Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G374500.7,Sobic.003G374500.10,Sobic.003G374500.5,Sobic.003G374500.9,Sobic.003G374500.4,Sobic.003G374500.6,Sobic.003G374500.8
Synonym Sb03g041490
Functional annotation pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5XRC7
Pfam PF13812 PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF542
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G05600 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g37140.2,LOC_Os02g37140.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039367
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G374500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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7 Sobic.001G262900 hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, putative, expressed K10801: methyl-CpG-binding domain protein 4
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12 Sobic.004G152601 - -
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14 Sobic.004G204400 OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.003G060300 endoplasmic oxidoreductin-1 precursor, putative, expressed K10950: ERO1-like protein alpha
16 Sobic.009G121750 - -
17 Sobic.003G432900 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G101700 - -
19 Sobic.003G429500 - -
20 Sobic.001G287101 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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