Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G400900.2
Synonym Sb02g041580
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W7M0
Pfam PF07893
Panther DB PTHR33085 PTHR33085:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g49050.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G287101 - -
2 Sobic.002G224450 - -
3 Sobic.004G005400 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, putative, expressed K12854: SNRNP200, pre-mRNA-splicing helicase BRR2
4 Sobic.005G096800 - -
5 Sobic.005G110427 - -
6 Sobic.003G366850 - -
7 Sobic.008G025900 expressed protein -
8 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
9 Sobic.001G022100 expressed protein -
10 Sobic.005G139800 Brix domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
12 Sobic.005G221425 - -
13 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
14 Sobic.007G037301 - -
15 Sobic.001G278600 - -
16 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G200866 - -
18 Sobic.004G132150 - -
19 Sobic.008G142000 expressed protein -
20 Sobic.003G374500 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic002G400900--Sobic001G287101 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic002G400900--Sobic002G224450 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic002G400900--Sobic004G005400 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic002G400900--Sobic005G096800 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic002G400900--Sobic005G110427 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic002G400900--Sobic003G366850 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic002G400900--Sobic008G025900 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic002G400900--Sobic004G121000 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic002G400900--Sobic001G022100 Sobic001G287101--Sobic002G224450 Sobic001G287101--Sobic004G121000 Sobic001G287101--Sobic002G400900 Sobic001G287101--Sobic008G025900 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic001G287101--Sobic001G240400 Sobic001G287101--Sobic005G110427 Sobic004G132150 Sobic004G132150 Sobic001G287101--Sobic004G132150 Sobic001G287101--Sobic003G366850 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic001G287101--Sobic003G436900 Sobic002G224450--Sobic008G025900 Sobic002G224450--Sobic004G121000 Sobic002G224450--Sobic001G240400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic002G224450--Sobic005G221425 Sobic002G224450--Sobic001G287101 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic002G224450--Sobic005G139800 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic002G224450--Sobic009G209800 Sobic002G224450--Sobic005G110427 Sobic002G224450--Sobic003G436900 Sobic004G005400--Sobic005G110427 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic004G005400--Sobic006G262200 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic004G005400--Sobic006G009400 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic004G005400--Sobic010G263800 Sobic004G005400--Sobic005G221425 Sobic004G005400--Sobic009G209800 Sobic003G346000 Sobic003G346000 Sobic004G005400--Sobic003G346000 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic004G005400--Sobic003G031750 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic004G005400--Sobic008G079100 Sobic002G166600 Sobic002G166600 Sobic005G096800--Sobic002G166600 Sobic005G096800--Sobic002G400900 Sobic005G096800--Sobic005G110427 Sobic005G096800--Sobic001G022100 Sobic005G096800--Sobic005G139800 Sobic007G144200 Sobic007G144200 Sobic005G096800--Sobic007G144200 Sobic001G055900 Sobic001G055900 Sobic005G096800--Sobic001G055900 Sobic004G132100 Sobic004G132100 Sobic005G096800--Sobic004G132100 Sobic001G271801 Sobic001G271801 Sobic005G096800--Sobic001G271801 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic008G025900--Sobic002G224450 Sobic008G025900--Sobic005G139800 Sobic008G025900--Sobic004G121000 Sobic008G025900--Sobic005G221425 Sobic008G025900--Sobic009G209800 Sobic008G025900--Sobic001G240400 Sobic009G157500 Sobic009G157500 Sobic008G025900--Sobic009G157500 Sobic008G025900--Sobic005G110427 Sobic008G025900--Sobic008G049701 Sobic004G121000--Sobic005G142200 Sobic004G121000--Sobic003G436900 Sobic004G121000--Sobic001G240400 Sobic004G121000--Sobic002G224450 Sobic004G121000--Sobic004G200866 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic004G121000--Sobic001G305400 Sobic004G121000--Sobic005G221425 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic004G121000--Sobic004G317600 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic004G121000--Sobic002G221200 Sobic001G022100--Sobic008G025900 Sobic009G137800 Sobic009G137800 Sobic001G022100--Sobic009G137800 Sobic001G022100--Sobic005G096800 Sobic001G022100--Sobic002G400900 Sobic001G022100--Sobic005G139800 Sobic001G022100--Sobic005G221425 Sobic001G022100--Sobic002G224450 Sobic001G022100--Sobic002G166600 Sobic003G185200 Sobic003G185200 Sobic001G022100--Sobic003G185200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.