobic002G181450 Sobic002G073300--Sobic002G181450 Sobic002G073300--Sobic007G142050 Sobic002G073300--Sobic004G045566 Sobic002G182300--Sobic004G169501 Sobic002G182300--Sobic010G139301 Sobic002G182300--Sobic002G073300 Sobic002G182300--Sobic005G099150 Sobic002G182300--Sobic004G045566 Sobic002G124200 Sobic002G124200 Sobic002G182300--Sobic002G124200 Sobic002G182300--Sobic002G181450 Sobic002G182300--Sobic007G142050 Sobic002G182300--Sobic006G068400 Sobic003G006833 Sobic003G006833 Sobic006G072900--Sobic003G006833 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic006G072900--Sobic009G104300 Sobic006G072900--Sobic002G073300 Sobic006G072900--Sobic004G045566 Sobic001G172200 Sobic001G172200 Sobic006G072900--Sobic001G172200 Sobic006G072900--Sobic001G454301 Sobic006G072900--Sobic007G089600 Sobic002G335700 Sobic002G335700 Sobic006G072900--Sobic002G335700 Sobic006G072900--Sobic002G181450 Sobic002G018100--Sobic004G045566 Sobic001G265200 Sobic001G265200 Sobic002G018100--Sobic001G265200 Sobic006G123900 Sobic006G123900 Sobic002G018100--Sobic006G123900 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic002G018100--Sobic005G077400 Sobic001G228700 Sobic001G228700 Sobic002G018100--Sobic001G228700 Sobic002G330400 Sobic002G330400 Sobic002G018100--Sobic002G330400 Sobic002G018100--Sobic005G128000 Sobic006G039900 Sobic006G039900 Sobic002G018100--Sobic006G039900 Sobic002G018100--Sobic005G099150 Sobic002G166600 Sobic002G166600 Sobic005G096800--Sobic002G166600 Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic005G096800--Sobic002G400900 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic005G096800--Sobic005G110427 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic005G096800--Sobic001G022100 Sobic005G096800--Sobic005G139800 Sobic007G144200 Sobic007G144200 Sobic005G096800--Sobic007G144200 Sobic001G055900 Sobic001G055900 Sobic005G096800--Sobic001G055900 Sobic004G132100 Sobic004G132100 Sobic005G096800--Sobic004G132100 Sobic001G271801 Sobic001G271801 Sobic005G096800--Sobic001G271801 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic008G091671--Sobic009G197200 Sobic008G091671--Sobic006G068400 Sobic007G112900 Sobic007G112900 Sobic008G091671--Sobic007G112900 Sobic002G212800 Sobic002G212800 Sobic008G091671--Sobic002G212800 Sobic004G291800 Sobic004G291800 Sobic008G091671--Sobic004G291800 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic008G091671--Sobic009G067501 Sobic003G159450 Sobic003G159450 Sobic008G091671--Sobic003G159450 Sobic008G091671--Sobic005G099150 Sobic008G091671--Sobic010G139301
Octagon: transcription factors


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