Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G020600.3,Sobic.003G020600.1,Sobic.003G020600.2
Synonym Sb03g001800, TBL37
Functional annotation powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q0W7 , A0A1W0VVF4 , A0A1B6Q0X3
Pfam PF14416 PF13839
Panther DB PTHR32285 PTHR32285:SF69
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G34070 : TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 37
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g11810.1 : powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052659 , Zm00025a022905
Brachypodium KQK03307
Barley HORVU3Hr1G044150.11 , HORVU3Hr1G044150.10 , HORVU3Hr1G044150.12 , HORVU3Hr1G027970.8 , HORVU3Hr1G027970.4 , HORVU3Hr1G027970.5 , HORVU3Hr1G027970.2 , HORVU3Hr1G027970.3 , HORVU3Hr1G027970.10 , HORVU3Hr1G027970.11 , HORVU3Hr1G044150.8 , HORVU3Hr1G044150.9 , HORVU3Hr1G027970.7 , HORVU3Hr1G044150.7 , HORVU3Hr1G044150.5 , HORVU3Hr1G044150.4 , HORVU3Hr1G044150.3 , HORVU3Hr1G044150.2 , HORVU3Hr1G044150.1 , HORVU1Hr1G052270.1
Wheat TraesCS3D02G145600 , TraesCS3D02G145600 , TraesCS3A02G141500 , TraesCS3B02G163100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G020600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G289600 - -
2 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
3 Sobic.009G197200 - -
4 Sobic.004G045566 - -
5 Sobic.008G091671 - -
6 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G077400 - -
8 Sobic.001G022100 expressed protein -
9 Sobic.004G020401 - -
10 Sobic.008G125600 - -
11 Sobic.001G271801 - -
12 Sobic.002G330400 pentatricopeptide, putative, expressed -
13 Sobic.005G099150 - -
14 Sobic.002G164400 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
15 Sobic.008G094300 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
16 Sobic.010G144100 - -
17 Sobic.002G430500 phospholipase C, putative, expressed K05857: phosphatidylinositol phospholipase C, delta
18 Sobic.002G212800 - -
19 Sobic.008G106600 - -
20 Sobic.009G067501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G020600 Sobic003G020600 Sobic004G289600 Sobic004G289600 Sobic003G020600--Sobic004G289600 Sobic006G068400 Sobic006G068400 Sobic003G020600--Sobic006G068400 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic003G020600--Sobic009G197200 Sobic004G045566 Sobic004G045566 Sobic003G020600--Sobic004G045566 Sobic008G091671 Sobic008G091671 Sobic003G020600--Sobic008G091671 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic003G020600--Sobic005G139800 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic003G020600--Sobic005G077400 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic003G020600--Sobic001G022100 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic003G020600--Sobic004G020401 Sobic008G065800 Sobic008G065800 Sobic004G289600--Sobic008G065800 Sobic008G125600 Sobic008G125600 Sobic004G289600--Sobic008G125600 Sobic004G289600--Sobic001G022100 Sobic004G289600--Sobic003G020600 Sobic004G289600--Sobic006G068400 Sobic010G033700 Sobic010G033700 Sobic004G289600--Sobic010G033700 Sobic009G067501 Sobic009G067501 Sobic004G289600--Sobic009G067501 Sobic008G106600 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Octagon: transcription factors


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