Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G043800.1
Synonym Sb05g003610, ATPMT1, PMT1
Functional annotation transporter family protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PQ41
Pfam PF07690
Panther DB PTHR23500 PTHR23500:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016021; integral component of membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G16120 : polyol/monosaccharide transporter 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g32940.1 : transporter family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054423
Brachypodium KQK20769
Barley HORVU5Hr1G106160.1 , HORVU5Hr1G106160.2
Wheat TraesCS5A02G440100 , TraesCS5B02G443900 , TraesCS5D02G447300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G121000 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
2 Sobic.010G164350 - -
3 Sobic.001G261480 - K01489: cdd, cytidine deaminase
4 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
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6 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G142200 expressed protein -
8 Sobic.010G144000 AP-3 complex subunit delta, putative, expressed K12396: AP-3 complex subunit delta
9 Sobic.003G366850 - -
10 Sobic.008G150200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G200866 - -
12 Sobic.007G005000 expressed protein -
13 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G224450 - -
15 Sobic.004G317600 pathogenesis-related Bet v I family protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G436900 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G271100 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
18 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G132150 - -
20 Sobic.005G061100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G043800--Sobic004G121000 Sobic010G164350 Sobic010G164350 Sobic005G043800--Sobic010G164350 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic005G043800--Sobic001G261480 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G043800--Sobic008G045600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic005G043800--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G043800--Sobic002G221200 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G043800--Sobic005G142200 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G043800--Sobic010G144000 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic005G043800--Sobic003G366850 Sobic004G121000--Sobic005G142200 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic004G121000--Sobic003G436900 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic004G121000--Sobic001G240400 Sobic002G224450 Sobic002G224450 Sobic004G121000--Sobic002G224450 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic004G121000--Sobic004G200866 Sobic004G121000--Sobic001G305400 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic004G121000--Sobic005G221425 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic004G121000--Sobic004G317600 Sobic004G121000--Sobic002G221200 Sobic001G271100 Sobic001G271100 Sobic010G164350--Sobic001G271100 Sobic010G164350--Sobic005G043800 Sobic010G173201 Sobic010G173201 Sobic010G164350--Sobic010G173201 Sobic004G132150 Sobic004G132150 Sobic010G164350--Sobic004G132150 Sobic010G164350--Sobic001G261480 Sobic006G045700 Sobic006G045700 Sobic010G164350--Sobic006G045700 Sobic008G055432 Sobic008G055432 Sobic010G164350--Sobic008G055432 Sobic010G120700 Sobic010G120700 Sobic010G164350--Sobic010G120700 Sobic004G233300 Sobic004G233300 Sobic010G164350--Sobic004G233300 Sobic001G261480--Sobic001G305400 Sobic001G261480--Sobic002G221200 Sobic001G261480--Sobic001G240400 Sobic001G261480--Sobic004G121000 Sobic001G261480--Sobic004G200866 Sobic001G261480--Sobic003G366850 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic001G261480--Sobic005G117801 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic001G261480--Sobic009G209800 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic001G261480--Sobic003G031750 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic008G045600--Sobic007G005000 Sobic008G045600--Sobic005G142200 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic008G045600--Sobic005G061100 Sobic008G045600--Sobic003G436900 Sobic008G045600--Sobic004G121000 Sobic008G045600--Sobic010G144000 Sobic008G045600--Sobic004G317600 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic008G045600--Sobic009G101600 Sobic008G045600--Sobic001G305400 Sobic001G305400--Sobic002G221200 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic001G305400--Sobic008G091900 Sobic001G305400--Sobic001G240400 Sobic001G305400--Sobic005G117801 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic001G305400--Sobic002G056100 Sobic001G305400--Sobic009G209800 Sobic001G305400--Sobic005G142200 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic001G305400--Sobic002G060500 Sobic001G305400--Sobic001G261480 Sobic002G221200--Sobic001G305400 Sobic002G221200--Sobic008G091900 Sobic002G221200--Sobic001G240400 Sobic002G221200--Sobic005G117801 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic002G221200--Sobic001G253100 Sobic002G221200--Sobic009G209800 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic002G221200--Sobic008G036500 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic002G221200--Sobic002G062300 Sobic002G221200--Sobic003G031750 Sobic005G142200--Sobic009G101600 Sobic005G142200--Sobic004G121000 Sobic005G142200--Sobic003G436900 Sobic005G142200--Sobic002G060500 Sobic005G142200--Sobic004G200866 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G142200--Sobic009G026400 Sobic005G142200--Sobic001G305400 Sobic005G142200--Sobic002G221200 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G142200--SobicK010000 Sobic010G144000--Sobic003G436900 Sobic010G144000--Sobic005G142200 Sobic010G144000--Sobic002G221200 Sobic010G144000--Sobic004G317600 Sobic010G144000--Sobic004G121000 Sobic010G144000--Sobic001G240400 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic010G144000--Sobic004G092300 Sobic010G144000--Sobic001G305400 Sobic010G144000--Sobic008G045600 Sobic003G366850--Sobic004G121000 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic003G366850--Sobic008G065400 Sobic003G366850--Sobic001G261480 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic003G366850--Sobic003G429500 Sobic003G366850--Sobic004G200866 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic003G366850--Sobic002G431200 Sobic001G278600 Sobic001G278600 Sobic003G366850--Sobic001G278600 Sobic003G366850--Sobic005G142200 Sobic003G366850--Sobic009G101600
Octagon: transcription factors


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