Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G022100.2,Sobic.001G022100.3,Sobic.001G022100.1
Synonym Sb01g002100
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WTX7
Pfam -
Panther DB PTHR34564 PTHR34564:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G22280 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g62030.1,LOC_Os03g62030.6,LOC_Os03g62030.5 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK12267
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G022100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G025900 expressed protein -
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7 Sobic.002G224450 - -
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9 Sobic.003G185200 chaperone protein dnaJ 49, putative, expressed K09518: DnaJ homolog subfamily B member 12
10 Sobic.005G110427 - -
11 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
12 Sobic.003G012500 expressed protein -
13 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
14 Sobic.006G068400 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@B-block binding subunit of TFIIIC("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@seed storage 2S albumin superfamily("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@transcription factor-related, putative, expressed K15199: general transcription factor 3C polypeptide 1
15 Sobic.008G079100 - -
16 Sobic.010G202600 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10661: MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6
17 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G174800 OsPP2Ac-1 - Phosphatase 2A isoform 1 belonging to family 1, expressed K04382: serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit
19 Sobic.003G261300 arginine/serine-rich coiled-coil protein 1, putative, expressed -
20 Sobic.004G289600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic001G022100--Sobic008G025900 Sobic009G137800 Sobic009G137800 Sobic001G022100--Sobic009G137800 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic001G022100--Sobic005G096800 Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic001G022100--Sobic002G400900 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic001G022100--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic001G022100--Sobic005G221425 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic001G022100--Sobic002G224450 Sobic002G166600 Sobic002G166600 Sobic001G022100--Sobic002G166600 Sobic003G185200 Sobic003G185200 Sobic001G022100--Sobic003G185200 Sobic008G025900--Sobic002G224450 Sobic008G025900--Sobic005G139800 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic008G025900--Sobic004G121000 Sobic008G025900--Sobic005G221425 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic008G025900--Sobic009G209800 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic008G025900--Sobic001G240400 Sobic009G157500 Sobic009G157500 Sobic008G025900--Sobic009G157500 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic008G025900--Sobic005G110427 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic008G025900--Sobic008G049701 Sobic004G153600 Sobic004G153600 Sobic009G137800--Sobic004G153600 Sobic008G189400 Sobic008G189400 Sobic009G137800--Sobic008G189400 Sobic004G267300 Sobic004G267300 Sobic009G137800--Sobic004G267300 Sobic009G137800--Sobic003G185200 Sobic009G137800--Sobic008G025900 Sobic001G424700 Sobic001G424700 Sobic009G137800--Sobic001G424700 Sobic009G087800 Sobic009G087800 Sobic009G137800--Sobic009G087800 Sobic009G137800--Sobic001G022100 Sobic010G260500 Sobic010G260500 Sobic009G137800--Sobic010G260500 Sobic005G096800--Sobic002G166600 Sobic005G096800--Sobic002G400900 Sobic005G096800--Sobic005G110427 Sobic005G096800--Sobic001G022100 Sobic005G096800--Sobic005G139800 Sobic007G144200 Sobic007G144200 Sobic005G096800--Sobic007G144200 Sobic001G055900 Sobic001G055900 Sobic005G096800--Sobic001G055900 Sobic004G132100 Sobic004G132100 Sobic005G096800--Sobic004G132100 Sobic001G271801 Sobic001G271801 Sobic005G096800--Sobic001G271801 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic002G400900--Sobic001G287101 Sobic002G400900--Sobic002G224450 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic002G400900--Sobic004G005400 Sobic002G400900--Sobic005G096800 Sobic002G400900--Sobic005G110427 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic002G400900--Sobic003G366850 Sobic002G400900--Sobic008G025900 Sobic002G400900--Sobic004G121000 Sobic002G400900--Sobic001G022100 Sobic005G139800--Sobic008G049701 Sobic005G139800--Sobic009G209800 Sobic001G287301 Sobic001G287301 Sobic005G139800--Sobic001G287301 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic008G042250 Sobic005G139800--Sobic001G240400 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic005G139800--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G139800--Sobic002G056100 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic002G410200 Sobic005G139800--Sobic005G221425 Sobic005G221425--Sobic009G209800 Sobic005G221425--Sobic001G240400 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic005G221425--Sobic001G253100 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic005G221425--Sobic008G009500 Sobic005G221425--Sobic008G049701 Sobic005G221425--Sobic002G056100 SobicK024000 SobicK024000 Sobic005G221425--SobicK024000 Sobic005G221425--Sobic005G139800 Sobic004G076732 Sobic004G076732 Sobic005G221425--Sobic004G076732 Sobic002G224450--Sobic008G025900 Sobic002G224450--Sobic004G121000 Sobic002G224450--Sobic001G240400 Sobic002G224450--Sobic005G221425 Sobic002G224450--Sobic001G287101 Sobic002G224450--Sobic005G139800 Sobic002G224450--Sobic009G209800 Sobic002G224450--Sobic005G110427 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic002G224450--Sobic003G436900 Sobic002G166700 Sobic002G166700 Sobic002G166600--Sobic002G166700 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic002G166600--Sobic001G543900 Sobic002G001600 Sobic002G001600 Sobic002G166600--Sobic002G001600 Sobic009G104300 Sobic009G104300 Sobic002G166600--Sobic009G104300 Sobic008G116500 Sobic008G116500 Sobic002G166600--Sobic008G116500 Sobic001G272000 Sobic001G272000 Sobic002G166600--Sobic001G272000 Sobic002G166600--Sobic001G271801 Sobic002G166600--Sobic005G110427 Sobic007G137900 Sobic007G137900 Sobic002G166600--Sobic007G137900 Sobic002G365100 Sobic002G365100 Sobic003G185200--Sobic002G365100 Sobic010G174800 Sobic010G174800 Sobic003G185200--Sobic010G174800 Sobic003G248500 Sobic003G248500 Sobic003G185200--Sobic003G248500 Sobic010G202600 Sobic010G202600 Sobic003G185200--Sobic010G202600 Sobic003G261300 Sobic003G261300 Sobic003G185200--Sobic003G261300 Sobic010G000700 Sobic010G000700 Sobic003G185200--Sobic010G000700 Sobic006G128800 Sobic006G128800 Sobic003G185200--Sobic006G128800 Sobic004G263900 Sobic004G263900 Sobic003G185200--Sobic004G263900 Sobic003G336800 Sobic003G336800 Sobic003G185200--Sobic003G336800
Octagon: transcription factors


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