Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G204400.2,Sobic.004G204400.1
Synonym Sb04g025060
Functional annotation OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5XX48
Pfam PF12937
Panther DB PTHR33207 PTHR33207:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g08620.1 : OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G052480.1
Wheat TraesCS1D02G092800 , TraesCS1A02G100200 , TraesCS1A02G100200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
2 Sobic.003G266700 expressed protein -
3 Sobic.002G224450 - -
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5 Sobic.008G065400 - -
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9 Sobic.002G400900 expressed protein -
10 Sobic.004G132100 ATP binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G429500 - -
12 Sobic.005G142200 expressed protein -
13 Sobic.004G200866 - -
14 Sobic.001G278600 - -
15 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
16 Sobic.009G121750 - -
17 Sobic.005G043800 transporter family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G431200 - -
19 Sobic.007G199300 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
20 Sobic.010G033700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G204400 Sobic004G204400 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic004G204400--Sobic004G121000 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic004G204400--Sobic003G266700 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic004G204400--Sobic002G224450 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic004G204400--Sobic003G366850 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic004G204400--Sobic008G065400 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic004G204400--Sobic003G374500 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic004G204400--Sobic003G436900 Sobic001G262900 Sobic001G262900 Sobic004G204400--Sobic001G262900 Sobic002G400900 Sobic002G400900 Sobic004G204400--Sobic002G400900 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic004G121000--Sobic005G142200 Sobic004G121000--Sobic003G436900 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic004G121000--Sobic001G240400 Sobic004G121000--Sobic002G224450 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic004G121000--Sobic004G200866 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic004G121000--Sobic001G305400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic004G121000--Sobic005G221425 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic004G121000--Sobic004G317600 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic004G121000--Sobic002G221200 Sobic003G266700--Sobic008G065400 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G266700--Sobic001G278600 Sobic003G266700--Sobic004G121000 Sobic003G311200 Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G311200 Sobic003G266700--Sobic003G366850 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic003G266700--Sobic003G429500 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic003G266700--Sobic008G045600 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic003G266700--Sobic010G101700 Sobic003G266700--Sobic004G317600 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic002G224450--Sobic008G025900 Sobic002G224450--Sobic004G121000 Sobic002G224450--Sobic001G240400 Sobic002G224450--Sobic005G221425 Sobic001G287101 Sobic001G287101 Sobic002G224450--Sobic001G287101 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic002G224450--Sobic005G139800 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic002G224450--Sobic009G209800 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic002G224450--Sobic005G110427 Sobic002G224450--Sobic003G436900 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic003G366850--Sobic009G101600 Sobic008G065400--Sobic001G278600 Sobic008G065400--Sobic002G431200 Sobic008G065400--Sobic003G366850 Sobic008G065400--Sobic003G374500 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic005G079700 Sobic008G065400--Sobic003G266700 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic008G065400--Sobic008G106400 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic002G171400 Sobic008G065400--Sobic003G429500 Sobic003G374500--Sobic008G065400 Sobic003G374500--Sobic001G278600 Sobic003G374500--Sobic003G366850 Sobic007G037301 Sobic007G037301 Sobic003G374500--Sobic007G037301 Sobic003G374500--Sobic005G079700 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic003G374500--Sobic001G140200 Sobic003G374500--Sobic001G262900 Sobic003G374500--Sobic003G266700 Sobic003G374500--Sobic002G431200 Sobic003G436900--Sobic005G142200 Sobic003G436900--Sobic004G121000 Sobic003G436900--Sobic001G240400 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic003G436900--Sobic010G144000 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic003G436900--Sobic005G061100 Sobic003G436900--Sobic002G221200 Sobic003G436900--Sobic001G305400 Sobic003G436900--Sobic009G101600 Sobic003G436900--Sobic004G317600 Sobic001G262900--Sobic001G287101 Sobic001G262900--Sobic007G037301 Sobic001G262900--Sobic003G374500 Sobic001G262900--Sobic004G121000 Sobic001G262900--Sobic002G224450 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic001G262900--Sobic004G152601 Sobic001G262900--Sobic003G436900 Sobic001G262900--Sobic003G366850 Sobic004G332000 Sobic004G332000 Sobic001G262900--Sobic004G332000 Sobic002G400900--Sobic001G287101 Sobic002G400900--Sobic002G224450 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic002G400900--Sobic004G005400 Sobic005G096800 Sobic005G096800 Sobic002G400900--Sobic005G096800 Sobic002G400900--Sobic005G110427 Sobic002G400900--Sobic003G366850 Sobic002G400900--Sobic008G025900 Sobic002G400900--Sobic004G121000 Sobic001G022100 Sobic001G022100 Sobic002G400900--Sobic001G022100
Octagon: transcription factors


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