Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G271100.1,Sobic.001G271100.2
Synonym Sb01g026610
Functional annotation basic helix-loop-helix, putative, expressed
UniProt A0A1B6QLD3 , A0A1B6QLB8
Pfam PF00010
Panther DB PTHR12565 PTHR12565:SF100
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G68810 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g24490.1,LOC_Os08g33590.1 : basic helix-loop-helix family protein, putative, expressed,basic helix-loop-helix, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001683 , Zm00025a031136 , Zm00025a013894 , Zm00025a005944
Brachypodium KQJ98388
Barley -
Wheat TraesCS4B02G217400 , TraesCS4D02G217700 , TraesCS4A02G087000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.007G071950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G271100 Sobic001G271100 Sobic010G164350 Sobic010G164350 Sobic001G271100--Sobic010G164350 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic001G271100--Sobic005G043800 Sobic010G173201 Sobic010G173201 Sobic001G271100--Sobic010G173201 Sobic010G120700 Sobic010G120700 Sobic001G271100--Sobic010G120700 Sobic010G128500 Sobic010G128500 Sobic001G271100--Sobic010G128500 Sobic008G055432 Sobic008G055432 Sobic001G271100--Sobic008G055432 Sobic007G130200 Sobic007G130200 Sobic001G271100--Sobic007G130200 Sobic006G045700 Sobic006G045700 Sobic001G271100--Sobic006G045700 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic001G271100--Sobic010G068200 Sobic010G164350--Sobic001G271100 Sobic010G164350--Sobic005G043800 Sobic010G164350--Sobic010G173201 Sobic004G132150 Sobic004G132150 Sobic010G164350--Sobic004G132150 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic010G164350--Sobic001G261480 Sobic010G164350--Sobic006G045700 Sobic010G164350--Sobic008G055432 Sobic010G164350--Sobic010G120700 Sobic004G233300 Sobic004G233300 Sobic010G164350--Sobic004G233300 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G043800--Sobic004G121000 Sobic005G043800--Sobic010G164350 Sobic005G043800--Sobic001G261480 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G043800--Sobic008G045600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic005G043800--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G043800--Sobic002G221200 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G043800--Sobic005G142200 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G043800--Sobic010G144000 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic005G043800--Sobic003G366850 Sobic010G173201--Sobic010G068200 Sobic010G173201--Sobic010G120700 Sobic010G173201--Sobic010G164350 Sobic010G173201--Sobic001G271100 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic010G173201--Sobic004G196500 Sobic010G173201--Sobic008G055432 Sobic010G173201--Sobic007G130200 Sobic010G057700 Sobic010G057700 Sobic010G173201--Sobic010G057700 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic010G173201--Sobic007G129401 Sobic010G120700--Sobic010G173201 Sobic010G120700--Sobic010G068200 Sobic005G173366 Sobic005G173366 Sobic010G120700--Sobic005G173366 Sobic008G055366 Sobic008G055366 Sobic010G120700--Sobic008G055366 Sobic010G120700--Sobic008G055432 Sobic003G416100 Sobic003G416100 Sobic010G120700--Sobic003G416100 Sobic010G120700--Sobic007G129401 Sobic010G120700--Sobic004G196500 Sobic010G120700--Sobic010G164350 Sobic010G128500--Sobic005G043800 Sobic010G128500--Sobic001G271100 Sobic010G128500--Sobic010G164350 Sobic007G071950 Sobic007G071950 Sobic010G128500--Sobic007G071950 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic010G128500--Sobic010G144100 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic010G128500--Sobic004G152601 Sobic010G128500--Sobic010G144000 Sobic010G128500--Sobic005G142200 Sobic001G262900 Sobic001G262900 Sobic010G128500--Sobic001G262900 Sobic008G055432--Sobic008G055366 Sobic008G055432--Sobic007G071950 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic008G055432--Sobic005G141801 Sobic001G272532 Sobic001G272532 Sobic008G055432--Sobic001G272532 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic008G055432--Sobic005G055150 Sobic010G225226 Sobic010G225226 Sobic008G055432--Sobic010G225226 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic008G055432--Sobic006G009400 Sobic008G055432--Sobic010G057700 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic008G055432--Sobic005G221425 Sobic007G130200--Sobic010G173201 Sobic007G130200--Sobic001G271100 Sobic007G130200--Sobic010G164350 Sobic007G130200--Sobic010G120700 Sobic010G119500 Sobic010G119500 Sobic007G130200--Sobic010G119500 Sobic007G130200--Sobic008G055366 Sobic007G130200--Sobic008G055432 Sobic007G226600 Sobic007G226600 Sobic007G130200--Sobic007G226600 Sobic007G130200--Sobic010G068200 Sobic006G045700--Sobic004G132150 Sobic006G045700--Sobic005G043800 Sobic006G045700--Sobic010G164350 Sobic010G246900 Sobic010G246900 Sobic006G045700--Sobic010G246900 Sobic006G048700 Sobic006G048700 Sobic006G045700--Sobic006G048700 Sobic008G025900 Sobic008G025900 Sobic006G045700--Sobic008G025900 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic006G045700--Sobic005G110427 Sobic010G100366 Sobic010G100366 Sobic006G045700--Sobic010G100366 Sobic006G045700--Sobic005G141801 Sobic010G068200--Sobic010G173201 Sobic010G068200--Sobic007G129401 Sobic010G068200--Sobic004G196500 Sobic010G068200--Sobic010G120700 Sobic010G068200--Sobic005G173366 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic010G068200--Sobic009G026400 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic010G068200--Sobic005G043400 Sobic010G068200--Sobic003G416100 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic010G068200--Sobic002G060500
Octagon: transcription factors


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